Nanodrop_2000中文操作手册(6)

2019-03-11 13:45

光谱图显示了当前样品校准到1mm光程下的吸光值,光程信息显示在Y轴上。 光谱图的右侧,包括下列内容:

Sample ID-输入样品名称区域,在检测样品前应输入样品名称。

Auto Pathlendth-在检测高浓度样品时自动调整合适的光程。如果选择了这个功能,在220nm到840nm间任何波长下的吸光值为1.25左右时,检测使用短的光程。对于波长在190nm到219nm范围内,1mm光程下的吸光值为1.0左右时改为短光程检测。

? 短光程对于高浓度样品检测是非常有用的。虽然这个功能对其他应用是自动进

行的,在UV-VIS功能下,用户可以选择自动光程功能或者限定基座检测光程为1mm。在其他情况下,吸光值数据将显示为1mm光程下的数据。

基线校准-自动设定基线,样品检测的数据以基线的数据为参考。默认的波长为750nm,如果不使用基线校准,光谱可能会发生基线偏移。

添加波长-在版面上添加指示波长和指示吸光值。当一个样品被检测,把鼠标十字号指示移动到感兴趣的波长并点击添加波长,或者可以在选择区域输入波长即可。

Clear Wavelengh-清除波长界面上的一个输入。 Clear All-清除波长界面上的所有输入。 在其他应用中,在图谱显示狂中右击鼠标可以产生一个多选择的菜单框。在UV-VIS中,可以选择开启/关闭一个额外的样品标签。样品标签选择可以显示或者隐藏每个选择波长下的吸光值。右击一个标签可以编辑,改变颜色和字体,旋转和删除。

进行UV-VIS检测

1. 在主菜单中选择UV-VIS功能,如果出现波长确认窗口,确保检测臂放下,并点击

OK。

2. 默认用750nm对重镉酸盐进行标准化。可以选择其他参考波长或者通过去选择

Baseline correction来不选择光谱校准。

3. 在nm-Add wavelength(s)框重可以最多向屏幕中添加40个波长。选择第一排,输

25

入波长并点击Enter。下一行就可以变亮,这样就可以添加额外的波长。另外,还可以通过在感兴趣波长的位置上点击鼠标右键并选择Add Wavelength来添加。还可以选择删除一个或者多个波长。

? 在下拉选择中选择Use current setting as default,这样可以方便每个工作薄的

设定时间。

4. 选择Add to report来把所有检测结果包括到当前的报告中。默认的设定是把所有样

品都添加到报告中,要把样品数据保存到工作薄中,必须要在检测前把Add to report检测框选上。

5. 选择Overlay spectra 在同时 选择多个光谱图。 6. 使用合适的缓冲液建立一个空白对照。

? 基座模式:取1-2ul空白溶液加到基座上,放下检测臂并点击Blank。

? 比色皿模式(仅2000c):按照比色皿生产厂家的建议加入适量的空白溶液,

按照仪器上标记的光路放心,插入比色皿。

注意:用任何模式检测时检测臂都必须放下,在用基座检测时,建议把比色皿从仪器上取出,以保证检测臂放到合适的位置。

7. 输入样品名称,按做空白一样加入样品点击Measure开始检测。

注意:每次检测的样品必须是新鲜加入的!

检测完成以后:

? 用干净的无尘纸擦拭干净上下基座,这样仪器就可以进行下一个样品的检测了。 ? 当使用比色皿模式时,取出比色皿,彻底清洗干净然后再进行下一个样品检测。

Protein A280

总论

蛋白和核酸不一样,具有很强的多样性。Protein A280功能应用于检测那些含有Trp,Tyr残基或者含有Cys-Cys二硫键的纯蛋白,这些蛋白在280nm出有明显吸光值。这个方法不需要构建标准曲线而是检测吸光值后软件直接计算蛋白浓度。而象BCA,Pierce 660nm,Bradford和Lowry这些检测颜色的方法通常用来检测那些消光系数不确定的样品或者细胞裂解液。如果你经常使用颜色检测法来定量蛋白,建议使用软件中预编辑好的程序。

Protein A280显示紫外吸收光谱,检测280nm处的吸光值后计算浓度(mg/ml)。和核酸检测一样,Protein A280记录显示的是10mm光程下的数据。

检测浓度范围

NanoDrop 2000/2000c在基座模式下可以最多检测400mg/ml的BSA而不用稀释。软件可以自动使用选择光程来检测每个样品的吸光值。

在样品的10mm吸光值>3.0(>4.5mg/ml BSA)时可以选择Small sample volume。

检测需要的样品量

虽然检测的样品量不是很关键,但在使用基座检测时要确保形成液柱,这样在上下基

26

座之间形成样品桥。

决定液体表面张力的主要因素时溶液中水分子之间的氢键。通常情况下,水中的物质,如:蛋白,盐离子,去污剂等都会通过破坏水分子之间的氢键来减小表面张力。虽然对于大部分样品来说,1ul的量就足够用于检测了,我们建议在做蛋白检测时由于表面张力下降做好使用2ul的样品来检测以保证形成液柱。

