（五）流通环节监管跟不上，产地检疫难度大。国道209、319和省道229、306线贯穿全州，交通十分便利，贵州、重庆、湖北的牲畜大多数途径我州销往外地，我州的四个省际动物边境检查站虽然在控制动物疫情传播上起到了一定的作用，但由于监管任务重，难度大，很容易通过流通环节引发动物疫情。我州农户养殖方式落后，居住分散，以一家一户的散养为主，并且养殖规模小，管理粗放，产地检疫难以到位。从统计数据看，2007年全州共出栏牲畜188万头（只）,家禽575万羽，多数为自宰自食，上市交易的少，而产地检疫证使用还不到1000本，产地检疫率还达不到5%。
（六）新的疫病又不断出现，给动物防疫工作带来严重的挑战。我州曾是口蹄疫、炭疽、牛出败、气肿疽、狂犬病的老疫区，虽然经多年的努力，疫病得到了一定的控制，但口蹄疫仍有零星发生，狂犬病明显抬头。据调查，从1994年开始连续11年狂犬病0死亡报告病例，到2005年被打破，且呈逐年上升趋势。2005年6例，2006年14例，2007年27例，2008年一季度7例，防疫形势严峻。疑似禽流感、高致性猪蓝耳病等动物疫病在我州时有发生，给本已任务繁重的动物防疫工作带来了更为严重的挑战。
（七）动物防疫经费严重不足，制约动物防疫工作。虽然县、乡防疫站为全额事业单位，但由于县市财政困难，部分县市对州政府第57次常务会议纪要的经费保障措施难以落实到位，主要表现在：一是防疫物资储备、防疫工作经费难以足额保障；二是乡镇站的一些政策性待遇无法到位，只能享受基本工资；三是村级动物防疫员报酬没有得到落实。四是免疫副反应补偿机制不健全，群众和防疫人员矛盾突出。五是动物防疫人员个人防护、医疗保障机制不健全。仅2007年全州开展的动物狂犬病防疫注射，被咬伤的人数多达80余人，用去防疫治疗费用近5万元。
三、主要对策与建议
（一）要进一步理顺兽医管理体制。要严格按照国务院和省委、省政府关于兽医体制改革的要求，尽快将兽医体制改革到位。为此，建议州委常委会召开会议，研究兽医体制改革方案，将州、县动物防疫监督机构改为兽医局，并相应升格，防疫、检疫监督和疾病预防控制分设，同时将乡镇动物防疫站收归县兽医局主管。
（二）要高度重视动物防疫能力建设。动物防疫能力建设是关系到畜牧业发展的基础性长远工程。要从建立动物疫病防治长效机制入手，尽快研究制定动物防疫能力建设规划，因地制宜提出具体目标。当务之急是要抓好县、乡基础设施建设，充分用足国家对西部地区的扶持政策，一是要尽快启动部援项目建设，争取尽早建成发挥作用。二是继续对县市实行站房建设目标管理责任制，建议州政府对站房建设给予适当补贴和奖励，减免乡镇站房建设的税费，力争用3-5年时间完成乡镇站站房建设任务。
（三）要不断充实基层动物防疫人员，提高其政治素质和业务素养。要采取灵活多样的用人机制，鼓励在校优秀大中专毕业生到乡镇动物防疫站工作，为他们创造良好的成长环境，可以采用选调特困村支部书记的优惠政策。同时，对现有的非专业人员进行定期培训，以提高他们的政治素质和业务水平。
（四）要进一步健全法制体系，提高全民的法律意识。目前，国家出台了《重大动物疫情应急条例》和《中华人民共和国动物防疫法》，要尽快出台相应的配套法律法规，例如《中华人民共和国动物防疫法实施条例》、《狂犬病防治条例》等，使之在实际工作中更具可操作性。同时，加大法律法规的宣传力度，使广大养殖户和动物防疫人员学法、懂法、守法。
（五）要加强检疫监督力度，严防重大动物疫情发生。要加强对牲畜交易市场、定点屠宰场、农贸市场的检疫监督力度，严防重大动物疫情发生，确保动物源性食品安全和人们身体健康，打击各种违反动物防疫法律法规的违法行为。