液氮研磨组织提取RNA步骤
一、试剂与耗材(RNA提取专用,无RNase)
75%的酒精(用无酶水配制),RNase Zap, Trizol(Invitrogen),氯仿,异丙醇,无RNA酶水(Ambion);研钵,研杵,1.5ml EP管,2.0ml EP管,15ml 管,50ml 管,棉纱布。 二、操作步骤
1) 用75%酒精对实验操作台、移液枪、枪头盒、管架进行消毒,然后再用RNase Zap擦拭上述材料。
2) 取出-80℃冰箱保存的组织块,放于用液氮预冷过的研钵中,敲碎一小块组织,其余放回冻存管。
3) 加入液氮,先轻轻敲碎组织到最小块,再研磨成粉末,直到看不到组织块。
4) 加入液氮使粉末凝聚成团,马上用药勺把粉末转移到2.0ml EP管中。
5) 待液氮挥发干后,加入1ml Trizol裂解液,用1ml移液器将细胞吹散开,保证细胞裂解充分,必要时可借助水平振荡器混匀。 6) 4℃离心机12000rpm离心5分钟,弃沉淀。注:此时可放入-80℃低温冰箱长期保存。
7) 加入氯仿,比例200ul氯仿/ml Trizol,颠倒混匀,室温放置15分钟。
8) 于4℃离心机12000g离心15分钟。取上清液(上层为水相,中间层为蛋白,下层为有机相,核酸分子主要集中在上层),注意吸取上清是无触碰到中间层或下层。
9) 取上清液(上层为水相,中间层为蛋白,下层为有机相,核酸分子主要集中在上层),注意吸取上清是无触碰到中间层或下层。 10) 加入等体积异丙醇,-20℃沉淀1小时。 11) 于4℃离心机12000g离心10分钟。
12) 弃上清,加入1ml 75%酒精漂洗沉淀,于4℃离心机800g离心5分钟。必要时可重复酒精洗涤
13) 弃上清,可选择再次离心去除残留的乙醇,沉淀在安全柜内晾干,切忌过干,只需目测乙醇挥发干即可。
14) 根据沉淀的大小,使用无RNA酶的水将RNA沉淀充分溶解。选择溶解沉淀的体积,一般为30-100ul。测RNA浓度,此方法RNA A260/A280值在1.6-1.8之间。
15) 电泳检测RNA完整性,0.5XTBE Buffer,110V 电泳30分钟。 16) 最后将沉淀保存在-80℃低温冰箱。