基于Ｗｅｂ的ＣＭＬ化学结构搜索方法初探(2)

　　OBConversion conv(&cin，&cout);
　　if(conv.SetInAndOutFormats(“SMI”，“MOL”))
　　{OBMol mol;if(conv.Read(&mol)) ...manipulate molecule conv->Write(&mol);}
　　THOR Server是一后台程序，不允许用户直接对其操作，用户必须通过THOR Client对THOR Server进行操作。用户通过THOR Client将CML转换后的SMILES及CML所在的文档URL、当前访问时间等存入THOR数据库，并以SMILES作为记录的主关键字。本系统根据Daylight提供的THOR-Merlin Toolkit来编写Client。Client通过server来对THOR数据库进行操作。
　　2.4用户界面设计初探
　　用户可以直接输入要检索的化学结构的SMILES码，或者根据提供的JME(JME是由Peter Ertl开发的java applet，用于在网页上直接描绘化学结构)画出要检索的2D化学结构图，并指定结构检索的类型，JME会自动把用户画出的化学结构转化为SMILES码进行检索。
　　
　　3 总结
　　
　　本文提出了一种化学结构搜索引擎的设计方案，针对Web上大量存在的CML表示的化学结构进行检索。但是由于CML出现的时间相对比较晚，Web上还有许多以其它格式存储的化学结构信息，下一步要研究提取与验证Web上以其它格式表示的化学结构信息，以便对更多的化学结构进行检索。
　　
　　参考文献：
　　［1］P. Murray-Rust， H S Rzepa. Chemical Markup，XML and the World—Wide Web. 1. Basic Principles. J. Chem. Inf. Comput. Sci，1999，39(6)：928-942.
　　［2］P. Murray-Rust，H S Rzepa. Chemical Markup，XML and the World—Wide Web. 4. CML Schema. J. Chem. Inf. Comput. Sci，2003，43(3)：757-772.
　　［3］Gkoutos GV， Rzepa HS and P. Murray-Rust. Online validation and comparison of molfile and CML molecular atom-connection descriptors.Internet J Chem，2003，(1).
　　［4］J. Klekota，F. P. Roth，and S. L. Schreiber. Query Chem：a Google-powered web search combining text and chemical structures. Bioinformatics，2006，22(13).