原位杂交技术(ISH)步骤与注意事项
材料
(一) 仪器:光学显微镜、烤箱、温箱、水浴箱、电吹风机
(二) 器皿:塑料反应盒、玻片架、洗涤杯、微量移液器、Eppendorf 管 (三) 试剂:
1. DEPC (所有的试剂以此配制,注:DEPC致癌,应在通风下进行,并避免接触皮肤;含有Tris 中不能用DEPC)
3. 0.2mol/L HCl 1.72ml 浓HCl,加ddH2O至1000ml 4. 20%冰醋酸 20ml 冰醋酸,加ddH2O至100ml 5. 蛋白酶(50μg/ml)
6. 溶液I: 含0.1mol/L Tris、0.1mol/L NaCl、2mmol/L MgCl2、0.05% Triton X-100
取12.1g Tris; 5.85g NaCl; 0.41g MgCl2·6H2O,溶于800ml ddH2O中,再加入0.5ml Triton X-100,用HCl调pH至7.5,加ddH2O至1000ml。8×105Pa高压蒸汽灭菌15min
7. 溶液II: 含0.1 mol/L Tris、0.1mol/L NaCl、50mol/L MgCl2。方法:取12.1gTris;5.85g NaCl ; 10.15g MgCl2·6H2O,溶于800ml ddH2O中,用HCl调至9.5 ddH2O至1000ml。8×105Pa高压蒸汽灭菌15min。 8. 4%多聚甲醛:A液:称4g多聚甲醛,加40ml ddH2O,加温至60℃后,边摇边滴加1mol/L NaOH至全部溶解。B:液:1.69g NaH2PO4·2H2O,加30ml ddH2O至溶。C液:0.39gNaOH 溶于20ml ddH2O中。先将B液与C液混合后再加入A液,以1mol/L NaOH或HCl调pH值至7.2~7.4,加ddH2O至100ml。4℃保存。 9. 去离子甲酰胺:新的。
10. 20×SSC:含有3mol/L NaCl, 0.3mol/L SSC。取175.32g NaCl,加ddH2O,充分溶解后,加88.2gSSC,溶解后加ddH2O至1000ml。8×105Pa高压蒸汽灭菌15min。 11. 硫酸葡聚糖(1mg/ml),取硫酸葡聚糖1g溶于1ml灭菌水,-20℃下保存。
12. 50×Denhart液:含1% BSA,1% Ficoll-400(水溶性聚蔗糖),1% PVP-40(聚乙烯吡咯烷酮),分别称取1g BSA,1g PVP-40,1g Ficoll-400,用少量的ddH2O溶解混合,加ddH2O至100ml。过滤灭菌,贮存于-20℃下备用。
13. 亲和素---碱性磷酸酶(Av-AP) 200U/200μl 14. 底物显色液
15. 50%甲酰胺 50ml甲酰胺,加50ml 2×SSC,混匀后备用。
16. 0.1mol/L pH 7.4 PBS.。称取43.2g Na2PO4·2H2O,溶于少量ddH2O,分别溶解后将二者合并,加入127.5g NaCl至完全溶解,加ddH2O至1500ml。8×105Pa高压蒸汽灭菌15min。使用时作10倍稀释。
17. 2%BSA。取0.1g BSA,溶于5ml溶液I中。
杂交前标本处理
试剂配制与准备
A 0.1mol/L PBS, pH 7.0 B 0.2% DEPC C 4%多聚甲醛 D 0.1mol/L HCl
E 200μg/ml RNase A F 蛋白酶K,稀释成含0.5-1μg/ml, 必要时用1-3或5μg/ml(用10 mg/ml贮存液稀释)
G 0.1%甘氨酸, 用0.1mol/L PBS, pH 7.5配制 H 2×SSC, 1×SSC, 用20×SSC贮存液稀释配制
I 0.1mol/L 三乙醇胺 HCl-NaOH缓冲液,pH 8.0
J 0.25%醋酐,用0.1mol/L三乙醇胺HCl-NaOH, pH 8.0配制(临用前)
K 50 mmol/L Levamisole液(碱性磷酸酶抑制剂) 4℃保存,使用时稀释成5mmol/L
操作程序
(一)杂交前处理
1. 细胞制片或切片取出冰箱, 恢复室温, 0.1mol/L PBS pH 7.0 漂洗.未脱蜡者先脱蜡,入水再漂洗。
2. 检测RNA用,0.2TPC漂洗1分钟。 3. 4%多聚甲醛室温固定5min(前固定)。 4. 0.1mol/L PBS pH 7.0 漂洗 2次。
5. 应用非放射性标记探针需灭活内源性酶者,按免疫组化方法处理。 6. 0.1mol/L PBS pH 7.0 漂洗 2次,每次3min。
7. 0.1mol/L HCl室温下处理10min, 0.1mol/L PBS漂洗2次,此步骤不能省掉。
9. 蛋白酶K 37℃消化5-10min,福尔马林固定石蜡切片组织可用1-3μg/ml/,可适当延长消化时间,但不能处理过分。消化完毕立即用0.1%-0.2%甘氨酸泡洗1分钟终止蛋白酶K 10. 0.1mol/L PBS pH 7.0 漂洗 2次。
11. 检测DNA按照此步骤: DNA:制片于1×SSC中,100℃沸水中变性5min,立即入冰浴的1×SSC中5min。
12. 4%多聚甲醛0-4℃固定15min.,(后固定),很重要 13. 0.1mol/L PBS pH 7.0 漂洗1次-2次(4℃)×5min.
