99. CODESSA 高级的，具有全面描述符的定量构效关系和定量构性关系程序，该程 序将AMPAC和其他QM程序与实验数据关联在一起。 FPLO 由于FPLO使用了最小基，因此它可以对包含一百个过渡金属原子的晶胞进行高精度的完全势计算。FPLO包含图形界面的输入文件编辑器，3D结构工具和结果显示工具。 预测气相色谱的保留顺序，聚http://http://www合物的玻璃化温度，临界胶束.semichem.com 浓度，毒性，沸/溶点，闪点。 是完全势局域轨道最小基代码，用局域自旋密度近似（LSDA）求解规则格子的Kohn－Sham方程。 http://www.ifw-dresden.de/agtheo/FPLO http://www.molpro.net 100. 101. MOLPRO 国际上广泛使用的专业级电子结构量化计算软件，利用高精度计算，程序的核心是MCSCF，MR通过多参考CI，耦合簇和有关方法，广泛处理电子相关问题。使用直－CI和耦合簇程序。 接积分局域电子相关方法，可以极大减少随分子尺寸增加的计算量，能够对更大的分子体系进行准确的从头计算。 并行量化计算软件，提供试用版下载ftp://pqs-chem.com/，注册运行。 闭壳层和开壳层SCF和DFT能量、梯度计算，包括几种初始波函数猜测选项。 电子结构从头计算程序，可以对分子的基态和激发态进行第一定律计算。 基态自洽场方法； 处理电子相关波函数； 激发态方法； 特性分析； 基组。 单点能计算，几何优化，组态分析，预测化学反应，平衡位置和过渡态寻找，水溶液的SM5.4能量计算，Mulliken和NBO的布居分析。 102. PQS http://www.pqs-chem.com http://www.q-chem.com 103. Q-Chem 104. Spartan 图形界面的离子量子化学从头计算程序。 http://www.wavefun.com 105. 106. Wien2K LocalSCF 用密度泛函理论计算固体的电子结构，基于键结构计算完全势能增广计算固体的电子结构。 平面波和局域轨道相结合的方法。 拥有单机优化最高可达包含120000原子的分子和体系的唯一商业化极其快速地计算蛋白质的电半经验代码。处理这些巨型分子的能力掀开了化学和生物化学研究的子结构而设计，处理蛋白质分全新领域，如蛋白质-配体相互作用，聚合物和材料化学。 子是本程序的放大特色。 http://www.wien2k.at
107. Crystal T.B. 包含关于蛋白质结晶环境信息的数据库，它由业界专家经过仔细筛选得来。该数据库帮助研究人民比较数据库中的信息，设定蛋白质结晶的条件，这对节约蛋白质结构的分析时间是很有贡献的。 蛋白质信息蛋白质名称、种属、配体、辅助因子、功能类型、结构类 型及其它。 能彻底的搜索构象空间以确定最稳定的构型：下行/蓄水法、可变的搜索限制、三种微扰模式(角振动，边翻转和逐级旋转)、预检查 。 http://www.fqspl.com.pl/Crystal_TB http://www.conflex.us 108. CONFLEX 快速准确的构象搜索和分析，对药物发现和化学工程非常重要。CONFLEX的独特之处是它完全地搜索柔性分子构象空间，以找到每一个有化学意义的最佳结构。CONFLEX的构象搜寻并不依赖于用户输入的初始构型。在这方面的功能上，CONFLEX优于同价位的其他软件，穷举搜索，快速且精度高，可处理大量分子，有平行计算选项。 CONFLEX CONFLEX的计算结果能以多种形式输出，允许应用在从头计算或可视化显示上，比如应用于BARISTA软件。 CACHe 一款为实验科学家设计的卓越的计算机辅助化学建模软件包， 应用领域涉及到生命科学，材料和化学，以及本科和研究生教育工作。CAChe 让每个科学家可以观察3D分子结构，搜索构象，分析化学反应以及预测化合物性质。所有功能均可在友好的图形界面中实现。包含很多新的半约验方法，可以计算直到20,000个原子的分子，甚全可以挑战实验精度。 109. 药物设计； 反应与合成； 化学设计； 多聚物。 化学性质及信息数据库 110. SC-Database Mini-SCDatabase TAPP 包含由1887年至今发表的所有重要的稳定常数及其相关的热力学数据。 工业化学、环境研究、医药化学、分析化学、海洋学和化学领域的必备工具。 http://www.acadsoft.co.uk http://www.acadsoft.co.uk 111. 112. 是SC-Database的一个子集，包含所有重要金属/质子-配基对的选择。 纯化合物的热化学性质和物理性质的数据库。 固/流体、热动力学氧化物和http://www.esm-卤化物体系的二元或三元图。 software.com./tapp 急救、突发事件、PPE、毒性、 物理性质等方面的具体信息。 113. ChemWatc世界上最大的独立的、可获得的MSDSs的数据库，包含40,000多种h MSDS 纯物质和65,000种常见的混合物。 Database ChemGoldChemWatch的网络版，包括所有的ChemWatch化合物。 114.
