半不连续复制:在生物中普遍存在的这种前导链的连续复制和滞后链的不连续复制方式,称为DNA合成的半不连续性。
DNA解旋酶/DNA解旋蛋白(DNA unwinding protein):催化双螺旋DNA的解旋和解链,该过程需水解ATP提供能量。
DNA引物酶(Primase)
RNA聚合酶。
DNA连接酶(DNA ligase )
复制是在一段RNA引物上加入脱氧核苷酸,而催化引物合成的
催化冈崎片段间磷酸二酯键的形成;
引发体 —— 为含解螺旋酶、引物酶和DNA复制起始区的复合物。
端粒酶:由蛋白质和 RNA 两部分组成,是一种特殊的反转录酶。
滚动复制 —— 某些低等生物的复制方式;复制不需要引物。
D环复制 —— 线粒体 DNA 复制方式。
第六章
Transcription(转录):以DNA为模板合成RNA的过程。
不对称转录 1、在DNA双链分子上,仅一股链可转录 2、模板链并非总在同一链上
模板链(template strand):指 DNA分子中可转录成 RNA的一股链。
编码链(coding strand) :指与模板链互补的一股链。
依赖 ? 因子(Rho factor)的转录终止—— 可识别来自RNA产物的终止信号,而不是来自DNA摸板。
非依赖 ? 因子的转录终止—— 终止子特点是RNA产物具有发夹结构(茎-环结构)和一段富含polyU片段。
II类启动子(clsaa II promoters):能够被RNA聚合酶II识别并结合的启动子。 TATA box:位于转录起始部位上游约25bp 处,是目前研究最多的转录元件。
GC盒:保守序列是CCGCCC,常以多拷贝形式存在于-90处。 CAAT盒:保守序列是CCAATCT,一般位于上游-75bp左右。
起始子(initiator):II类启动子在转录起始部位周围有一段保守序列,序列为PyAPy (Py为嘧啶碱基),其中A为转录起始位点.
增强子(enhancer):具有较强的转录激活作用,长度一般为100-200bp,可以出现在加帽位点的上游或下游,距离加帽位点数百bp到数个kb,最远可达±50kb。
减弱子(dehancer):位于某些基因的上游或下游远端,对转录有减弱作用。
静息子(silencer):位置不固定,有抑制某段基因表达的作用。
上游激活序列(upstream activating sequences, UASs):存在于酵母中,位于启动子的中远上游,作用类似于增强子。它仅影响转录程度,对位点选择无作用。有方向性,不能在启动子下游起作用。它的识别位点为ATGACTCAT。
II类转录因子:普通转录因子与RNA聚合酶结合形成起始前复合物(preinitiation complex)
转录后加工(post-transcriptional processing)在细胞内,原初转录产物经过一系列变化转变为成熟的 RNA分子的过程
成熟mRNA前体: 核内不均一RNA(heterogenous nuclear RNA, hnRNA)经转录后加工而来。
hnRNA —— 成熟 mRNA 前身(含非编码内含子)
snRNP(small nuclear ribonucleoprotein,小核核糖核蛋白体)—— 由snRNA和核内蛋白质组成,作为RNA剪接场所。
外显子(exon) —— 在断裂基因及其初级转录产物中出现,并表达为成熟RNA的核苷酸序列。
内含子(exon) —— 隔断基因线性表达而在剪接过程中被除去的核苷酸序列。
断裂基因(splite gene) —— 由若干内含子和外显子互相隔开,但又连续镶嵌的基因。
剪接体(splicesome)—— 由snRNP与hnRNA结合的复合体。
mRNA 编辑(mRNA editing)—— 指在转录水平上发生改变 RNA 编码序列,致一种基因产生不止一种蛋白质的加工方式。
核酶(ribozyme) —— 具有催化功能的RNA
第八章
(Gene expression) 基因表达就是基因转录及翻译过程。
组成性表达(constitutive gene expression)
管家基因(Housekeeping gene):相对缺少时间和空间特异性而持续表达的 一类基因。
诱导和阻遏表达( induction and repression ):受环境因素影响而呈现出基因表达升高(诱导)或降低(阻遏)的现象。
promoter启动子——能被RNA聚合酶识别、结合并启动基因转录的一段DNA序列。
操纵序列 (operator,O):是阻遏蛋白结合位点,与启动子序列毗邻,常交叉、重叠。介导负性调节
顺式作用元件(cis-acting element)真核生物基因表达调控序列顺式作用元件(cis-acting element)
特异因子:决定RNA聚合酶对一个或一套识别启动序列的特异性识别和结合能力 ,如?因子:当细胞从基本的转录机制转入各种特定基因表达时,需要不同的?因子。
阻遏蛋白(repressor)结合操纵序列,阻遏基因表达
激活蛋白(activator)与启动子附近DNA序列结合,促进RNA聚合酶与启动子结合
转录因子(transcription factor),可分为:
反式作用因子(trans-acting factor), 大多数转录因子由某一基因表达后,与特异的顺式作用元件作用(DNA-蛋白质)激活另一基因的转录。 顺式作用因子(cis-acting factor):极少数可识别和结合自身基因的调节序列,调节自身基因的开启或关闭。
蛋白质– DNA相互作用(protein-DNA interaction):反式作用因子与顺式作用元件特异识别和结合。
蛋白质–蛋白质相互作用( protein-protein interaction ): 蛋白质之间相互作用可直接或间接结合DNA。
衰减子(attenuator):提前终止转录,调节基因表达的DNA序列。位于转录起始点前,存在前导序列(162nt)中,当trp浓度很高时, 在与转录偶联的翻译过程中,在mRNA分子上形成一个不依赖?因子的终止结构。
启动子(promoter):含有一组转录控制组件(module)
增强子(enhancer): 增强启动子转录活性的DNA序列。
沉默子(silencer)负性调控元件,当结合特异调控蛋白因子时,对基因转录起阻遏作用。
基本转录因子:是RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子,决定三种RNA转录的类别。
特异转录因子:个别基因转录所必需,决定该基因的时空特异性表达。