RNA提取步骤 - cell

2020-04-14 18:39

RNA的提取

1. 试验所用试剂的配制

(1) 含0.1TPC(二乙基焦磷酸酰胺)的灭菌水<实验过程中用>

0.1mlDEPC+99.9mlddH2O<瓶子事先用0.01TPC水浸泡2-3d灭菌后可用>。配好后灭菌,高压灭菌的目的是使DEPC分解,未分解的DEPC会影响后面的实验。所以需要放在通风厨中挥发至少3小时,一般都要放置过夜。用1.5ml的进口去RNA酶的doff管分装该DEPC水,置-20度储存,需要实验的人可以领取一支,使用后放置自己的-20度中下次可以继续使用,只需要注意使用的时候都用去RNA酶的枪头及相关的注意操作即可。 (2) 0.01TPC的灭菌水。<用于浸泡瓶子器材等除去Rnase用> (3) 琼脂糖凝胶电泳所用试剂配制与准备 ① 0.5mol/L PH=8.0的EDTA溶液

将37.2g EDTA-Na加入160ml的蒸馏水中,于搅拌器上剧烈搅拌。再用NaOH调其PH值至8.0(约需4g NaOH)。之后用蒸馏水定容至200ml,后送至高压灭菌,室温保存。 ② 50×TAE溶液

在400ml蒸馏水中溶解121g Tris,加入28.55ml冰乙酸和50ml 0.5mol/L PH=8.0的EDTA溶液,加水定容至500ml,室温保存。 ③ 溴化乙锭(EB) (10mg/ml) 在20ml水中加入0.2g EB,磁力搅拌,然后用铝箔包裹容器或将溶液移至棕色瓶中,室温保存。

④ RNA电泳 loading buf. (一般为6×)

2. 实验过程

(1) (2)

细胞种板:按相应细胞密度种板及处理,可以参考WB中的相关方法。 mRNA提取:(所有试剂和耗材都需要RNA-free,一般认为氯仿等试剂新开瓶的都是RNA-free的,所以可以作为专属RNA用做好标记)

① 去细胞培养液用预冷的PBS洗1次,一般常用六孔板,每孔加入Trizol 300ul-500 ul,

用RNA-free的枪头,吹打细胞数次,并转移到1.5mlEP管中室温孵育5min(此时的EP管不一定需要RNA-free,可以是普通的EP管,但用于吸取液体的枪头一定要是RNA-free的)。

② 按照每1mlTrizol加入0.2ml氯仿,盖紧样品管盖,用手用力摇15s并将其在室温条件

下孵育2-3min。(可用放doff管的两块板叠加用于剧烈振摇)

③ 在4℃以12000×g的离心力高速离心15min(离心机需要提前预冷)

④ 离心后的3层(下层红色的苯酚-氯仿层,中间为蛋白层,上层为无色水样),RNA存在

于水样中。将水样层转到新的去RNA酶的EP管中,吸取上清过程中,不要贪多,RNA的量永远是大大足够的,一定要避免吸到中间层。 (3) RNA沉淀

① 向移好的水样层中加入异丙醇,每1mlTrizol加入0.5ml异丙醇,轻轻混匀。 ② 将混匀的样品在室温条件下孵育10min。

③ 在4℃以12000×g的离心力高速冷冻离心10min(离心前RNA不见,之后形成白色沉淀

附于管底)。 (4) RNA洗涤、干燥及溶解

① 倒去上层悬液,每1ml的Trizol加入1ml 75%EtOH轻弹(也可以不管Trizol量直接都

加1ml)。

② 4℃下以7500×g的离心力冷冻离心5min。倒去上清,再短暂离心一下,目的是使剩余

液体聚集在管底,用200ul RNA-free的枪头小心吸尽剩余液体。干燥RNA,室温下自然挥发10min,一般呈半透明状即可,不能挥发太久,若太干会不好溶解。②加DEPC水30ul溶解RNA沉淀,短暂离心,离心后放在55度烘箱中放置10min,助溶,拿出后用枪吹匀。 (5) RNA浓度的测定

提取得到的RNA取2μl+78μlTE或水中稀释,(吸出RNA用的枪头要用RNA-free的,装稀释液的管子用普通的管子就可以)。混匀后用蛋白核酸测定仪进行测定:先测空白(如稀释液为TE就用TE作空白,水就用水作空白),再依次测定样品。(换测定样品时不需要洗涤样品槽,一般只要将液体弃尽就好,但使用完毕后一定要用蒸馏水清洗)。RNA样品其A260/A280的值一般在1.8-2.2之间,一般2左右最好。

OD×40×稀释倍数

RNA浓度(μg/μl) =

1000

测定结果如下:

若上样RNA的总量为1μg,则需加入的样品的体积数为:v=m/c=1μg/c样品 RNA浓度在1-2ug/ul储存于-80度比较稳定,考虑到反转时候体积一般选择RNA浓度1ug/ul左右为佳。


RNA提取步骤 - cell.doc 将本文的Word文档下载到电脑 下载失败或者文档不完整,请联系客服人员解决!

下一篇:K12学习《寡人之于国也》教学设计(全市公开课)(整理精校版)

相关阅读
本类排行
× 注册会员免费下载(下载后可以自由复制和排版)

马上注册会员

注:下载文档有可能“只有目录或者内容不全”等情况,请下载之前注意辨别,如果您已付费且无法下载或内容有问题,请联系我们协助你处理。
微信: QQ: