-----Hooniversity Basement-----
下了楼梯后会看到地下满是雪，但是敌人实力没有明显增强。一直往前走。到了地下发电室附近发现没有开门，只要往最右方用水弹把三只玩具老鼠推到适当位置便会开门，但要注意推中了第一只玩具老鼠后，便只有四次机会。
回到了发电室，发现之前曾遇到的Popple及Rookie又再出现。这次他们在打Beanstar的主意，大家要做的当然是打跑他们啦！
增强了实力，但仍然是很败。 *头目战
Popple HP：150
Rookie 250
第二次与他们战斗。这次他们除了增强了实力外，还懂得运用联合攻击，所以必须尽快干掉其中一人。
同样地，当大家攻击小偷时库巴会自动反击，库巴败阵了的话小偷会逃跑。
*经验：180(+120)
*物品：1-Up Mushroom(+Red Pepper) *金钱：33(+33)
正当除掉了麻烦，以为可以带走Beanstar之际，不料之前用来令Beanstar醒过来的机械人掉了下来并不断发声！Beanstar又再发怒并飞走，虽然合四人之力，也不能拉著Beanstar，并且令它分成了四片。而在拉著Beanstar的时候，库巴终於想起了自己的身份。与此同时，它与早已被摔下的三人落得同一命运¨¨
-----Oho Oasis-----
醒来后，会发现自己身处在豆豆王国东方的一个小岛上。岛上没有敌人，而村民虽然懂得说话，但说的话都是怪怪的。不论如何，先往上走进神殿吧！
进去后往左方走，然后在一处有围栏的地方把路奇敲进地下，穿过围栏后再出来。进入正殿后用鎚子把中央的石碑破坏。之后会出现一个怪人，待他消失后碰上方的水晶球，路奇发现他的手竟然可以生电！跟著之前出现的怪人会再出现并教路奇运用雷电的方法，只要紧按相应的按钮，便会形成一个雷球，再放开紧按著的按钮便能攻击。往后在日常选择及战斗的指示中除了鎚子、跳跃外，便会多出了手套之力这一指令。
对著左下方房间内的水晶球用雷电便能开门，会合玛琍欧后便能离开。接著便是到左面旁边的神殿了。进去后往右走，把玛琍欧变小后便能通过小洞。之后用鎚子打破石碑。玛琍欧便会变回原状，然后又会出现另一个怪人。同样接触上方的水晶球，玛琍欧便能运用火炎，之后又会有人出来教大家如何运用火炎，大致上跟路奇的没有分别。之后到加下方的房间对著小洞用火炎，门便会开启。大家终於懂得最后一项指令了。
手套之力的运用方法：不少敌人也是有属性弱点的，只要针对不同敌人用火炎或雷电攻击，对该敌人的损害便能大增。另外手之力也有不少其他用途：例如路奇能令一些需要把水晶球注满电力的门开启，也能使喝满水的玛琍欧把水吐在近距离的地上。而玛琍欧则能燃点炸药等。
两个人也懂得运用手套之力后可试一试用手套之力向村民攻击，红色的村民要用火烧，蓝色的则要用电，这样便会发生战斗，得胜了便会Oho Jee Symbol或Oho Jee Wear。
走到村的最右下方，用火炎及雷电来开启通过水管的门。之后玩家便要在海底活动了。
-----Seabed(海床)-----
玩家进入水管后如果要向上爬的话，只要紧按A及B键，然后按上便成。而只要把指令变成跳，然后不断连打，便能游泳。
进了海床后往左走，用玛琍欧在右上方的小洞生火，阻著路的珊瑚便会消失。之后便需要两兄弟不断地游泳，游到左下方有路离开。之后会看到水母型的水晶球，对著它用雷电便能开门。接著游泳游到最左面，会看到上方有洞穴可离开。
接著便是考验大家记忆力的时间。按下按钮后，由左至右，依1、4、3、5、2这次序生火，之后挡路的珊瑚又会消失。接著走到最左面会发现有水管回到水面。
终於重见天日了，和平看来也将再次重现！
第四章-碧琪公主的来访
就在这时，极为狼狈的Cackletta及Fawful碰到了在天空上掉下来而快要半死的库巴。不幸地，Cackletta看到了库巴后便决定入侵他的身体，结果¨¨
-----East Beanbean(豆豆城东面市郊)-----
在出了水管后，敲下旁边的按钮后走了不久王子便会出现。并告诉玩家碧琪公主将会来访，要玩家到豆豆机场去迎接她，而机场则在豆豆城的南方。说罢，王子便又离开了。
大家先别急著去机场，先到处走一下吧。只要在豆豆镇右面的桥出来后往右上走，之后便会看到有一扇门需要用雷电来开启。现在既然玩家已懂得运用雷电，便可以打开该门。
一直走，最后会看到一个洞穴，进去后会发现之前为玛琍欧和路奇制造鎚子的铁匠。他们会替玩家升级鎚子，之后大家便能破坏紫色的石头了。另外，在洞穴右方会有一个大笨石，并问玩家是否愿意付出200枚金币来玩小游戏。只要玩小游戏得胜后便有机会习得一招新的联合攻击。
在豆豆城东北面的市郊，利用旋转跳走到最右上方，之后会看到一个老伯及不少种子。只要先让玛 琍欧喝水，跑到种子附近后再用路奇电玛琍欧，他便会在近距离吐水，种子便会发芽。踏上发了芽的植物后便能到上方的巨型鼹鼠拿宝物。
