晶体结构解析
1. Shelxtl 使用流程
※ 解析原始文件有hkl文件（或raw文件），包含衍射数据；p4p文件，包含晶胞参数 ※ 为一个晶体的数据建立project，该项目下所有文件具有相同的文件名；一旦在XPREP中发生hkl文件的矩阵转换，则需要输出新文件名的hkl等文件，因此要建立新的project。 ※ 首先运行XPREP，寻找晶体的空间群
※ 然后运行XS，根据XPREP设定的空间群，寻找结构初解
※ 在Xshell中观察初解是否合理，如不合理，需重回XPREP中设定其他的空间群
2. Xshell 使用流程
※ 找出重原子或者确定性大的原子 ※ 找出其余非氢原子 ※ 精修原子坐标 ※ 精修各项异性参数
※ 找到氢原子(理论加氢或差值傅里叶图加氢)
※ 反复精修，直到wR2等指标收敛。最后的R1<0.06(0.08) wR2<0.16(0.18)
※ 通过HTAB指令寻找氢键，判定氢的位置是否合理，并且将相关氢键信息通过HTAB和EQIV指令写进ins文件中 ※ 将原子排序(sort)
3. cif 文件生成和检测错误流程 bond $H conf acta
※ 在步骤1、2完成后，在ins文件中加入以下三条命令
※ 此时生成了cif和fcf文件，将cif文件拷贝到planton所在文件夹中检测错误，也可
以通过如下在线检测网址：http://journals.iucr.org/services/cif/checkcif.html ※ 根据错误提示信息，修改或重新精修，将A、B类错误务必全部消灭，C类错误尽量消灭。
4. Acta E 投稿准备流程
投稿前，请务必切实做好如下工作：
※ 按步骤1、2、3解析晶体并生成相应cif和fcf文件。 ※ 准备结构式图(Chemical structural diagram)、分子椭球图(Molecular ellipsoid diagram)和晶胞堆积图(Packing diagram)，最好是pdf格式。
※ 按要求撰写文章的文字部分，填写cif中相应段落，注意格式要求！
_publ_section_title 题目 _publ_section_abstract 摘要 _publ_section_related_literature 相关文献 _publ_section_comment 评论 _publ_section_exptl_prep 制备方法 _publ_section_exptl_refinement 精修说明 _publ_section_references 参考文献 _publ_section_figure_captions 插图说明 _publ_section_table_legends 表格说明 _publ_section_acknowledgements 致谢
※ 将cif中需要填写的其他部分（在cif的标准空白样本中以！标注）全部完成，并再次检查整个cif文件格式和内容。
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参考书目
? 单晶结构分析原理与实践 O723/0301
陈小明，蔡继文, 科学出版社 2003
2007年第2版 O723/10001
? 固体科学中的空间群 O711/8401
(美)(G.Burns),(A.M.Galzer) 高等教育出版社 1981
? 结晶化学导论 O711/8401
(英)(R.C.Evans), 人民教育出版社 1980
? 结晶化学导论 O74/10002
钱逸泰,中国科学技术大学出版社 2005
? 晶体结构的周期性和对称性 O723/9201
周公度, 高等教育出版社 1992
? X射线分析的发展 O434.1/8901 (英)(Bragg,W.L.), 科学出版社 1988
? X射线衍射分析原理与应用 O657.39/0401 刘粤惠，刘平安, 化学出版社 2003
? 晶体生长 O78/81001
张克从，张乐惠, 科学出版社 1981
? 超分子化学 O631.1/0402 (法)Jean-Marie Lehn, 北京大学出版社 2002
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应用软件
Shelxtl V6.10, Bruker 2000
晶体解析、分析、作图的首选软件
Platon V1.15, A.L.Spek, Utrecht University, Padualaan 8, 3584 CH Utrecht, The Netherlands 2008
Cif文件查错、解析结构全面解析的软件，下载及更新地址：
http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/platon/ Mercury V1.4.2, CCDC 2007
晶体结构分析、作图辅助软件下载及更新地址
http://www.ccdc.cam.ac.uk/free_services/mercury/downloads/ enCIFer V 1.2, CCDC 2005 cif 填写、检查格式软件
http://www.ccdc.cam.ac.uk/free_services/encifer/downloads/
publCIF v 1.9.2, IUCr 2008
cif 填写、检查格式、预览软件
http://journals.iucr.org/services/cif/publcif/#download
Acrobat V6.0 standard version, Adobe 2003
其中Distiller工具能将Shelxtl产生的ps格式转换成常见格式图像的功能
Chem Office Ultra V 8.0, Cambridge Soft 2003
其中Chem Draw可用于分子结构式图Scheme的制作
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相关机构网址
在线检测Cif文件的地址：
http://journals.iucr.org/services/cif/checkcif.html
IUCr：International Union of Crystallography
国际晶体学联合会 http://www.iucr.org/
IUCr：Acta Crystallography Section A-E
(国际晶体学联合会主办的晶体学报 A-E) http://journals.iucr.org/
Section C : Crystal Structure Communications Section E : Structure Report Online
其中Section E : Structure Report Online的投稿指南地址CCDC：The Cambridge
Crystallographic Data Centre
剑桥晶体数据中心
http://www.ccdc.cam.ac.uk/ 4