主要是植株茎干水渍状由上往下软腐而腐烂，造成死苗，尤其幼苗生长期更为突出。
防治方法：雨季禁止植株基质积水或者植株带水过夜，减少氮肥使用量，用高磷钾肥或者追施0.05％硫酸钾等肥料增强抵抗力，发现病株立即连其周围基质一起清除，严重时用农用链霉素600倍液和扑海因1000倍液混合喷洒。
（5）叶锈病： 病症及流行时间：该病通常在7~8月多雨季节发生。首先受害茎叶上出现淡黄色的斑点，后变成向外凸出的粉黄色疙瘩，最后孢子囊破裂而散发出许多粉末状孢子，危害严重时，使茎叶枯萎死亡。
防治方法：种植地块不能过湿，雨后及时排水，根据情况减少覆盖物，促进根系通风透气；严重时用粉锈宁800倍液喷洒页面，每隔5~7天喷洒1次，连喷3次。
（6） 疫病： 病症及流行时间：病菌在病株或以卵孢子等在病残体及土壤中越冬；通过风雨或水滴低溅传播，潜预期短，3~5天左右。该病发生早晚与降雨早晚及次数、温室内空气相对湿度密切相关，多雨、高湿（85％~95％）时易发病且较为严重。喷水、通气差加重病害发生。气温低于25℃，连续阴天或阴雨后晴易流行该病。该病常使植株幼嫩部分腐烂，丧失商品价值。该病使植株上部心叶基部发生水渍状褐色腐烂，并向叶尖端扩展；该病引起茎呈水渍状褐腐，病重时使茎的1／3~1／2烂掉。
防治方法：雨后及时排水、盆中不积水、温室湿度控制在80％
左右时防病的重要方法；及时清除病残体；病土病盆及时处理，不可再利用；铁皮石斛应单臵一棚种植，不可与其他寄主（如凤梨等）相邻种植或同臵一室。发病初期喷药，叶心病部涂药，不可以滞留药液。常用药剂有72％克露或霜脲?锰锌可湿性粉剂600倍液、69％安克?锰锌可湿性粉剂500倍液、60％灭克可湿性粉剂1000倍液等。 5、虫害防治
（1）蚜虫： 主要危害新芽和叶片。5~6月为蚜虫猖獗危害期，当嫩株茎尖上出现蚜虫时，可选用克蚜敏600倍液或者70％吡虫啉2500倍喷洒，每隔5天喷洒1次，连喷3次。
（2）蜗牛：蜗牛在云南地区南部1年可多次发生，以雨季危害较重。虫体爬行于石斛植株表面，舔食石斛茎尖、嫩叶，舔磨成孔洞、缺口或将茎苗弄断。防治方法：选择晴天的傍晚，将蜗克星或梅塔颗粒撒于种植床上下，1~2天内不宜浇水，药剂用量应根据虫害发生情况合理使用。亦可采用人工捕捉的方法进行防治。
(3)石斛菲盾蚧: 该虫寄生于石斛叶片边缘或叶背面，吸取汁液，引起植株叶片枯萎，严重时造成整株枯黄死亡。同时还可引发煤污病。5月下旬是其孵化盛期，可用敌杀死1000倍液喷洒或1:3的石硫合剂进行喷杀，效果较好。已形成盾壳的虫体，可采取除老枝集中烧毁或人工捕杀的方法防治。
(4)地老虎：该虫在云南南部可常年发生，以春秋季节危害最重。其在傍晚和清晨食铁皮石斛的茎基部，造成石斛死亡。可在早春或者初秋使用辛硫磷2000倍液灌施预防；或者清晨露水未干时采用人工
捕捉的方法防治。