（三）单一染色选用一种染料进行的染色，如用铁苏木素染睾丸生精细胞等。
（四）复染色用两种不同性质的染料进行染色的方法，如用苏木素和伊红分别使细胞核及胞质染成两种颜色。
（五）多种染色选用两种以上的染料的染色，如Masson三色染色法。
胶原纤维呈蓝色，肌纤维胞质呈红色，细胞核呈蓝褐色。
（六）进行性染色：又称渐进性染色，将组织成分着色自浅至深，当达到所需要的强度时，终止染色。一般所采用的染液溶度较低，染色过程中应该不时在镜下观察进行控制，这样才能得到染色强度适中的效果。
退行性染色：又称退性染色，先将组织浓染过度，使其超过所需的程度，然后再用某些溶液脱去多余的染色剂，以达到适当的深度，并使不应着色的组织、细胞的某些成分脱去色度，这个步骤称为“分化”。而最终使应该着色部分达到适宜程度。如常规HE染色中的苏木素染核与盐酸水分化过程就是退行性染色。
四、染色中的基本原则（一）染色前的处理：
1、脱蜡至水凡是石蜡切片必须经过二甲苯脱蜡，各级乙醇至水洗的过程。
2、除去汞盐沉淀物对于用升汞固定或含有升汞混合固定液的切片，切片脱蜡后需脱汞处理。