（一）强化资产折旧的管理
现阶段，收付实现制被普遍地应用于我国大部分行政事业单位会计核算中，尤其是固定资产的核算。在这一制度下，采购、安装固定资产的费用都计入支出，不计提折旧，固定资产的实际价值难以被准确地反映，[5]不利于行政事业单位固定资产的高效管理。现认为，固定资产在采购环节与安装环节都应计入“固定资产”会计科目。借鉴企业固定资产会计核算方式，有助于事业单位进一步了解各项支出，准确认知固定资产的实际价值，减少重复购置资产的现象。
（二）科学采用权责发生制
国外对于权责发生制的研究较早，部分国家已经完全实行权责发生制，但是絕大多数国家在改革过程中难以避免地出现了成本高、执行难的问题，只有少数国家取得了显著的成效伴随着预算会计制度的改革，我国应对传统的收付实现制进行变革，科学引入权责发生制，即收付实现制与权责发生制并用，可以根据每个行政事业单位的具体情况合理调整，即行政事业单位月末或季末的会计核算可以采用收付实现制，但年末核算需要采用权责发生制，并提供相关财务报告。与此同时，事业单位可以设置一定数量的资产负债账户，这些账户统一采用权责发生制进行核算。[6]部分特殊性的支出，如资本性支出需完善社会资产，会计核算时需要“两步走”，预算的收入与支出采用收付实现制核算，固定资产、产权的变化采用权责发生制。
（三）完善财务报告制度
应建立健全行政事业单位会计报表体系。目前，我国各个行政事业单位缺乏一套标准化、系统化的事业单位会计报表体系，会计报表无法全面反映事业单位的客观情况。部分行政事业单位会计核算方式不合理，会计报表并未全面反映事业单位资产、负债等情况。针对这一问题，事业单位会计在月末、季末时可以不结转收支余额，年末进行统一结转。统一事业单位收入支出表的格式，科学划分会计科目，进一步细化，提升行政事业单位财务会计报表的公开度。附注是会计报表的重要内容，建议事业单位财务管理基本情况应该被纳入到会计报表附注中，社会公众可以通过会计报表了解更多的信息，更好地对我国行政事业单位进行监督。
综上所述，预算会计制度改革后，财政部门统一管理预算资金以及其他资金，有助于进一步规范行政事业单位的采购行为，提升预算支出的透明度，有效遏制腐败问题。政府集中采购可以明确财政资金的流向，减少财政资金的浪费，具有重要的现实意义。