可以使得两者均有所侧重。注册会计师要先对企业的内部控制自我评价成果进行评估，以此来了解评价结果利用的可行性和可利用程度。
而现实情况是审计人员往往着眼于现实以及企业利益的考虑，在不能够进行全方位、全过程的评价与监督之前，以及设计信息出现反馈之后，由于种种原因不能做出准确的审计动态的把握，绝大多数依赖内部评价结果，同时对于内部审计忽视的问题也可能会注意不到。
2.注册会计师胜任能力欠缺
内部控制审计属于注册会计师的一项鉴证业务，这就对会计师有了进一步的要求，客观上要求会计师要不断的加强自身的内部控制方面的知识的学习，从而提升自己的职业胜任的能力。现今随着社会的发展，企业面临绝大的挑战，对于内部控制审计的要求也在不断的提升，所以对于注册会计师的要求也在不断的提升。对于企业内部来说。注册会计师需要熟悉企业的组织构架的内部控制等，同时也要对这些进行一定的评价，由于这些内部控制涉及的层面非常的广泛，再加上庞杂的控制环境等，所以相应的评价工作会非常的困难，无疑对于注册会计师是一项巨大的心理以及业务素质提升的挑战。我们知道注册会计师的重要业务就是财务报表，就目前而言对于内部控制也只是限于财务报告上的控制，提升到设计的高度一般还是没有达到标准的。目前无论是我国还是国外在非财务内控方面的经验都是具有一定的局限的，尤其是不具有执业经验供注册会计师借鉴。
3.内部控制审计质量控制系统的匮乏
随着内部控制审计市场的发展，更多的会计事务所开始倾向于企业的内部控制审计业务，这些业务是与其以往的法定性或是非法定性的业务有所区别的，所以说体系还不成熟，还未形成专门的内部质量控制体系，其结果是审计质量让人怀疑、质量失控，这在一定程度上无疑会增加审计工作的风险。
三、内部控制审计完善的几点建议 1.建立日常性的内部控制评价体系
内部控制要随着企业的发展而变化，建立相应的日常性的评价体系，进行自上而下的建立部门自我评价、企业整体评价、内部审计监督评价三个方面的评价体系，自我评价以及企业的整体的评价可以使得相关人员获得一定的经验，同时及时有效的修正行动，增强企业内部对于风险的控制能力。为了加强评价体系，还要配以问责制来推动体系的建立及实施。
2.加强注册会计师综合素质的培养，尤其是非财务审计方面 对于内部控制审计而言，它与过去的财务报表审计是不同的。就注册会计师方面来说，它所要做的渊源多于以往的工作，需要不断的充实自己在非财务审计方面是相关理论。譬如金融学方面的、控制论等方面的种种知识。所以说注册会计师要积极参与企业的运营管理，从而积累相关的实践经验，提高自身职业的胜任能力。
3.有效利用相关测试
在评价模式确定之后，要对内部控制进行健全性测试，主要对象是企业的内部控制形成的科学性等，相关人员要广泛的搜集资料，并
结合相关部门进行探讨，充分掌握主要的业务处理的控制情况以及控制方式的合理性等等。另外内部控制的有效性会影响企业的运营以及相关的的管理活动进而影响预期目标的实现。有效性的测试可以在一定程度上控制一些不利的因素产生，从而促进效益的形成，内部控制要发挥其自身的效力，在整体以及具体的项目程序上也要发挥其控制作用。在实施测试之前，要排除掉一系列问题漏洞，然后对控制程序进行监控以保证它能够有效的控制重要的风险。
4.内控审计质量健全系统的构建
为了降低审计风险，提高内控审计工作的质量，构建健全的内部控制审计系统是大势所趋。要做好这一方面需要从两个方面来着手，即注册会计师和会计事务所。对于注册会计师的质量控制，其核心在于相关人员的素质的提升;而会计事务所方面则主要是要立足于整体上完善其组织结构、还有审计员的质量控制、审计制度上的质量控制等;在业务上要规范内控审计承接的程序、审计方式等以促进其内控业务质量的控制。
四、结语
总之不断加强企业内控审计，是现今企业得以生存发展所必须遵循的原则，了解企业内部控制审计的流程，寻找问题所在，才能够有针对性的开展工作;而从其理论和实践历程来看，内控审计工作的加强与完善，是企业降低运行风险以及提升内部管理水准的重要前提条件和保障。内部控制审计工作的完善与健全也是为了顺应现今社会经济发展的趋势的，是现今经济发展到一定水平的产物，它的发展将促