实验七:TA克隆(8课时) (备选)
1)实验目的
TA克隆是常用的分子生物学的方法,具有操作方便、快速等优点。本实验学习TA克隆的使用技术,掌握有关的技术。 2)实验原理
TA克隆方法(Original TA Cloning Kit)把PCR片断与一个具有3‘-T突出的载体DNA连接起来的方法。因为PCR反应中所适用的聚合酶具有末端转移的活性,通常在3'加上A。例如:Taq聚合酶同时具有的末端连接酶的功能,PCR反应时在每条PCR扩增产物的3`端自动添加一个3`-A突出端。只有用经过特殊处理的具有3’-T突出末端的DNA片断才能通过T/A配对进行连接。 通过PCR的方法扩增目的基因片断的过程中,由于往往不清楚目的基因的DNA序列,获得的目的片断通常需要通过TA克隆的方法,重组到T-载体中,通过序列测定清楚DNA序列。由于在PCR过程中,使用的DNA聚合酶不同,往往分为2种情况:(1)使用不同的Taq酶,在PCR扩增循环结束后,加上72℃ 10分钟一个过程,Taq酶可以在扩增产物的3末端加上A,因此PCR产物回收纯化后可以和T载体直接连接。(2)使用高保真的DNA聚合酶,如pfu酶,由于其不能在扩增产物的3末端加上A,得到的DNA序列为钝端,因此,需要在回收纯化后进行加A的过程,通常是以PCR回收产物为模板,加上一定量的普通Taq酶和反应液,加入dATP(或dNTP), 72℃ 10分钟,然后将加A产物直接用于TA连接。 3)实验步骤 1、PCR产物的纯化
琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增为单一条带,用PCR产物纯化试剂盒进行
纯化。具体步骤参照试剂盒说明书。 2、TA克隆
连接:纯化后的PCR产物与T载体混匀,并加入5μL的Solution I(含连接酶),置于PCR管中,16oC下过夜连接。
转化:取5μL的连接产物置于eppendorf管中,加入DH5α感受态细胞混匀,冰上放置30min;将管放到42oC水浴热激90s,冰浴2min后,加入800μl LB液体培养基,37oC,200r/min培养1h,稍离心吸取适当体积菌液涂布在含有氨苄青霉素、IPTG\\X-gal的LB培养基平板上,37oC倒置培养12-16h。
蓝白斑筛选:将平板上长出的白色菌落随机挑选若干于含LB培养基(加有氨苄霉素)的试管中培养,培养到一定的时间后,以菌细胞为模板进行PCR检测。从检测呈阳性的克隆送往公司进行序列测定。将测序结果用BLAST软件与GenBank已经录入的16S rRNA基因序列进行同源性比较。