近二十年微生物学大事件
闫成亮
（生物制药（2）班 生命科学学院 黑龙江大学 哈尔滨 150080）
摘要：随着科学技术的不断发展，研究微生物的方法也不断进步。近二十年微生物的发展取得较大的成绩 。细菌基因组的完整序列测定。2003年4月13日，WTO宣布由11个国家共计14个实验室参加的WHOSARS研究项目组发现SARS病原体为一种属于冠状病毒科的新型病毒。2003年12月开始，禽流感在东亚多国—主要是越南，韩国、泰国—严重爆发，并造成越南多名病人丧生。现在远至东欧多个国家亦有案例。 关键词：基因组序列、SARS、猪流感、禽流感
Nearly twenty years microbiology big events
YanChnegLiang
（The 2th class of Biological pharmaceutical，class life science， college of Heilongjiang
university， Harbin ，150080）
Abstract: Along with the science and technology unceasing development, the microbial method also progress. Nearly twenty years the development of microorganisms has made onsiderable achievements. The integrity of the bacterial genome sequence determination. On April 13, 2003, the WTO by 11 countries announced a total of 14 laboratory in WHOSARS research team found that SARS pathogen for a belongs to the coronavirus family new virus. Started in December 2003, bird flu in east Asia nations - mainly Vietnam, South Korea, Thailand, Vietnam, and cause serious outbreak of many patients died. Now far to eastern European countries also have case. Key words: Genome sequence, SARS, Swine flu, Avian flu
2003年3月，科学家们发现了导致SARS的元凶SARS－CoV，并且成功的完成了SARS－CoV基因组的完整测序。SARS－CoV基因组有29727个核苷酸、11个开放阅读框（Opening Reading Frames）组成。它的基因组结构和其他的冠状病毒非常相似。但通过比较遗传史和序列比对表明SARS－cov的特征和以前发现的冠状病毒的特征并不完全相似，它不仅表现有其他冠状病毒共有的特征，还有SARS－CoV本身特有的特征。--SARS相关冠状病毒的基因组序列
我们进行了SARS相关的冠状病毒Tor2分离株（29751个碱基）的基因组测序。基因组序列揭示这个冠状病毒与已知的冠状病毒（包括人类冠状病毒
HcoV-OC43,HCoV-229E) 无密切相关。预测病毒蛋白的种系分析表明，该冠状病毒与已知的三族冠状病毒均非密切相似.基因组序列将有助于人类SARS病毒感染、潜在动物宿主的诊断检测（使用PCR和免疫测试法），有助于发展抗病毒制剂(包括中和抗体)和找出公认的疫苗抗原决定簇。SARS冠状病毒在种属分类上属于“ssRNA positive-strand viruses”家系的“Nidovirales”族中的“Coronaviridae”系(见Taxonomy)。它是冠状病毒家族中新出现的一个子类（Figure 1）。全长29,736bp，已知有11个编码序列（cds），而其中的一个cds（putative orf1ab polyprotein）与鼠类的肝炎病毒（murine hepatitis
virus）结构类似，依据鼠类的肝炎病毒的结构模式，推断出该段cds应该编码了14个蛋白质（Figure2，Table1）。
2009年4月中，墨西哥公布发生人传人的甲型H1N1流感案例，有关案例是一宗由H1N1病毒感染给人的病例，并在基因分析的过程发现基因内有猪、鸡及来自亚洲、欧洲及美洲人种的基因。甲型H1N1流感的症状：甲型H1N1流感患者通常有39℃以上的高烧、剧烈头疼、肌肉疼痛、咳嗽、鼻塞、红眼等症状 猪流感病毒（拉丁学名：Swine influenza virus，SIV）是猪群中一种可引起地方性流行性感冒的正黏液病毒（Orthomyxoviruses）。世界卫生组织4月30日将此前被称为猪流感的新型致命病毒更名为H1N1甲型流感(influenza A (H1N1))。 【1】猪流行性感冒（SI）是一具有高度传染性的猪只呼吸系统传染病，其特点为发病急骤，突然发烧及其他伤风的症状，复原亦和发生一样的快。SI是一种流行性感冒病毒所引起，与感染人类的流感病毒同属，此病毒具人畜共同感染的特性。猪群出现SI通常与猪场引进新猪群有关。
甲型H1N1流感病毒是A型流感病毒，携带有H1N1亚型猪流感病毒毒株，包含有禽流感、猪流感和人流感三种流感病毒的核糖核酸基因片断，同时拥有亚洲猪流感和非洲猪流感病毒特征。医学测试显示，目前主流抗病毒药物对这种毒株有效。美国疾控机构的照片显示甲型H1N1流感病毒呈阴性 二零零九年流感爆发的起因是一种之前还没在猪群中发现过的H1N1新型流感毒株。四月下旬，当第一起H1N1病毒在美国发现之后，世卫组织总裁根据该机构的国际卫生新条例宣布了“国际性公众健康威胁的紧急警讯”。随着该流感的爆发，2009年5月2日，在加拿大Alberta一个农场的猪群发现了与墨西哥大爆发有联系的该病毒。那些猪被怀疑由一位刚从墨西哥回来的工作人员身上感染了这种新病毒之后出现了类似流感的症状。情况很可能就是这样，不过还得进一步由实验室化验结果来证实。
按照最初的说法，该新毒株看来是一种由至少四类H1N1之甲型流感病毒组合的毒株，包括一类人群中流行的毒株，一类禽鸟中流行的毒株，及两类猪只中流行的毒株。尔后的分析结果建议，它仅仅是由猪只中的两种毒株的基因重组而成。虽然初期报告认定新毒株为猪流感毒株（即一种起源于猪只的人畜互传毒株），后来发现它的遗传基因的绝大部分来源于1998年美国工业化农场首次出现的由三株基因重组而成的病毒。一些国家采取了预防措施，以减少疾病在全球散播的机会。
2012年3于消息，台湾首度发生H5N2高致病性禽流感，彰化、台南都有养鸡场被验出病毒，包括新北、台南也都成立应变中心因应，台湾各地严阵以待。 2012年6月1日，甘肃省景泰县芦阳镇东关村养鸡场鸡只出现疑似禽流感症状。5日，经国家禽流感参考实验室确诊为H5N1亚型高致病性禽流感疫情。【2】
2012年9月11日，广东省湛江市经济技术开发区东简镇部分养殖户饲养的肉鸭出现疑似禽流感症状，发病鸭14050只，死亡6300只；
2012年9月18日，广东省农业厅通报，广东湛江发生一起鸭H5N1高致病性禽流感疫情，疫情已得到有效控制。
微生物无时无刻不在我们身边，对我们的生产及生活有着巨大影响。只有最大限度的了解微生物与环境生态平衡对人类的益处，才能趋利避害，使微生物能够发挥更大的效用。
参考文献：
【1】健康百科网 ．2012-11-27 [引用日期2012-11-27] ． 【2】中国广播网 [引用日期2012-06-8] ．