14. 0.1mol/L三乙醇胺缓冲液(仅是平衡作用,可以省掉此步骤), pH8。0 过洗1 次。 15. 新配的 0.25%醋酐中乙酰化10min 16. 2×SSC漂洗(室温)2次,每次5min 17. 梯度酒精脱水,室温下干燥。 (二)预杂交与杂交 A 配制标记探针
非同位素标记的探针可配成50ng-100ng/μl B 配制杂交液与预杂交液
预杂交液仅无标记探针,余相同。
杂交液:(50ml) 用量 终浓度 100%去离子甲酰胺 25ml 50% 100%葡聚糖硫酸脂 5mg 10% 100×Denhard's 0.5ml 1
1Mtris-HCL(PH8.0) 0.5ml 10Mm 5M NaCl 3ml 0.3M
0.5M EDTA (PH8.0) 0.1ml 1mM 10mg/ml 变性鱼精DNA 0.5ml 100ug/ml ddH2O定容至25ml
C. 2×SSC 用20×SSC稀释10倍
操作:
1。将处理好的玻片用清洁滴管轻轻吹拭标本表面,以除去可能的灰尘后放入温盒内,温盒中滤纸上吸滞2×SSC
2.将预杂交液滴铺满标本表面,在温盒内,室温下或42℃下预杂交30min-2 h。 3. 去预杂交液,甩净
4.将杂交液滴于标本上,每片约20-30μl,用硅化的盖玻片盖上,去除气泡,平放于温盒内进行杂交。杂交温度:37℃左右。杂交时间:DNA探针过夜,寡核苷酸探针半天。 (三)杂交后处理
(1) 2×SSC轻轻冲洗下盖玻片
(2) 用含1mmol/L DTT的2×SSC漂洗15min (3) 含0.1%Triton X100的2×SSC漂洗15min (4) 2×SSC洗15min (5) RNase A处理15min
(6) 用2×SSC漂洗2次,每次10min
(7) 同上用0.3mol/L乙酸铵配制的梯度乙醇脱水,空气中干燥。 显色:
试剂配制及准备:
A. 洗涤缓冲液 含100mmol/L Tris-HCl,pH 7.5; 150mmol/L NaCl 配法:1mol/L Tris-HCl 缓冲液, pH 7.5 50ml 5mol/L NaCl 15ml 去离子水加至500ml B.封闭液
用洗涤缓冲液将试剂盒内的封闭液作0.5%稀释。因其溶液较慢,故应在操作前1h在50-70℃下稀释。
C。用洗涤缓冲液1将试剂盒内抗地高辛抗体复合物作1:5000稀释
D.AP底物缓冲液。1×AP:含0.1mol/L Tris, pH9.5; 0.1mol/L NaCl; 5mmol/L MgCl2 配法:1mol/L Tris-base 50ml 5mol/L NaCl 10ml 1mol/L MgCl2 2.5ml 加去离子水至400ml E.NBT-BCIP工作液。
F.终止缓冲液。含10mmol/L Tris-HCl, pH 8.0; 1mmol/L EDTA
配法:1mol/L Tris-HCl缓冲液,pH8.0 1ml; 0.5mol/L EDTA 0.2ml; 去离子水100ml 操作程序: (1)。地高辛标记的杂交片经充分漂洗后,在洗涤缓冲液(试剂盒中缓冲液1)中漂洗浸泡1min;
(2)封闭液(buffer2配)浸泡30min室温,或置湿盒内。 (3)洗涤缓冲液漂洗1min
(4)稀释的抗地高辛-AP结合物室温下30min (5)以洗涤缓冲液漂洗2次,每次15min
(6)AP底物缓冲液浸泡2min(平衡,即buffer3)
(7)NBT-BCIP工作液避光显色1h,必要时可延长达24h,至呈现合适的颜色(紫蓝色) (8)终止缓冲液(即buffer 4)浸泡5min (9)去离子水漂洗3次×10min (10)如有必要可复染
(11)去离子水漂洗,梯度酒精脱水,二甲苯透明,DPX或加拿大胶封片。 (12)显示:图像分析检测仪。
(13)对照实验和ISHH结果的判断。