4SCI之不足虽然SCI有其独特的作用，但也有一定的局限性，主要有：
4．1地理名称不清美人对我国的省和市的概念不是很清楚，在查找我国有关机构论文时经常要走弯路，如查江西医学院则要查Jiangxi和Nanchang两个标目才能查全，否则漏检。
4．2单位级别不清如江西医学院第一附属医院心血管内科，按我们的理解，一级标目是中国，二级标目是 Nanchang，三级标目是JiangxiMedcoll，四级标目是一附院，五级标目是心血管内科，而在SCI中，四级作为三级，JiangxiMedColl成了一附院的下级单位，造成查找的困难。
4．3收录中文文献有限SCI收录期刊3000多种而中文期刊只有10几种，医药学只有2种，实在不能反映我国医学科技工作的研究水平。
4．4作者姓名雷同由于作者姓名首字母缩写，因此，有些不同姓名但音相同，在查找时就比较麻烦，如“LiL”可以是李丽，也可以是李力，需看到详细的信息才能确定是否就是你要找的那位作者。SCI虽然有其不足，但仍不失为医学及药学科研工作者的好助手，在SCI中能够找到大量的医药学信息，与美国的《医学索引》(IM)相比，IM收录期刊3091种，收录我国期刊42种(包括台湾省9种，香港1种)，前者收录医学期刊虽少，但可以看出论文之间的引用和被引用关系，可以掌握有关国家乃至机构的科研动向和进展，了解某位专家学者的学术水平及造诣。