白羊王朝(1378--1508)与一个叫沙法维（Safavids）的苏菲教团世代通婚，后者的父系可能是波斯人，也可能是库尔德人，发迹之后还自称是穆圣的后代，真相如何已经无法确定，总之沙法维家族在文化继承性上，属于波斯人的的余绪和复兴，在天才政治和军事家易司马仪一世(Ismail, 1501--1524)的领导下，沙法维人消灭了白羊王朝，建立起萨珊波斯以来第一个真正独立的波斯帝国。易司马仪一世有2大权力基础，一是他的苏菲教团团长身份，二是支持他的7个突厥部落，因为这些人带着红头巾，故而被称为红头军(Qizilbash)。多数史书称红头军为土库曼人(Turkman)，这种说法不能说错，但容易与里海东岸的土库曼斯坦人相混淆。土库曼的另一种译法是突厥蛮，从塞尔柱帝国开始，土库曼和突厥两个词可以互换，建立奥斯曼帝国的奥斯曼人、黑羊、白羊、红头军各部族，都可以叫土库曼人，当然也可以叫突厥人，具体到哪个突厥子系统，黑羊、白羊、红头军都可以归为阿塞拜疆人。
沙法维王朝的宫廷、军队中通用阿塞拜疆语，首都在阿塞拜疆境内，这个王朝可以视为阿塞拜疆人和波斯人的结盟，由阿塞拜疆人的武力和波斯人的文化宗教来共同维系。虽然后代的沙法维皇帝一直在致力于削弱红头军各部的影响，乃至阿巴斯大王为排除红头军建立嫡系皇家武装和迁都中部的伊斯法罕，但总体上波斯人和阿塞拜疆人的关系一直很好。在宗教方面，波、阿两族都信仰什叶派，按民族分布来说，阿塞拜疆现在是除了波斯人和
阿拉伯人之外的第三大什叶派民族。什叶派作为少数派，受到逊尼派民族的广泛敌意，阿塞拜疆和波斯人只能抱团取暖，波斯人和阿塞拜疆人是伊朗最大的2个民族，他们之间的关系，大概是世界上关系最好的第一第二大民族。
北阿脱离伊朗是很晚近的事情。19世纪初，腐败无能的恺加王朝当政，1804年俄国-伊朗战争爆发，1813年俄伊双方签订了《古利斯坦条约》(Treaty of Gulistan)，伊朗割让外高加索山以南、库拉河(Kura)以北的全部土地，涵盖今北阿大部、格鲁吉亚东部。经过另一轮俄伊战争，俄伊签订于1828年签订《土库曼恰伊条约》 (Treaty of Turkmenchay)，伊朗失去阿拉斯河以南的大片土地，包括今亚美尼亚大部和北阿南部，值得庆幸的是，俄国在高加索方向的南扩，基本到此为止，确定了俄国-苏联-独立的外高加索三国与伊朗的现代边境，南阿和北阿的分裂局面至此形成。
===== 俄国与伊朗两次条约产生的边界。红线是战前边界，伊朗北界达到高加索山以北。粗黑线是《古利斯坦条约》的边境线，再往南的细黑线是现代边界 =====
俄国是个东正教国家，之后的苏联信仰共产主义，俄国人对外高加索三国中信仰基督教的格鲁吉亚和亚美尼亚比较好，对信仰伊斯兰的北阿相对压制。特别是苏联时代，斯大林称伊斯兰教是【最反动、最愚昧、最落后的】宗教，多方加以打压。到1990年代初苏联解体，外高加索三国独立时，经过70年的无神论教育，北阿人的宗教观念与伊朗的南阿人相比，已经淡漠的多。
北阿的最大问题，在于西南部有一块土地—纳戈尔诺-卡拉巴赫(Nagorno-Karabakh)，简称纳卡，卡拉巴赫是突厥语，意为黑色花园，面积约4400平方公里，占整个阿塞拜疆的5%。早在阿塞拜疆民族形成之前，纳卡地区的民族就以亚美尼亚人为主。随着突厥人移居到外高加索和阿塞拜疆民族的形成，纳卡地区由阿塞拜疆人为君主的卡拉巴赫汗国统治。
纳卡和北阿被俄国吞并之后，纳卡地区的穆斯林和阿塞拜疆人大量向南迁徙，进入伊朗的南阿境内，俄国则招募同为基督徒的亚美尼亚人来纳卡，填补阿人离去造成的真空。1920年前后是外高加索天下大乱的时代，一方面是奥斯曼帝国和俄罗斯帝国解体，一方面是苏俄还没有结束内战统一全国，亚美尼亚和阿塞拜疆都认为纳卡是自己的一部分，在外国干预下，双方为纳卡大打出手。苏俄政府最初答应将亚美尼亚人居多的纳卡划给亚美尼亚，但到了1923年，为了安抚和争取土耳其，急于打破外交孤立的苏俄决定将纳卡划给阿塞拜疆。
对这种土地划分，阿、亚都不能满意，阿塞拜疆人发现他们的土地被亚美尼亚分隔为两块；亚美尼亚人则认为根据民族划分，此地应该是自己的。1988年，随着苏联的日渐式微，各地的民族主义者都活跃起来。2月13日，占纳卡人口80%的亚美尼亚人在纳卡首府斯捷潘纳克特（Stepanakert）举行示威游行，要求并入亚美尼亚，亚美尼亚首都埃里温的市民们也很快行动起
来，支持纳卡与亚美尼亚合并。1991年12月10日，纳戈尔诺-卡拉巴赫宣布独立，但除了亚美尼亚以外没有其他国家承认。阿塞拜疆自然不能答应，阿、亚两国的文斗很快就升级为武斗，1992年，阿、亚的战争全面爆发，2年的战争导致3万人丧生，对加在一块人口只有1200万的的两国来说，死亡3万人加上受伤、致残和被迫移居者，绝对是个天文数字。
纳卡战争是苏联解体前后最残酷的战争，没有之一。阿塞拜疆有834万人口(2005年)，8.66万平方公里，盛产石油和天然气；亚美尼亚325.05万人口(2011年)，2.98万平方公里，缺乏值得一提的资源，从国力对比来看，阿塞拜疆似乎必胜无疑，事实却是相反。虽然当时苏联解体，国势日衰，可俄罗斯人却对同为基督徒的亚美尼亚非常同情，大量俄罗斯军人以志愿军和志愿者身份为亚美尼亚而战，亚美尼亚人在海外也有巨大的影响，号称外高加索的犹太人，从来不缺钱，在多方的支持下，阿亚的纳卡战争以亚美尼亚的胜利告终，纳卡建立起亲亚美尼亚的纳戈尔诺-卡拉巴赫共和国，有自己的政府、国旗、宪法等等，虽然世界上绝大部分国家没有承认她，与德涅斯特左岸共和国相似。不仅如此，亚美尼亚人打出国外，还占据了北阿边境上的一些土地。
除了2个当事国和俄罗斯之外，纳卡战争的另一个积极参与者是土耳其，该国以突厥人的保护着自居，以阿塞拜疆是自己的