2 115. NIST 包括163,198个不同化合物的190,825个 电子电离光谱。 http://www.chemsw.com 分子计算 116. AMPAC 半经验量子力学程序，计算速度快。 包含图形用户界面，可构造分http://www.semi子和图形显示全部计算结果。 chem.com/ampac.html http://www.cachesoftware.eomcachedgaussindex.shtml 117. DGauss 分子密度泛函程序，用于研究原子、分子和团簇的电、磁和结构特性。 可以研究包含金属、有机金属、陶瓷和有机分子在内的化学体系。 118. Gaussian/Gaussian是半经验计算和从头计算使用最广泛的量化软件，可以用来GaussView 预测气相和液相条件下，分子和化学反应的许多性质：分子的能量和 结构；过渡态的能量和结构；振动频率；红外和拉曼光谱（包括预共振拉曼）；热化学性质；成键和化学反映能量；化学反应路径；分子轨道；原子电荷；电多极矩；NMR屏蔽和磁化系数；自旋－自旋耦合常熟；振动圆二色性强度；电子圆二色性强度；g张量和超精细光谱的其它张量；旋光性；振动－转动耦合；非谐性的振动分析和振动－转动耦合；电子亲和能和电离势；极化和超极化率（静态的和含频的）；各向异性超精细耦合常熟；静电势和电子密度。 简单快速地构造分子，创建三http://www.gaussian.com 维分子模型； 计算任务设置全面支持Gaussian； 设置Gaussian的计算，显示Gaussian的计算结果； 支持PostScript，JPEG，PNG，以及TIFF格式。 生命科学、生物类软件 119. ADMEWORKS Predictor 用于化合物ADMET性质预测的高速虚拟(计算机辅助)筛选系统。它补充现有的用于评价药理学特征的计算机预测技术。ADMEWORKS Predictor使同时优化ADME特性和药效成为可能。根据二者的相对重要性排列前后顺序，ADMEWORKS Predictor可以进行更集中的筛选，使研究集中在您感兴趣的性质范围内。 是一个高速虚拟(计算机辅助)筛选系统，同于同步评价化合物的致癌性；致突变性；血脑屏障； 人体肠吸收；CYP代谢；生物降解度；生物蓄积度；五规则；其它。 120.
