第二阶段：分析检查(2009年5月上旬至6下旬)
本阶段是将学习实践活动从思想层面引向实践层面的重要阶段。主要任务是按照“重在总结经验教训、重在完善发展思路”的要求，抓实找准突出问题、召开专题民主生活会、开展分析评议3个环节，具体做好五项工作：
（一）搞好自检自查
各单位要结合实际，组织党员干部进行自检自查。党员领导干部要做到“六查六看”：一查思想是否封闭保守、消极懈怠，看科学发展意识、实干精神强不强；二查以人为本、全面协调发展的意识牢不牢，看发展的思路宽不宽；三查科学发展的差距和不足，看科学发展的实效好不好；四查工作思维方式，看统筹兼顾是否到位，科学发展的举措是否到位；五查服务意识强不强，看服务措施是否落实、排忧解难是否到位；六查科学发展的制约因素，看哪些政策制度需要清理完善。一般党员干部要做到“三查一看”：一查落实科学发展观的主动性和自觉性；二查立足本职为本单位经济社会发展所作的贡献；三查为民办实事、办好事的情况。看自己的认识和工作是否符合科学发展观的要求。
（二）广泛征求群众意见
在解放思想大讨论活动征求意见的基础上，采取拓宽渠道“群众提”、座谈走访“当面问”、问卷调查“多方求”、总结正反经验“对比找”等方法，对照“转变思想观念、解决突出问题、创新体制机制、促进科学发展、构建和谐xx”的要求，进一步找准制约本地本单位科学发展的突出问题、影响社会和谐稳定的突出问题、党性党风党纪方面群众反映强烈的突出问题。征求到的意见建议，要如实向领导班子和领导干部本人反馈。
（三）撰写领导班子分析检查报告
在全州畜牧业产业化专题调研、广泛征求意见的基础上，领导班子要重点围绕贯彻落实科学发展观，增强凝聚力、创新力、执行力等方面进行深入分析，形成领导班子贯彻落实科学发展观情况的分析检查报告。分析检查报告要充分运用深入学习调研和解放思想大讨论的成果，充分反映本地本单位贯彻落实科学发展观的情况，查摆存在的突出问题，分析主客观原因特别是主观原因。同时，要深入分析当前国际经济环境对本地本单位带来的挑战和不利影响，明确进一步科学发展的总体思路、主要举措和努力方向。主要负责同志要认真履行职责，全程主持分析检查的撰写。要突出检查分析问题、理清科学发展思路这两个重点，避免将分析检查报告写成工作总结。分析检查报告初稿形成后，要以适当方式广泛听取各方意见，经党委（党组）扩大会议充分讨论后，进一步修改完善。
（四）召开专题民主生活会和组织生活会
领导班子要召开以贯彻落实科学发展观为主题的专题民主生活会。会前，领导班子及成员要认真拟定发言提纲，做好充分准备。要相互谈心、交换看法，做到“四谈”：主要领导与班子成员谈、党员领导干部与分管部门负责人谈、支部书记与党员谈、党员与单位群众谈。会上，要做到“三检查三分析”：检查是否准确理解科学发展观的深刻内涵，分析学习实践科学发展观的自觉性；检查工作中存在的突出问题，分析结合实际贯彻落实科学发展观的坚定性；检查现行不符合科学发展的体制机制，分析制约科学发展的局限性，统一领导班子的思想认识，明确今后的整改措施。各党支部要组织全体党员召开专题组织生活会，按照科学发展观的要求，分析查找自身的差距和不足，明确努力方向，提出整改措施。党员领导干部既要参加本单位领导班子民主生活会，又要参加所在党支部的组织生活会。对民主生活会和组织生活会，要严格要求、保证质量，注意保护党员干部的积极性。
（五）组织群众评议
要组织党员、群众评议领导班子的分析检查报告，着重从对科学发展观认识深不深、查找问题准不准、原因分析透不透、发展思路清不清、工作措施可行不可行等方面进行评议。评议可根据实际情况采取召开座谈会、评议大会或书面评议等方式进行。参加评议人员既要有本地本单位的党员群众，又要注意吸收熟悉情况、有较强参政议政能力的“两代表一委员”、专家学者、基层单位代表和服务对象代表参加。领导班子分析检查要征求上级主管部门、同级相关部门和本系统下级单位的意见。修改完善后的分析检查要在参加评议人员范围内以书面形式公开。