1、管理人员素质偏低
大部分养殖场的管理人员农民出身，没有经过系统的奶牛养殖和管理理论学习，都是在实践中摸索或者参加一些培训班。因此，牛场的管理不够科学、合理，成本较高。同时，几乎所有的场主也都提出渴望得到更多管理方面的信息。
调研中也发现了可喜的变化，即接受过正规大学教育的本科毕业生投身到奶牛场的管理中，如蒙德隆奶牛养殖有限责任公司的负责人、圣达奶牛场负责人等。
2、牧场基础设施建设有待完善
被调研的22家奶牛场中仅有5家采用现代散栏式饲养，并配有由沙土、粗沙或清水沙铺垫的牛床，仅占被调研奶牛场的22.7%；1家新建的牛舍采用散栏式饲养，并配有牛床，但旧牛舍采用散养方式，没有卧床；2家采用散养并分别配有粗沙、牛粪+沙土铺垫的牛床；14家采用无凉棚式的散养模式，也没有牛床，占被调配奶牛场的63.6%。 （二）资金严重短缺
大部分的奶牛养殖场都反映，他们都有提高奶牛福利的打算，想进一步改造
牛场的环境和设施，可因为缺乏资金而不得不搁浅计划。例如，不少养殖场想改建牛舍、建牛床、购买TMR机等，但贷款无门，国家扶持力度不够，使得养殖场难以进一步发展，奶牛的素质和原奶的产量、质量难以得到提高。 （三）原料奶定价机制不合理
目前，虽说以质论价，但所有原料奶的收购价格及标准均由乳品企业制定，养殖场和奶农没有任何话语权。对于很多大规模的牧场来说，他们投资大且管理规范，原料奶的质量有保证。他们急切希望建立原料奶的议价机制，使得奶牛养殖场能在平等对话的基础上，和乳品企业共同协商原料奶收购价格，改变以往乳品企业说了算的格局。
（四）第三方检测机制尚未建立
除原料奶的价格和标准由企业制定外，原料奶各项指标的检测也由乳品企业执行。当奶牛场对乳品企业的检测结果表示异议时，无法找到拥有仲裁权的第三方检测机构对产品进行复检。
在调研过程中发现，2009年1～5月，鄂尔多斯市伊金霍洛旗万隆兴奶牛养殖场遇到过企业以抗生素残留超标为由拒收原料奶1次，回来倒掉，共倒奶2.5
吨（3.45元/kg）；在此期间，昊邦乳业曾因冰点和抗生素残留超标被乳品企业拒收原料奶2次，不合格原料奶被添加色素，奶牛场只得将原料奶倒掉，2次共倒奶6.6吨（3.40元/kg）。奶牛场负责人均认为原料奶的质量没有问题，但要进行复检，需到呼和浩特，不但费时费力，还会影响第2天原奶料的交售。这种情况在呼和浩特和包头未曾遇到。
（四）青贮充足，但优质苜蓿供给不足
青贮主要采用全株玉米青贮，主要通过与当地周边农民签订协议购买，价格一般为0.20～0.40元/kg，可满足奶牛场的需要。
奶牛要产优质奶，必须吃好的牧草，特别是营养价值较高的苜蓿。但是由于苜蓿价格较高，许多奶牛场只能用羊草代替苜蓿或只用于饲喂高产奶牛。
调研结果显示，22家牧场中有14家饲喂了苜蓿，占63.6%。其中，有9家的苜蓿全部外购，主要来源地为宁夏、甘肃和内蒙古当地，购自宁夏和甘肃的苜蓿价格为1800～1900元/吨，购自当地的为1400～1500元/吨；有5家全部自己种植或自己种植一部分外购一部分，能够实现自给自足的仅伊利第七牧场（价格为1350元/吨，明显低于外购苜蓿），其余4家可以满足20%～80%。饲喂羊草的奶牛场共19家（其余3家因饲喂苜蓿而未饲喂羊草），价格在850～1000元/吨，主要来源地为东北和内蒙古的锡林郭勒盟。
五、对策建议
一是继续推进规模化、集约化、标准化养殖进程。从此次调研结果看，内蒙古规模化奶牛场在中国奶业遭受“三鹿牌婴幼儿奶粉事件”冲击，消费市场低迷的情况下，仍然保持了良好的经济效益。在内蒙古，规模化的方式可以采取奶联社的模式，也可以采取漠南奶业专业合作社的模式。
二是对奶业继续给予政策和资金方面的扶持。贯彻落实《国务院关于促进奶业持续健康发展的意见》、《奶业整顿的振兴规划纲要》以及内蒙古相关扶持奶业发展的各项政策和补贴，特别要做好规模化养殖场建设的补贴、牧业机械补贴、冻精补贴等；对于奶牛养殖业发展所需的饲料用地，应按照每头天3亩地的标准给予用地优惠政策，鼓励大力发展草业。
三是尽快建立合理的原料奶定价机制。应建立由奶业协会、奶农、乳品企业
等组织组成的原料奶定价协调委员会，根据原料奶生产的奶料比，定期公布合理的原料奶收购参考价格。
四是对规模化养殖场提供技术服务。奶业协会和相关部门应加大对奶牛场的技术培训和服务，以提高其饲养管理水平。