另外，在预算监督方面，首先必须严格按照相关标准规定执行，如财务部门和所对应的主管部门，要在每年的季末对预算计划执行情况进行考核，一旦出现相关部门不按照规定执行预算计划，要考虑删减预算额度。其次，事业单位要在每个月月初提供上个月各项目支出指标的达成情况，并以部门和项目类别进行分门别类，同时将支出金额进行拆分，分为当年支出金额和往年支出金额，然后对项目结余金额也进行相应的拆分，同样分为当年结余金额和往年结余金额，这样才能更形象、更具体、更全面地呈现各支出项目的预算执行情况，为单位管理者的计划调整提供可靠依据。最后，事业单位要结合自身实际构建相应的预算监控体系，并进行常态化运营。当会计核算工作结束后，相关业务部门能够随时查询各部门所承担支出项目的预算执行情况和详细的收支记录，对单位内部的经济活动进行全程跟进与监督，并对存在的问题进行及时解决，以确保所有支出项目预算执行的规范性和高效性。
三、加强部门考核，完善激励体制
科学合理、行之有效的考评机制和激励体制，可以充分调动职工工作积极性，能够有效强化职工的责任意识和集体归属。所以，完善绩效考评和激励机制，对提高财务预算管理效率具有非常重要的作用。具体来讲，为了实现事业单位的内部公正公平，不仅要完善部门的实时考核机制，而且要完善个人的综合考核与激励体制。
事业单位在部门考核和个人考核方面，均采用实时考核和综合考核相结合的方法。在资金的使用过程中，对部门和个人的资金使用情况实时考核，并反馈和记录考核结果，出现偏差，及时提醒，预算管理部门及时有效的提出相关方面的提高方案。年末预算结束后，对预算的执行过程中每项资金的使用效率和使用过程引起的效益进行综合的考核，对考核过程中表现良好的部门和个人给予鼓励和一定的奖励政策，事业单位的这种考核方式，既能够保证整体评价的公正性，又能够体现工作人员平时工作的情况，保证考核办法的合理性。这样，实时反映了预算的执行过程，能够有效地提升预算执行的质量。
作为一种重要的管理方式，在事业单位中推行全面预算管理，对于合理资金的运转过程和提高资金使用效率来说，是极其重要的举措。制定符合实际应用的预算项目以及严谨的操作状态外加有效的监督方案和绩效考核措施，可以顺利保证单位的预算目标完成，同时，更进一步改革国有资源，以确保资产的高效化安排和高效率实施。因此，如上所述预算管理应该被放到较重心的工作地位，改变行政管理观念，促进资源和相关资金的利用率以达到最大化的收益。
事业单位代表政府在社会公共服务中发挥着越来越重要的作用，其预算管理一直受到各界的高度关注。本文深入研究了事业单位预算管理中发生的一系列问题，分析了这些问题产生的根源，并提出了自己的一些见议或对策，通过这些见议或对策，我认为可以切实改善并提高事业单位预算管理水平，防止一些问题的发生。 新《预算法》的施行，把建立现代预算管理制度提上日程，也为以后研究指明了方向，既要重视预算的程序管理，还要强调预算绩效管理，努力探讨在预算管理中如何以最小的经济支出取得最好的社会经济效益。