3、项目的申报户和实际建池户存在不相符。农村沼气国债项目申报与具体实施相差一段时间，在项目实施时会出现实际建池户与申报农户不相符，有的甚至不在同一个村内。这给国债项目验收带来一定困难，直接影响了农村沼气推广工作。近年来农村人口流动量很大，异地开发、异地转移，有的为了给小孩找一所好一点的学校，远离家乡在城郊的农田大棚种香菇、木耳等。这些原因直接造成申报农户与实际建池户不相符。给项目实施带来一定的困难，制约着农村沼气的推广速度。
4、建池成本的相对不均。因各项目户所处的位置不同，虽然得到政府的补贴是一样的但建池原材料的成本却相差极大，而乡村里又拿不出相应的配套资金。这就会出现虽有满腔的建池热情，却望而却步，农户无法承担过多的自筹资金，极大阻碍了农村沼气推广。据调查，在云和镇范围内3立方的沙子、石子各一车需500元，而在黄源、云丰、大湾、沙铺等乡镇每车砂石料将增加200元的运输成本，特别是像黄源乡水坳头村，每户建一沼气池（包括三改）需拿出4500元左右，减去政府补贴1300，农户自筹3200元，村里的经济薄弱无法拿出来补贴。与云和镇农户相比建一沼气池相差1000多元，因此有些农户只能望而叹兴。