在豆豆城北面的市郊有一个水晶球，只要路奇对著它用雷电，便会有台阶出现，能进入上方的洞穴。洞内主要是要两兄弟一起撞一半绿色一半红色的Simu Block来开启新道路。只要动些脑筋，应该不是问题，最后便能跟洞内的巨型鼹鼠拿Wool Trousers。
跟著大家便要到机场了。在豆豆城南面的市郊有一处有两个水晶球并列的地方，用路奇对著它们用雷电，便能开启到机场的路。
-----Beanbean Airport(豆豆机场)-----
到达机场后，有人会通知玩家到跑道。而到了跑道后，发现跑道满布食人花，而玩家要做的当然是解决这些食人花了。但是要注意，就算打败了食人花，离开后它又会出现。所以玩家应该先控制玛琍欧去喝水，然后向食人花吐水，之后用路奇电它们便行。料理掉五朵食人花后，在跑道中央的蛋便会诞出¨¨巨型食人花！
蛋怎麼会孵出食人花？ *头目战
Mom Piranha HP：220 Piranha Plant(食人花) x2 30
在前面的食人花在被攻击后会不断补充，所以不用理。但要注意一旦Mom Piranha受攻击时，它们会自动反击的。而当Mom Piranha与前面的食人花是同一颜色时，它便会自动回复体力。
当Mom Piranha是红色时用雷电攻击，蓝色时则用火炎攻击。
*经验：412
*物品：Spiny Badge A *稀有道具：无 *金钱：52
解决它后，回去跟Lady Lima说话，之后碧琪公主所乘的飞机便会降落。
-----Beanbean Castle(豆豆城)-----
碧琪公主出来后发现碧琪公主的声音其实没有被盗走。原来之前被盗去声音的是假扮的，那其实是Birdo假装的(怪不得Beanstar会失控了)。因为库巴硬拉著玛琍欧和路奇上它的航空母舰，结果碧琪公主便没有机会去告诉他们了。
接著当轮到玩家的自由时间时，先到城堡最上方的房间，会发现碧琪公主正在与女王谈话。原来她想到Little Fungitown去访望从香菇王国移民到豆豆王国的香菇人。但是若果要到Little Fungitown便必须经过Teehee Valley，一个满布怪物的沙漠。碧琪公主还问玛琍欧兄弟会否陪伴著她，结果当然是肯定的(路奇尝试说不答应，结果便被玛琍欧一记敲到地裏¨¨)
只要玩家购买了新装备后，便随时可以往Teehee Valley出发。而只要到豆豆城东北方市郊最上方的地方，便会看到有道路被紫色石头挡著，那便是通往Teehee Valley的路。
-----Teehee Valley-----
进入后碧琪公主及首相便会赶到，然后碧琪公主便会强制性被怪物捉走，要救她的话便要进最左方的水管跟她说话，之后便能正式开始穿越沙漠之旅。
首先要留意的便是绝不能让碧琪公主碰到敌人！否则她便会被捉走，又要花功夫进水管去救她。而即使画面上没有敌人，如果碧琪公主跑离画面太远的话也是会被抓的。另外只要跟她
谈话或没有去路时便会转身。
最好每次先清除掉画面上所有看到的敌人，然后才慢慢想如何开掉挡路的门，并尽量令碧琪公主逗留在门前，否则只会更花时间。
第一场景可以说是最容易的，只要紧贴著她便行。第二场景也没甚麼难度，只要在她跑=走到门之前撞左方的惊叹号方块便成。第三场景比较麻烦，先清除所有敌人，顺道按下上方墙壁的按钮。待公主回程时，以极速跑到上面破坏石头，之后碧琪公主会再一次走到门前，此时才找路奇躲到木桶内敲右面的按钮。第四场景，这次战略差不多，先清除掉所有敌人，回头后重新再来时用特高跳跳到台阶上，然后不断用旋转跳，最后敲惊叹号方块即可。
之后会看到碧琪公主因为性急而擅自跑到上方去，结果果然被怪兽袭击。而那些香菇人又因胆小而不敢去拯救碧琪公主。结果当然又是要表演英雄救美¨¨
一个弱点足而致命。 *头目战
Trunkle HP：110
如果就这样攻击他的话大家可能会感到很吃力，但其实只要攻击他头上的植物便能很快地消灭他的了。而且取得的经验值和道具也较多，可以说一举数得。
如果想挑战难度，也可以攻击他的身体，而他有时会一分为四，此时要分别那才是他的正体。另外，在他吸气时别碰一些颜色怪怪的香菇，否则会中毒。
*经验：1000(+30)
*物品：Super Nut(x4)，1-Up Mushroom *病有道具：Lucky Bros. *金钱：376
打败他后，香菇人便会出来迎接，而只要乘电梯便能到Little Fungitown。
-----Little Fungitown-----
在一番迎接后，碧琪公主便会先到镇中的城堡(？)休息，而玩家也可到处一探究竟，这儿有防具店、道具店、游戏店等。但大家最好先往右上方走，接著会看到一个大的黄色香菇平台，