天津师范大学化学与生命科学学院分子生物学期末实验报告
实验名称:功能基因表达载体的构建 11级水生生物 李雪静 1110170036 2010-1-20
一、 实验目的:构建功能基因kazal的表达载体。
二、实验流程:基因克隆——→小片段(kazal)制备、大片段制备——→kazal基因与目标
载体连接——→蛋白质的诱导表达
三、实验过程
(一)2012年6月6日上午:PCR扩增目的基因A
1.1 实验原理:PCR(polymerase chain reaction)技术是Kary Mullis 在1985年建立起来的
在细胞体外合成DNA的一种方法。依DNA半保留复制原理,利用DNA聚合酶依赖于DNA模板的特性,在附加的两个引物与模板杂交之后,按碱基配对原则经酶促反应合成DNA片段,包括模板变性、引物退火及用DNA聚合酶延伸两个引物之间DNA的一定次数的重复循环,使包括在两个引物5′端限定的特异性片段形成指数式积累。整个过程操作简单,可在短时间内在小管中获得大量的特异的DNA拷贝,这一特点使PCR技术很快被应用到了分子生物学研究的广大领域。扩增DNA的特异性主要取决于引物和模板相结合的特异性,每个循环的反应分为3步:
(1)模板变性(template denaturation):通过加热使DNA双螺旋的氢键断裂,形成游离
于溶液中的单链DNA。
(2)退火(annealing):温度突然降低,反应体系中的引物能准确地配对于被扩增区域的
两个侧翼。这是因为模板分子结构比引物的结构复杂得多,而且引物的拷贝数远高于模板DNA的拷贝数,因此引物与模板DNA形成复合物的概率要大大高于模板DNA两条单链的重新结合。
(3)延伸(extension):在DNA聚合酶、4种脱氧核糖核苷三磷酸及Mg存在的条件下,
DNA聚合酶催化以引物为起始点的5′--3′DNA链延伸反应。n个循环后,一个模板得到的扩增拷贝为2-1。 1.2 实验步骤:
以菌液为模版,进行PCR反应,扩增目标基因。
n
2+
25μl反应体系为: 10× PCR buffer(Mg2+) 2.5μL dNTP 2 μL ExTaq DNA Polymerase 0.2μL 水(灭菌的去离子水) 15.875μL
模板 1μL 上游引物 1μL 下游引物 1μL
反应条件为:94℃,4min
94℃,1min
60℃,1min 25cycle 72℃,1min 72℃,10min
15℃,保温
(二)2012年6月7日 电泳检测kazal基因及回收
并把获得的kazal基因片段接入T载体
2.1电泳检测:
(1)称取0.2g琼脂糖,放入锥形瓶中,加入30mL的蒸馏水和400μL TAE电泳缓冲液,
置微波炉中加热至液体完全澄清,取出后摇匀,冷却到50℃左右,加入EB 染料1μL,摇匀,使之完全溶解
(2)倒入插有梳子的制胶槽中(注意不要形成气泡),凝胶厚度一般为1cm左右,室温冷却
30~40min。
(3)待胶凝固后,取出梳子并将凝胶放入电泳槽中,加入足够的1×TAE电泳缓冲液,覆盖
凝胶约1mm,用移液枪将已经加入3μL上样缓冲液的样品和Marker分别加入到加样孔中(记录点样顺序及点样量)。
(4)接通电泳仪电源(注意正负极,RNA片段从负极向正极移动)。 (5)30分钟左右后,将凝胶放入凝胶成像仪内观察、照相。
2.1.1实验结果:
2.2 割胶回收
(1)在紫外灯下切下含有目的DNA的琼脂糖凝胶,用纸巾吸尽凝胶表面液体并切碎。计
算凝胶重量(提前纪录1.5mL离心管重量),该重量作为一个凝胶体积(100mg=100μL体积)。
(2)加入3个凝胶体积的Buffer DE-A,混合均匀后于75℃加热,间断混合(每2—
3min),直至凝胶完全熔化(6—8min)。
(3)加0.5个Buffer DE-A体积的Buffer DE-B,混合均匀。当分离的DNA片段小段小鱼
400bp时,需再加入1个凝胶体积的异丙醇。
(4)吸取步骤3中的混合液,转移到DNA制备管(置于2mL离心管)中,1200 ×g,离
心1min,弃滤液。
(5)将制备管置于2mL离心管,加500μL Buffer W1,12000 ×g,离心30s,弃滤液。 (6)将制备管置回2mL离心管,加700μL Buffer W2,12000×g,离心30s,弃滤液。
以同样的方法再用700μL Buffer W2洗涤一次,12000 ×g,离心1min。(确认W2
中加入指定体积无水乙醇)
(7)将制备管置回2mL离心管中,12000×g,离心1min。
(8)将制备管置于1.5mL离心管中,在制备膜中央加25—30μL Eluent或去离子水,室温