ADMEWO用于预测化合物的各种化学
RKS ModelBuilder ADMET特性，一系列关于分子结构及其相应的实验数据是每个模型建立的先决条件。化合物药理学和ADMET特性的同步预测对发现平衡性好的命中目标以及优化先导物以降低失败率等阶段非常有用。 和生物学特性。采用各种算法可建立两类模型：定性和定量模型。 人体P450代谢数据库； 动力学代谢数据库； 人体转运物质数据库； 系统应用实例。 生物学元素库；创建离散和连续过程的模型；模拟结果实时图像显示。 121. ADME DB 是半个包含关于人体细胞色素P450代谢反应、动力学、转运以及结构 信息的数据库。 这些信息由分类(治疗领域)、药名、酶、反应和类型组成。数据库由萨格勒布大学的Slobodan Rendic教授创建。所设计的数据库用于预测和解释在药物设计和开发中应用的P450代谢数据。 Cell Illustrator 能够使生物学家绘制、模建、阐明和模拟复杂生物学过程和系统的软件工具。它只有突出的绘图能力，可允许研究人员模建代谢路径、信号转导级联、基因调控路径以及各种生物实体之间的动力学相互作用，用于显示生物路径、解释实验数据和测定假设。另外，它还为研究人员提供模型图表和模拟结果图。 富士通公司优秀的适用于实验化学家，生物化学家，药物化学家，计算化学家，以及高等教育工作者的计算机辅助化学建模程序包 Tripos公司药物设计与分子模拟软件，在药物设计领域发挥着及其重要的作用。 122. 123. 124. CAche SYBYL 药物设计，化学设计 http://www.fqspl.com.pl/CAChe 应用于酶学、免疫学、病毒学、 遗传与发育生物学、肿瘤研究、生物信息学、生物物理学、结构生物学和新药开发等领域。 http://www.fqspl.com.pl/ADMEWORKS_ModelBuilder http://www.fqspl.com.pl/ADMEWORKS_Predictor http://www.prem125. ADMEWORKS ModelBuilder ADMEWORKS Predictor SimVector 一个致力于建立数学模型的工具，该模型随即可用于预测化合物的各预测化合物的各种化学和生种化学和生物学特性。一系列关于分子结构和其相应的实验值的数据物学特性 是每个模型建立的先决条件。采用各种算法可建立两类模型：定性和定量模型。这些模型是在从分子结构得来的物化性质、拓扑学、几何学和电学性质(即所谓的描述符)的基础上建立起来的 一个用于化合物ADMET性质预测的高速虚拟(计算机预测)筛选系统。用于评价药理学特征的计算ADMEWORKS Predictor使同时优化ADME特性和药效成为可能。根机预测。 据它们的相对重要性排列前后顺序， ADMEWORKS Predictor可以进行更集中的筛选， 压缩在您感兴趣的性质范围内 SimVector能自动生成高质量的矢量图谱帮助克隆实验设计分析，能自克隆试验计划、编制高质量质 126. 127.
动设计Gateway?克隆、TA克隆和限制克隆等克隆实验方案。它可以自粒图谱、用户白定义矢量图谱 lerbiosoft.com/plasmid_maps/ind动从NCBI网站下载带注解的序列，图形化显示这些注解并将序列转序列分析 ex.html 化为图形格式的矢量图谱。SimVector具有全面的项目管理 功能，用于序列分组和系统化存储大量序列和载体 数学分析软件 128. Mathematica 美国Wolfram研究公司生产的一种数学分析型的软件，以符号计算见长，也具有高精度的数值计算功能和强大的图形功能。 数学分析 http://www.wolfram.com 物理分析软件 129. 130. 131. SIMON SL Toolkit XD 计算一定条件下电场和带电粒子的轨迹，广泛应用于二维或三维，静态低频RF场。 SIMON的增强软件包，扩展了程序的设计性和潜在批处理能力。 从衍射数据进行电荷密度的多极精致和拓扑分析的计算程序。 利用离子光学工作台模拟复杂问题。 http://www.simion.com http://www.chem.gla.ac.uk 声学计算 132. RAYON RAYON是基于边界元和有限元方法的低频振动软件。它包括标准的边界元-有限元求解器，求解非解耦合和耦合振动，有两个新的高级求解器和RAYON-IBEM能够模拟trimming vehicle component及非常复杂噪声源的特征 基于统计能量分析方法的结构振动，声学设计工具软件 PAM-VA ONE通过耦合有限元与统计能量分析方法创造性的解决了全频的声学模拟 声学 http://www.atechina.com 不支持并行 133. 134. 135. AutoSEA PAM-VA ONE CAA++ 汽车、航空航天、船舶、铁道、http://www.atechina.com 空调、IT 声学 http://www.atechina.com www.metacomptech.com 不支持并行 不支持并行 支持并行 支持Win/Linux/ Unix系统 支持并行 支持Win系统 空气声学及噪音的仿真将不再受经验公式和模型的限制。CAA++软件空气声学计算模拟软件 的NLAS 非线性声学求解器，可以计算模拟复杂的空气声学问题。CAA++提供了高效的噪音模拟功能、全光谱分析模拟、远场分析、减少近壁面和远场网格的数量、先进的噪音源随机模型 VNoise可以进行声学、空气声学、振动声学的仿真和计算。基本模块包括一个解算声学和振动声学问题的边界元解算器。型应用范围：VNoise的优势在于提供了用于前处理和后处理的功能强136.
VNoise www.sts-soft.com