2. 基本原理
由于组成物质的基本粒子是物质，也同时是能量，所以光、热等能量具有物质的性质，相对的物质也会有能量的特性，因此传统物理或是数学的线性观点，就不足以描述我们身处环境的种种现象。近年来大幅发展的混沌理论（Chaos Theory），就是在研究这种所谓的非线性现象（Non-linear System）。
在生命体当中，许多表现都属于非线性现象，例如指纹、动物斑纹的形成等。若以物理学来解释，典型的非线性现象，就如同下图所示，重物的运动轨迹，会在弹簧与黏性阻尼器（缓冲装置）之间振动，直到形成平衡。在生命体中，所有的生理活动与生化反应，其实也都属于类似的非线性系统。所以生命体的活动，其实就是一面消耗能量，一面运用这些能量来让体内的生理活动趋于平衡。健康的生命体，其生理活动都会处于平衡的状态，而所谓的非线性系统分析仪
（Non-Linear System Diagnosis），就是要去探测这些生理活动的平衡状态，找出是否有平衡发生问题的器官组织。
生命体都是由各种分子所组成，而分子又是由基本粒子所组成。基本粒子以波动的形式运动，在这个过程当中，会产生电能，以及磁场。因此生物体本身都具有磁场，这些磁场会形成涡旋状，称为生物体涡旋磁场（Vortex magnetic field）。而身体每一器官和细胞，由于组成分子能量所形成的磁场，因此也都有自己独特的振动频谱。在细胞之间，彼此的磁场交互作用之下，就会有特定的共振频谱特性，这是细胞之间彼此相互影响，并且交换讯息的方式。