Ion torrent微生物(细菌)全基因组重测序文库构建实验方案(2)

2019-02-16 12:46

文库片段 25μL

Total 130μL 放入PCR仪中,按以下循环进行: 95℃ 5min 95℃ 15s

58℃ 15s 8个循环 70℃ 1min 4℃ hold

6.2 扩增产物纯化

1)体系中加入195μL Agencourt AMpure XP Reagent 2)上下震荡5次,瞬时离心后室温放置5min

3)将离心管放置于DynaMag-2磁力架3min,至溶液澄清,小心去除上清,离心管保持放置在磁力架上

4)离心管放置于磁力架上不移动,配置新的500μL 70%乙醇,加入,30s后,盖上盖子颠倒混匀2次,放回磁力架至溶液澄清后,小心除去上清 5)重复第四步

6)瞬时离心后,放置于磁力架上,用20μL墙头小心吸去多余的液体 7)将离心管留在磁力架上,室温风干不超过5min

8)取下离心管,加入20μL Low TE缓冲液,盖上盖子,上下颠倒混匀5次,旋窝震荡10s,充分混合

9)瞬时离心后,将离心管放于磁力架上至少1min,溶液澄清后,将上清移入一支新的1.5mL EP管中(不可吸到磁珠)

10)将转移的离心管放置到磁力架上至少1min,将上清液小心转移到一支新的1.5mL离心管中

7.Agilent Test & Qubit Qualify

片段大小在200bp左右,片段浓度不低于1μL/mL

8.Ion OneTouch

在Ion OneTouch仪上使用Ion OneTouch 200 Template Kit完成文库片段与微珠的连接、乳液PCR、微珠富集以及芯片上样等操作,完成测序芯片的准备。 9.上机测序

使用Ion PGM进行测序。


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