（四）以“良法善治”研究为重点
边疆行政管理和边疆的发展与稳定素以复杂性、重要性著称于世，而政府的“良法善治”则是使这一艰巨、复杂任务得以顺利完成的唯一途径。为此，在边疆省、区行政管理理论的系统研究中应强化依宪行政、依法行政的法治意识，遵循《宪法》原则，以《民族区域自治法》的细化及与之配套的地方性法规、自治条例、单行条例的贯彻执行为研究的重中之重，努力探究“良法”制定与施行、监督和反馈、修正的回路，以及完善用“良法”为“善治”奠定基础的法理。首先应在现行“良法”框架下积极探究实践中已成熟的边疆政策的法制化模式，进一步完善法制体系并增强其系统性、配套性和可操作性，为政府依法行政提供坚实的法理支撑。同时深入探究系统、综合的治理机制，为切实推进“法治国家、法治政府、法治社会一体建设”①，政府及时、有效妥善解决民族、宗教问题和完善边政管理、促进区域发展与稳定提供有效的理论范式。此外，还应不断探析边疆政策和有关法律、法规、自治条例、单行条例的高位推动、层级性和多属性运行，以及在央地间、地地间、部门间的协同落实，为推进“善治”提供理论导向。
（五）以系统论为基本方法
由于边疆省、区行政管理具有明显的特殊性、开放性、复杂性、整体性、关联性和动态平衡性等特征，以及相关因素共性和个性相互交织、不断转化的现实存在，从而其行政管理理论的创新对研究理念和方法都具有更高的要求。为此，首先应树立系统化研究理念，拓宽理论研究视野，构建逻辑严谨的整体性研究框架。并强化政治意识、战略意识和大局意识，全面把握新形势下促进民族发展、巩固边防、防止宗教极端思想和加强经济、政治、文化与社会治理的特点和规律，不断拓展研究范畴和研究内容。同时应摒弃重现实弃历史、重局部轻整体、重静态轻动态的研究模式，将宏观与微观有机结合起来，以现实与历史、局部与整体、要素与系统、静态与动态有机统一的系统论为基本方法，从时空、纵向、横向等视角全面、准确地把握住行政管理的多维要素。在此基础上进行深入研究、分析和预测，为健全科学、系统的边疆省、区行政管理理论体系和构建中国特色社会主义边疆行政管理学学科体系奠定方法论基础。