简答题
第一章 染色体与DNA： 一、真核生物基因组特征
1.真核基因组庞大，一般远大于原核生物的基因组。 2.真核基因组存在大量的重复序列。
3.真核基因组大部分为非编码序列，占整个基因组序列的90%以上，这是真核生物与原核生物的重要区别。 4.真核基因组的转录产物为单顺反子。 5.真核基因是断裂基因，有内含子结构。 6.真核基因组存在大量的顺式作用元件。 7.真核基因组中存在大量的DNA多态性。 8.真核基因组具有端粒结构。 二、原核生物基因组特征
1结构简练：DNA中的大部分结构是用来编码蛋白质
2存在转录单元：在原核生物中功能相关的蛋白的基因往往集中在基因组的一个或几个特定部位如大肠杆菌乳糖操纵子
3有重叠基因：两种或两种以上的基因公用部分DNA序列，则这些基因互称重叠基因 三、真核生物DNA复制特点
1、真核生物每条染色体上有多个复制起点，多复制子（约150bp左右）； 2、复制叉移动的速度较慢（约50bp／秒），仅为原核生物的1／10。
3、真核生物染色体在全部复制完之前,各个起始点不再重新开始DNA复制；真核生物快速生长时，往往采用更多的复制起点。
4、真核生物有多种DNA聚合酶。
5、真核生物DNA复制过程中的引物及冈崎片段的长度均小于原核生物。（真核冈崎片段长约100-200bp，原核冈崎片段长约1000-2000bp。） 6、真核生物线性DNA末端具有端粒结构 四、原核和真核生物DNA的复制特点比较 ① ② ③ ④ ⑤ ⑥ ⑦
复制起点（ori）：原核一个，真核多个； 复制子：原核一个，真核多个； 复制子长度：原核长；真核短； 复制叉：原核多个；真核多个； 复制移动速度：原核较快；真核较慢；
真核生物染色体在全部完成复制前，各起始点的DNA复制不能再开始。而在快速生长的原核生物中，原核生物染色体的复制与细胞分裂同步，可以多次复制；真核生物染色体的复制发生在S期，是细胞
复制起点上可以连续开始新的DNA复制。 分类的特定时期，而且仅此一次。 五、大肠杆菌复制体完成复制的过程 1双链的解开 2 RNA引物的合成 3 DNA链的延伸
4切除RNA引物，填补缺口，连接相邻的DNA片段 六、P-转座子特征
1.当p转座子在转座酶的催化下，会导致不育。 2.p型果蝇存在p转座子，m型没有。
3.p型果蝇在细胞质中存在一个可遗传的、抑制转座酶表达的因子，m型没有
七、转座引起的遗传学效应 1.插入突变 2.转座产生新基因 3.转座产生染色体畸变 4.转座引起生物进化 八、端粒的结构与功能
结构：是一段DNA序列和蛋白质形成的复合体，由多个串联在一起的非转录序列(TTAGGG)组成。 功能：
1、保证线性DNA的完整复制
2、保护染色体末端不受核酸酶水解和不发生染色体的异常重组 九、DNA的修复
DNA修复系统 错配修复 碱基切除修复 核甘酸切除修复 DNA直接修复 SOS系统
第二章 转录与剪接：
一、大肠杆菌转录终止子的分类和特点
1.强终止子－内部终止子（intrinsic terminator）又称为不依赖Rho (ρ)因子的转录终止 特点：
1）终止位点上游一般存在一个富含GC碱基的二重对称区，转录生成的RNA形成发夹结构； 2）在终止位点前面有一段由4-8个A组成的序列，所以转录的RNA的3’端为寡聚U。 2.弱终止子－需要ρ因子（rho factor）又称为ρ依赖性终止子（Rho-dependent terminator）
1）当RNA聚合酶转录到发夹结构时发生一定时间的停顿，这时如果没有ρ因子，转录将会继续下去；只有当ρ因子存在时，转录才终止
2）ρ因子是一个相对分子质量为2.0×105的六聚体蛋白，它能水解各种核苷三磷酸，实际上是一种NTP酶。由于催化了NTP的水解，ρ因子能促使新生的RNA链从三元转录复合物中解离出来，从而终止转录。 3）依赖ρ因子的终止——“穷追”模型（hot pursuit） 二、真核生物内含子种类及其结构特点 1 tRNA 内含子：
长度和序列没有共同性，一般有16～46个核苷酸； 位于反密码子下游；
内含子与外显子间的边界没有保守序列； 2 mRNA 内含子：
1）GU-AG主要内含子 细胞核
5‘端有一保守序列（5’-GUPuAGU-3’）,3’端AG附近有一富含嘧啶的区域 2）AU-AC次要内含子 细胞核 3）Ⅰ类自剪接内含子 线性内含子 4）Ⅱ类自剪接内含子 套索状结构 三、转录的基本过程
1、模板识别：RNA聚合酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程
功能 恢复错配 切除突变的碱基 修复被破坏的DNA 修复嘧啶二体或甲基化DNA DNA的修复，导致变异
2、转录起始：就是RNA链上第一个核苷酸键的产生
RNA聚合酶与启动子结合后，使启动子附近的DNA双链解离，形成转录泡，为RNA合成提供单链模板，并按碱基配对原则，结合核苷酸，在核苷酸之间形成磷酸二脂键（起始复合物）。 3、RNA链的延伸：
σ亚基脱落，RNA–pol聚合酶核心酶变构，与模板结合松弛，沿着DNA模板前移； 在核心酶作用下，NTP不断聚合，RNA链不断延长 4、转录终止：
