随着市场经济体制的建立和完善，现行乡村财务管理模式也得到某些完善，但改革还不系统，许多根本性问题还未根本改变，特别是与农村税费改革相适应的乡村财务管理模式还有相当距离，主要表现如下：
第一，体制不顺，条块分割，不利乡村财务管理。对乡村的财务管理系统不统一，出现了两个部门管理，即乡财政所和乡经管站，而这两个部门分别归属县财政局和县农经局分别管理，这种现状造成对乡村财务管理不能形成统一领导而形成条块分割。长期以来乡财政所与乡农经站对村级财务管理各自为政。为了各自利益，凡对本单位有利的争着管，无好处的互相推，甚至互相扯皮，形成对村级财务监管盲区。县业务主管局对县到乡垂直管理站所的财务，由于面广管理难到位，加上乡级无权对这些直管单位进行有效财务监管，形成资金运转无约束，致使财务混乱，违纪现象时有发生。
第二，“村帐乡代管”流于形式，不能起加强村级财务管理的作用。“村帐乡代管”的工作由乡农经站负责。由于他们人员少，业务素质不高，如无会计证上岗现象仍然存在，这必然造成会计业务操作不规范；管理经费无正常渠道，主要靠收取村级财务审计费和代理记帐服务费来维持运转，在加强村级财务管理中不敢坚持原则，怕得罪村干部断了自己的财路，造成违纪违规现象，如白条列收列支现象常常发生，坐收坐支现象严重，大多数村把当月收入花掉后再到管理中心报帐，管理中心只是将收支整理后分类记账、编报表，成了村里的记账员，财务管理职能严重弱化。由于村干更换频繁造成会计人员也更换频繁，会计人员交接不及时、不合规，造成离任几年后不交账也无法审核，村级无证上岗的会计就更多了，会计基础工作很不规范。
第三、乡级财务支出预算约束不严，年初预算人大会通过的只到大项，无细项。具体执行时还是领导说了算。在执行上绕过人大监督。财政预算成了一纸空文。村级财务收支基本无预算。
第四、村级会计基础工作不规范，乱收乱支现象仍然时有发生，如乱发乱补现象无法杜绝，白条列收列支现象在村级财务管理中常常发生，原始凭证审核审批不规范，记帐不日清月结、报表不及时。以上问题充分说明，目前乡村财务管理模式不转变，问题还将继续，甚至造成乡村财务管理混乱。
（三） 深化改革，实行会计集中核算
1、实行会计集中核算改革必须坚持的原则。
〔1〕坚持统一管理，分户核算原则。集中管理会计业务，是指乡村财务管理必须归口乡财政所统一进行管理，这是现行法律法规明确规定的，这有利于防止乡村财务管理各自为政，政出多门而造成的混乱。成立会计核算中心负责乡村财务会计工作；分户核算则是指在各单位分别承担经济责任和法律责任的条件下，分别核算各单位财务收支。
〔2〕坚持物质利益原则。实行乡村财务收支归口管理时要确保各单位资金所有权不变、财务自主权不变，调动他们依法理财的积极性。
〔3〕坚持经济核算原则。各单位在安排财务收支时必须认真审核其合法性，讲究经济效益，改善经营管理。
〔4〕坚持预算、决算管理原则。乡行政事业单位财务收支必须编制预算，要经乡人大会批准后才能执行，其执行情况和及结果必须经乡人大会审核批准；村级财务收支必须编制预算计划，经村民代表大会同意后才能执行，实行民主理财，执行情况及结果必须经村民代表大会审核批准。
2、集中会计核算改革必须改善的外部条件。
〔1〕法律环境。乡村财务归口乡财政所管理，实行会计集中核算，还缺少法律法规明确支持。例如：虽然《会计法》、《〈湖南省乡镇财政管理条例〉释义》以及《财政部关于〈村合作组织财务制度（试行）〉》明确规定财政所在乡村财务管理中的领导地位，但与省农办、省财政厅、省农村税改办《关于进一步规范村级财务管理的意见》中规定村级会计人员必须接收县乡农经部门管理考核、集体资金必须由农经站监督管理相矛盾，因此要完善乡村财务管理模式还需要取得法律法规更进一步完善，争取法律法规的明确支持。