蛋白质修饰位点预测详解

蛋白质组学

蛋白质修饰位点分析

目录

实验目的........................................................................................................................................... 2 实验平台........................................................................................................................................... 2 实验过程........................................................................................................................................... 3

一、“人类connexin43”蛋白质磷酸化位点修饰 ................................................................. 3

1、“人类connexin43”蛋白质序列下载 ....................................................................... 3 2、uniprot数据库查看蛋白磷酸化位点 ........................................................................ 4 3、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点 ......................................................................... 6

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蛋白质组学

（1）DISPHOS 1.3预测未知蛋白磷酸化位点 ..................................................... 6 （2）PhosphoSitePlus预测指定蛋白磷酸化位点 ............................................... 11 4、“人类connexin43”蛋白质磷酸修饰结论 ............................................................. 14 二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰 ............................................................................... 15

1、N型糖基化位点预测 ............................................................................................... 15 2、O型糖基化位点预测 ............................................................................................... 18

（1）哺乳动物O型糖基化位点预测 .................................................................. 18 （2）真核生物O型糖基化位点预测 .................................................................. 20 3、uniprot数据库查看蛋白质糖基化修饰位点 .......................................................... 22 4、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论 ................................................................. 22

实验结论......................................................................................................................................... 23

（特别提示:ctrl+单击目录下的标题链接，可以跟踪标题；ctrl+单击标题后的图标

可以返回目录）

实验目的

? 找出“人类connexin43”蛋白质上面的所有可能磷酸化位点，并说明为什么（注释）

? 找出“人类血红蛋白”上面的糖基化位点，注释结果

实验平台

? uniprot数据库: http://www.uniprot.org/(查看蛋白的修饰情况)

? 预测未知蛋白磷酸化位点

DISPHOS: http://www.dabi.temple.edu/disphos/

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蛋白质组学

PhosphoSitePlus:http://www.phosphosite.org

? 预测未知蛋白的糖基化修饰位点

N型糖基化位点预测：

http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/ O

型

糖

基

化

位

点

预

测

：

http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/

http://www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/

实验过程

一、“人类connexin43”蛋白质磷酸化位点修饰

1、“人类connexin43”蛋白质序列下载蛋白序列： fasta.txt

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蛋白质组学

2、uniprot数据库查看蛋白磷酸化位点

网站链接： http://www.uniprot.org/

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蛋白质组学

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