六区：集装箱中心站区、物流中转区、仓储配送区、保税区、物流配套区、城市生态配套区
6.4功能分区
(1) 集装箱中心站区
位于一纵线以东、二横线以南，规划面积556.4ha。分为集装箱中心站、多式联运区、货运配载区、金属材料物流区及铁路散货站场
(2) 物流中转区
位于二横线以北、兴隆场编组站以东区域，规划面积105.4ha。 (3) 仓储配送区：
位于回龙坝旧城改造区北侧，规划面积186.0ha。
(4) 保税区：
位于二横线以南、一纵线以东区域（除铁路集装箱中心站区及土主镇），规划面积302.8ha。分为保税仓储区、保税出口加工区、专业市场.
(5) 物流配套区：
主要位于二横线以北、一纵线以东区域；为物流城提供商贸、加工、居住等服务。规划面积696.4ha。
包括会展商务区、总部商务区、现代物流居住区、旧城改造区、物流装备产业发展区。
(6) 城市生态配套区：
位于一纵线以西区域，规划面积1046.5ha。分为城市综合区以及两个城市居住组团。
6.5道路交通系统：
“综合交通 四通八达”
规划区域以渝遂高速为高速路，南北向一纵线、东西向二横线为快速路，西井大道、新规划团歇路、风回路等为主干道，次干道、支路相互连通的网路道路系统。
6.6景观设计
以商贸区为整个物流城的核心建筑景观，以一纵线、二横线入口景观，保龙水库、大水沟水库、公园、大型绿地为景观节点，缙云山、中梁山、梁滩河为景观主轴线、一纵线与二横线为景观次轴线。山体景观向规划区域渗透的景观体系。
6.7绿化设计
以缙云山、中梁山山体绿化、梁滩河沿岸防护绿地为规划区域外围核心绿地，保龙水库、大水沟水库周围防护绿地、公园、道路防护绿地为规划区域主要绿地，其它组团绿地、街头绿地为补充绿地的点、线、面绿地生态系统。