当RNA链延伸到转录终止位点时，RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键，RNA-DNA杂合物分离，转录泡瓦解，DNA恢复双链状态，而RNA聚合酶和RNA链都被从模板上释放出来，这就是转录的终止。 四、真核生物的原始转录产物必须经过哪些加工过程才能成为成熟mRNA，做为蛋白质合成模板 1、5’端加帽：通过鸟苷酸转移酶在mRNA5’端加上一个甲基化鸟嘌呤，使mRNA免遭核酸酶破坏 2、3’端加尾：提高mRNA在细胞质中的稳定性
3、RNA的剪接：从mRNA前体分子中切除内含子的非编码区，并拼接外显子的编码区形成成熟mRNA的过程
4、RNA的编辑：是指转录后的RNA在编码区发生碱基的突变、加入或丢失等现象。 5、再编码及化学修饰 第三章 表达和修饰：
一、真核生物蛋白质复制起始与原核生物的区别 原核生物：
起始tRNA：fMet-tRNAfMet（氨酰-tRNA合成酶）
所需成分：30S小亚基、50S大亚基、模板mRNA、fMet-tRNAfMet、GTP、Mg2+ 步骤：30S小亚基+fMet-tRNAfMet+50S大亚基??复合物 翻译起始因子：IF-1、IF-2、IF-3
真核生物：
起始tRNA：Met-tRNAMet
步骤：40S小亚基+Met-tRNAMet+60S大亚基=复合物 起始因子(eIF)比较多
二、原核生物的复制起始因子IF1、IF2、IF3的功能分别是什么？
IF-1：仅作为完整的起始复合物的一部分，与30S亚基结合。它的结合在A位，能阻止氨酰-tRNA的进入。它的定位还可以阻止30S亚基和50S亚基的结合。 IF-2：是特异和fMet-tRNAfMet结合并把它带到核糖体上； IF-3：辅助30S亚基与mRNA上起始位点特异性结合 三、肽链延伸过程可以分几步？
1、AA-tRNA与核糖体A位点结合(需要消耗GTP，并需EF-Tu、EF-Ts两种延伸因子) 2、肽键形成：是由转肽酶/肽基转移酶催化(此时A位点的AA-tRNA转移到P位点) 3、移位：核糖体向mRNA3’端方向移动一个密码子，需要消耗GTP，并需EF-G延伸因子 四、原核生物延伸因子EF-Ts、EF-Tu、EF-G的功能是什么，真核生物的延伸因子的功能和作用？
五、肽链的终止 释放因子（原核生物）：
RF1：识别终止密码子UAA和UAG释放因子 RF2：识别终止密码子UAA和UGA
RF3：具GTP酶活性，刺激RF1和RF2活性，协助肽链的释放 释放因子（真核生物）：
eRF1：识别终止密码子UAA,UAG和UGA eRF3：与RF3相似 六、蛋白质合成抑制剂
四环素类 阻止AA-tRNA与核糖体结合
链霉素,新霉素,卡那霉素 干扰AA-tRNA与核糖体结合而引起读码错误 氯霉素 阻止mRNA与核糖体结合
嘌呤霉素 结合在核糖体的A位，抑制AA-tRNA的进入 白喉毒素 抑制EF-Tu的功能 七、蛋白质运转机制 1、翻译-运转同步机制
信号肽假说，信号肽常指新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移的N-末端氨基酸序列（有时不一定在N端）。
信号序列特点：（
（1）一般带有10-15个疏水氨基酸；
（2）在靠近该序列N-端常常有1个或数个带正电荷的氨基酸；
（3）在其C-末端靠近蛋白酶切割位点处常常带有数个极性氨基酸，离切割位点最近的那个氨基酸往往带有很短的侧链（丙氨酸或甘氨酸）。 2、翻译后运转机制 (1)线粒体蛋白质跨膜运转 (2)核定位蛋白的运转机制 第四章 分子生物学技术 一、实时荧光定量PCR的原理 1、原理：
a、在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号累积实现了实时监测整个PCR进程，对起始模板进行定量分析的方法。
b、实时检测PCR扩增，在扩增的指数期对起始模板进行定量
c、Ct值的定义：扩增产物的荧光信号达到设定的阈值时所经过的扩增循环数。此时扩增是呈对数期 d、数学原理：
X Ct:荧光扩增信号达到阈值强度时扩增产物的量；在阈值线设定以后,它是一个常数,我们设为M X Ct=X0(1+Ex) Ct=M Log M=logX0(1+Ex) Ct log X0= -log(1+Ex) *Ct+ log M
结论：Log X0与Ct呈线性关系，根据样品扩增的Ct值就可计算出样品中所含的模板量。 2、方法
1）SYBR Green法 工作机理：
SYBR Green只有和dsDNA结合后才发荧光 变性时，DNA双链分开，无荧光 在延伸结束阶段采集荧光信号。
SYBR Green也能和非特异的双链DNA结合发光，所以必须在反应结束时做熔解曲线分析 优点：
对DNA模板没有选择性，适用于任何DNA 使用方便，不必设计复杂探针 非常灵敏 便宜 缺点：
容易与非特异性双链DNA结合，产生假阳性。但可以通过熔解曲线的分析，优化反应条件 对引物特异性要求较高 2）TaqMan法 工作机理：
5′端标记有报告基团(Reporter, R)，如FAM、VIC等 3′端标记有荧光淬灭基团(Quencher, Q)
探针完整，R所发射的荧光能量被Q基团吸收，无荧光，R与Q分开，发荧光（相隔太近，荧光共振能量转移）