静置1min,12000×g,离心1min。 2.3 T载体连接 (冰上操作)
5μL体系 solutionΙ 2.5μL DNA 2.1μL T载体 0.4μL
混匀后离心,16℃过夜培养。
(三)2012年6月8日上午: E.coli TOPO感受态细胞的制备 2012年6月8日下午:E.coli TOPO感受态细胞的转化
3.1制备感受态细胞
(1)取25g LB Broth Medium培养基,加入1L蒸馏水,加热溶解后分装在试管中(每管
3ml)。灭菌后冷却备用。
(2)摇菌:取保好的菌种50μl加入到3ml培养基(无Amp)中,37℃,180rpm,摇菌
过夜。
目的:使菌体充分生长,增加菌体的浓度
(2)菌种复摇:将前夜摇菌(37℃,180rpm,无Amp)拿出,抽100μL于3mLLB培养
基(无Amp)中,继续摇2—3h,当看到绸缎样取出。
目的:上述菌液经过摇菌一夜后,肯定过了对数生长期,所以为了获得对数生长期的菌液,须再在一个新的环境里摇1-2h,使还存活的菌继续生长达到对数期,而生长处于末期的菌在新的培养基里也不会存活。
(3)去1mL置于EP管中离心,3000rpm,3mim,倒去上清,若菌体少可在加1mL。 (4)超净工作台下,吸取残留上清,每EP管加100μL 预冷的Cacl2(0.1M)4℃轻柔反复
吹打,放入冰中再放入4℃冰箱,3h后可用。
(CaCl2的作用:在沉淀中加入CaCl2以后,Ca2+会形成羟基钙磷酸复合物,它可以吸
附在大肠杆菌细胞的表面,作用① 使大肠杆菌细胞膜膨胀,膜的流动性变差,呈现晶格状态,进而易使连接产物进入到细胞当中;② 抗DNA酶,防止把转化的DNA片段打断) 3.2 转化
(1)制培养基平板:已灭菌的LB培养基在摸着不烫手的时候,加入氨苄,之后倒平板。
(一般1ml培养基中加1μl氨苄母液,氨苄母液1ml溶液中有0.1g氨苄)
(2)将100μL感受态细胞和5—10μL连接物混匀,冰浴30min。 (2)42℃热击90s,迅速转移到冰浴中2-3min
(3)加800μl培养基(无Amp),培养箱中培养45分钟,条件:37℃,150rpm。
(目的:让菌进一步生长,扩大浓度)
(4)将摇好的菌3000rpm离心5min,弃掉900μl上清,用枪把剩下100μl上清与沉淀混
匀。在超净台中,取此菌液涂在平板上,37℃倒置培养。
(说明:因为T载体上有抗氨苄的基因,因此涂平板后,已转化成功的大肠杆菌感受态细
胞可生长成为单克隆菌落,未转化成功的将不会生长。
注意:① 感受态最好现用现制,最多不能超过24h,但如果为了避免每次现用现制太麻
烦而制了一大批,则可以把它放入液氮中速冻,然后取出保存在-80℃的冰箱里,使用期限为1个月;
② 摇菌震荡的时候,大的试管和锥形瓶可以垂直放着摇,但小的管则要水平放置着摇,这样才会摇的比较均匀充分;
③ 在平板中培养菌体时,平板要倒置,防止蒸发的水分落在平板的菌落上) (四)2012年6月9日上午挑克隆 (1)将3μl Amp加入3ml LB培养基中。
(2)将加入Amp的LB培养基分至6个EP管中,每管500μl。
(3)将过夜培养的平板取出,在超净工作台中,用黄色枪头挑一个单克隆菌落,在(2)
中的培养基中蘸一下。
(4)摇菌37℃,180rpm,4-5h后检测。
(五)2012年6月9日下午 PCR扩增检测克隆Kazal基因 电泳检测 2012年6月10日 摇菌保种 5.1 PCR反应检测Kazal基因
25μl反应体系为: 混合液(buffer,loading,mg2+,酶) 12.5μL 水(灭菌的去离子水) 10μL
模板 (菌液) 1μL 上游引物 1μL 下游引物 1μL
反应条件为:94℃,4min
94℃,1min
60℃,1min 25cycle 72℃,1min 72℃,10min
15℃,保温 5.2电泳检测:
(1)称取0.2g琼脂糖,放入锥形瓶中,加入30mL的蒸馏水和400μL TAE电泳缓冲液,
置微波炉中加热至液体完全澄清,取出后摇匀,冷却到50℃左右,加入EB 染料1μL,摇匀,使之完全溶解
(2)倒入插有梳子的制胶槽中(注意不要形成气泡),凝胶厚度一般为1cm左右,室温冷却
30~40min。
(3)待胶凝固后,取出梳子并将凝胶放入电泳槽中,加入足够的1×TAE电泳缓冲液,覆盖
凝胶约1mm,用移液枪将PCR反应产物和Marker分别加入到加样孔中(记录点样顺序及点样量)。
(4)接通电泳仪电源(注意正负极,RNA片段从负极向正极移动)。 (5)30分钟左右后,将凝胶放入凝胶成像仪内观察、照相。 实验结果:
条带大小与目标基因的大小一致,即可确定其为Kazal基因。