having never developed anything equivalent to the gills of their earlier marine incarnation.
解析：cease to do是指停止做某事。reverted to指恢复原来的样子。这里的having never developed是现在完成时做伴随状态的用法，表示在never developed ...的状态下still breathe air. 参考翻译：鲸鱼(包括我们称作海豚的小鲸鱼)，儒艮以及和它们关系密切的海牛一起不再在陆地生存，而完全回到像它们祖先一样的海洋生活。它们甚至不上岸繁殖。它们虽然仍旧呼吸空气，却没有进化出像早期海洋生物一样的用于呼吸的类似腮的器官。
2.You might think, therefore, that modern land tortoises have probably stayed on land ever since those early terrestrial times, as most mammals did after a few of them went back to the sea. 解析：这个句子中的ever since既可以单独使用，也可以在它后面添加名词或从句。ever since非常容易与since ever混淆，后者是副词，只能放在句首或句尾使用。此外，这句话中that引导宾语从句，而as引导的是方式状语从句。
参考翻译：也许你会认为，现代的陆栖乌龟可能自早期有陆生物种以来就一直生活在陆地，就像是除了少数哺乳动物返回水中生活以外，大部分的哺乳动物还是在陆地上生活一样。