核酸数据库
? International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC)包括 ? GenBank
[美] http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank ? EMBL
[欧] http://www.ebi.ac.uk/embl/
? DDBJ
[日] http://www.ddbj.nig.ac.jp/ ? 每天这三个数据库作数据同步操作
? 在任何一个数据库操作(查找、投递数据等)是等效的 BioSino
? www.biosino.org ? 是中国自主开发的核酸序列公共数据库 ? 发表我国学者提供的核酸序列,并接受注册登记 ? 有CDNAP和DDIB两个产品
? http://www.cdnap.org/ ? http://www.biosino.org/DIDWeb/index.html 蛋白数据库
? 一级(次)序列数据库
? PIR(全面,注释少), MIPS, SWISS-PROT(注释多), TrEMBL, NRL-3D(三维)
? 序列复合数据库: NRDB (NCBI,全,更新快), OWL(
注
释
多
,冗
余
低
),
MIPSX,
SWISS-PROT+TrEMBL(冗余更低) ? 二级(次)序列数据库
? PROSITE (motif,MSA), PRINTS (motifs,MSA), BLOCKS(非正则表达式), Profile(全序列), Pfam (HMM) ? 三级(次)序列数据库: INDENTIFY