ＡＢＳＴＲＡＣＴ
，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｉｓａｎｉｎｔｅｒｄｉｓｃｉｐｌｉｎａｒｙｓｃｉｅｎｃｅｔｈａｔｄｅａｌｓｗｉｔｈｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｄａｔａｂｙ
ｍｅａｎｓｏｆｓｔｏｒｉｎｇ，ｓｅａｒｃｈｉｎｇａｎｄｐｅｒｆｏｒｍｉｎｇａｎａｌｙｓｉｓｗｉｔｈｔｈｅｐｏｗｅｒｏｆｍｏｄｅｍｃｏｍｐｕｔｅｒｓ．Ｎｏｗｗｉｔｈｔｈｅｅｘｐｌｏｓｉｖｅｇｒｏｗｔｈｏｆｂｉｏｍｅｄｉｃａｌｌｉｔｅｒａｔｕｒｅｓ，ｔｈｅｒｅｈａｖｅｂｅｅｎａｌｏｔｏｆｉｎｔｅｒｅｓｔｓｗｉｔｈｉｎｔｈｅｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃｃｏｍｍｕｎｉｔｙ
ａｉｎｈｏｗｔｏｃａｐｔｕｒｅｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｆｒｏｍｔｈｅｖａｓｔｃｕｒｒｅｎｔｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃｌｉｔｅｒａｔｕｒｅｓｉｎｆｏｒｍｓｕｉｔａｂｌｅｆｏｒａｎａｌｙｓｉｓｂｙｃｏｍｐｕｔｅｒ．Ａ
ｃｅｎｔｒａｌｐｒｏｂｌｅｍｉｎｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｉｓｔｏｄｅｓｉｇｎｌｉｔｅｒａｔｕｒｅ－ｍｉｎｉｎｇｔｏｏｌｓｔｏｆｉｎｄｔｈｅ
ｔｏｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌｋｅｙ－ｗｏｒｄｓｒｅｔｒｉｅｖａｌｎｕｇｇｅｔｓｏｆｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｆｒｏｍｌｉｔｅｒａｔｕｒｅｓ．Ｃｏｍｐａｒｉｎｇ
ｍｅｔｈｏｄ，ａｄｖａｎｔａｇｅｓｏｆｔｈｅｓｅｔｏｏｌｓａｒｅａｐｐａｒｅｎｔ：ｆａｓｔ，ａｕｔｏｍａｔｉｃａｎｄｅｆｆｉｃｉｅｎｔｉｎｔｉｍｅａｎｄｌａｂｏｒｒｅｓｏｕｒｃｅｓ，ｅｓｐｅｃｉａｌｌｙｉｎｌａｒｇｅ－ｓｃａｌｅａｒｔｉｃｌｅａｎａｌｙｓｉｓ．
Ｓｉｇｎａｌｐａｔｈｗａｙｉｓｔｈｅｓｕｂｓｔａｎｃｅ
ａｏｆｃｅｌｌｓ’ｒｅｓｐｏｎｓｅｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｔｏｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ．ＩｔｐｌａｙｓｃｒｕｃｉａｌｒｅｇｕｌａｔｏｒｙｒｏｌｅｓｉｎｖａｒｉｅｔｙｏｆｃｄｌａｌａＩ
ａｎｄｐｒｏｃｅｓｓｅｓ，ｉｎｃｌｕｄｉｎｇｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ，ｃｅｌｌ
ｐａｔｈｗａｙｈａｓｂｅｅｎｃｙｃｌｅ，ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ｐｒｏｌｉｆｅｒａｔｉｏｎｏｎｅａｐｏｐｔｏｓｉｓ，ｅｔｃ．Ｓｉｇｎａｌｏｆｔｈｅｍｏｓｔ
ａｒｅｃｏｎｃｅｒｎｓｏｆｍｏｌｅｃｕｌａｒｂｉｏｌｏｇｙｉｎｒｅｃｅｎｔｙｅａｒｓ．Ｂｕｔｌｏｔｓｏｆｖａｌｕａｂｌｅｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｄｉｓｐｅｒｓｅｄｉｎｖｏｌｕｍｅｓｏｆｌｉｔｅｒａｔｕｒｅ．Ｉｔ’Ｓｑｕｉｔｅｔｉｍｅｔｏ
ｃｏｌｌｅｃｔｔｈｉｓｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｒｅｌａｔｅｄｗｉｔｈｓｉｇｎａｌｐａｔｈｗａｙｔｏｕｎｄｅｒｓｍｎｄｔｈｅｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅｓｉｇｎａｌｐａｔｈｗａｙ．
Ｉｎｔｈｉｓｄｉｓｓｅｒｔａｔｉｏｎ，ｓｏｍｅｏｒｉｇｉｎａｌｒｅｓｅａｒｃｈｗｏｒｋｂｙｔｈｅａｕｔｈｏｒ
ａｓＣａｎｂｅｆｏｒｍｕｌａｔｅｄｆｃｌｌｌｏｗ：
１．Ｏｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｉｓｏｎｅｔｈｅｒｅｓｕｌｔｏｆｓｉｇｎａｌｐａｔｈｗａｙ，ａｎｄｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎｆａｃｔｏｒｓ
ｏｎｐｌａｙｐｉｖｏｔｒｏｌｅｓｉｎｔｈｉｓｐｒｏｇｒｅｓｓ．ＡｌｉｔｅｒａｔｕｒｅｍｉｎｉｎｇｍｅｔｈｏｄｂａｓｅｄＢａｙｅｓｉａｎｉｓ
ｆｉｒｓｔｐｒｏｐｏｓｅｄｔｏｒｅｔｒｉｅｖｅａｒｔｉｃｌｅｓｄｅｓｃｒｉｂｉｎｇｂｉｎｄｉｎｇｓｉｔｅｓｏｆｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎｆａｃｔｏｒ．Ｂｙ
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ｏｎｓｉｍｉｌａｒｗｉｔｈｃｌａｓｓｉｃａｌｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｒｅｔｒｉｅｖａｌｍｅｔｈｏｄｗｈｉｃｈｉｓｂａｓｅｄＴＦ／ＩＤＦｔｈｅｏｒｙ．Ｔｈｅｅｆｆｉｃｉｅｎｃｙｏｆｔｈｉｓ
ｍｅｔｈｏｄｉｓｉｍｐｒｏｖｅｄｇｒｅａｔｌｙｂｙｃｏｍｂｉｎｉｎｇｗｉｔｈｒｅｌａｔｅｄａｒｔｉｃｌｅｓｍｅｔｈｏｄｏｆ
ＴｈｅｒｅｃａｌｌｒａｔｅａｎｄｐｒｅｃｉｓｉｏｎｒａｔｅｏｆＯｕｒｍｅｔｈｏｄ
ｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌｋｅｙ－ｗｏｒｄａｒｅＰｕｂＭｅｄ．９１％ａｎｄ４５％，ｗｈｉｃｈｏｕｔｐｅｒｆｏｒｍｓ
ＰｕｂＭｅｄｍｅｔｈｏｄ（ｒｅｃａｌｌａｒａｔｅ＜＝８３％ａｎｄｐｒｅｃｉｓｉｏｎｒａｔｅ＜＝２６％ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅ）．Ａｌｔｈｏｕｇｈｏｕｒｍｅｔｈｏｄｈａｓｌｉｔｔｌｅｌｏｗｅｒｒｅｃａｌｌｒａｔｅｔｈａｎｓｏｌｅｒｅｌａｔｅｄａｒｔｉｃｌｅｓｏｆ
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