circrna数据库再更新,这次不只有肿瘤了
关于circRNA相关的数据库,我们已经专门写文章介绍过了:环状RNA研究有哪些好用的数据库,下面我们介绍两个新的数据:
第一个是CSCD: a database for cancer-specific circular RNAs.Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D925-D929.地址:http://gb.whu.edu.cn/CSCD/这个数据库是肿瘤与circRNA相关的:左侧是搜索框,右侧是显示框,比如我们可以在左侧第二个输入框选择细胞类型,比如肺癌细胞系A549:在右下方可以看到miRNA应答原件(MRE)和RNA结合蛋白(RBP)的信息:
第二个是circRNADisease:a manually curated database of experimentally supported circRNA-disease associations.Cell Death Dis. 2018 Apr 27;9(5):475. 网址:
http://cgga.org.cn:9091/circRNADisease/这个数据库收录了48种疾病和330条circRNA,共有354条信息,数据库可以浏览、搜索和下载,比如我们直接单击左侧的动脉粥样硬化,右侧就可以看到相应的信息:以及报道该circRNA与动脉粥样硬化的文章:另外,我们还可以根据circRNA、母基因以及疾病进行搜索:当然,最直接的就是下载了:这是下载好的excel,我们也可以直接搜索查看:好了,总体上来说,
circRNA相关的数据库还是比较少,期待更多好用的数据库出来!