在使用比色皿检测时,要确保液面的高度高于光线通过比色皿的高度,参考比色皿生产厂家的说明来确定需要的液体量。

基座再生

带有表面活性剂的溶液或者试剂会破坏检测基座上液柱的形成。在这种情况下,使用Nanodrop基座再生复合物来快速再说基座表面。关于PR-1的其他信息请参考网页。

独特的屏幕显示

右侧显示栏是蛋白A280检测 的栏目,左侧部门这里没有说明,请参考“软件总论”。

光谱图显示的数据是样品标准化到10mm光程下的结果。 在光谱图右侧包括下列内容:

Sample ID-输入样品名称的位置,应在检测前输入样品名称。

Type-六个预设样品可供选择来进行蛋白分析和浓度计算。可以在Type旁边的下拉框中进行这些选择。默认的是1Abs=1mg/ml。 1mg/ml蛋白在280nm处的吸光值为1A。 小牛血清白蛋白参照,蛋白浓度计算的质量消光系 数是:10mg/ml的蛋白在280nm处的质量消光系数

27

为6.7。 IgG参考,蛋白浓度计算的质量消光系数是: 10mg/ml的蛋白在280nm处的质量消光系数为13.7。 溶菌酶参考,蛋白浓度计算的质量消光系数是: 10mg/ml的蛋白在280nm处的质量消光系数为26.4。 用户可以自己输入摩尔消光系数和分子量(KD),作为检测蛋白的参考 用户可以自己输入质量消光系数,作为10mg/ml蛋白的参考。 Ext.Coeff,E1% L/gm-cm-当选择Other Protein(E1%)会出现这个项目,在检测前应输入合适的消光系数。

Conc-根据蛋白在280nm处的吸光值和选择的消光系数计算出来的浓度值。浓度单位可以从旁边的下拉框中选择。默认的单位是mg/ml。

A280(10mm光程)-蛋白在280nm处的吸光值。显示的数据被标准化到10mm光程。

260/280-260nm和280nm处吸光值的比值。

Baseline correction-如果选择了这个功能,默认的重镉酸盐校准波长为340nm,用户可以自己手动随便输入重镉酸盐的校准波长。每次检测时,都会自动把选择波长处的吸光值作为检测的基线。所有波长下的吸光值都会减去这个基线值。如果不选择基线校准这个功能,光谱的基线会发生偏移,计算的蛋白浓度值会比真实值偏高。

进行蛋白A280检测

1. 从主菜单中选择Protein A280,如果波长确认窗口打开,确保检测臂放下并点击

OK。

2. 从样品下拉框中选择检测样品的类型,默认的设定为1 Abs=1mg/ml。 3. 选择浓度单位,默认的单位是mg/ml。

4. 默认的重镉酸盐校准波长为340nm,可以选择其他的校准波长,或者去选择

Baseline correction来不做光谱校准。

? 选择文件下拉选择中的Use current settings as default来节约每个新的工作薄

的设定时间。

5. 选择Add to report来自动把所有检测结果添加到当前报告中。默认的设定是把所有

样本添加到报告。在进行样品检测前必须把Add to report框选上才能把样品结果数据保存到工作薄中。

6. 选择Overlay spectra来同时显示多个光谱图。 7. 使用合适的缓冲液做空白对照。

? 基座模式:取1-2ul空白溶液加到基座上,放下检测臂并点击Blank。

? 比色皿模式(仅2000c):按照比色皿生产厂家的建议加入适量的空白溶液,

28

按照仪器上标记的光路放心,插入比色皿。

注意:用任何模式检测时检测臂都必须放下,在用基座检测时,建议把比色皿从仪器上取出,以保证检测臂放到合适的位置。

8. 输入样品名称,按做空白一样加入样品点击Measure开始检测。

注意:每次检测的样品必须是新鲜加入的!

检测完成以后:

? 用干净的无尘纸擦拭干净上下基座,这样仪器就可以进行下一个样品的检测了。 ? 当使用比色皿模式时,取出比色皿,彻底清洗干净然后再进行下一个样品检测。

Protein & Labels

总论

Protein & Labels可以用来检测蛋白的浓度(A280nm)和荧光染料的浓度(蛋白芯片标记物)。它还可通过吸光值的比值来检测金属蛋白(如血色素)的纯度。

检测浓度范围

Nanodrop 2000/2000c能够准确检测100pmol/ul的荧光染料和20mg/ml的蛋白(BSA)而不用稀释。

检测需要的样品量

虽然检测的样品量不是很关键,但在使用基座检测时要确保形成液柱,这样在上下基座之间形成样品桥。

决定液体表面张力的主要因素时溶液中水分子之间的氢键。通常情况下,水中的物质,如:蛋白,盐离子,去污剂等都会通过破坏水分子之间的氢键来减小表面张力。虽然对于大部分样品来说,1ul的量就足够用于检测了,我们建议在做蛋白检测时由于表面张力下降做好使用2ul的样品来检测以保证形成液柱。

在使用比色皿检测时,要确保液面的高度高于光线通过比色皿的高度,参考比色皿生产厂家的说明来确定需要的液体量。

基座再生

带有表面活性剂的溶液或者试剂会破坏检测基座上液柱的形成。在这种情况下,使用Nanodrop基座再生复合物来快速再说基座表面。关于PR-1的其他信息请参考网页。

染料/荧光基团编辑

NanoDrop 2000/2000c软件既可以让用户选择设定好的染料也可以使用Dye

Chromophore Editor来编写输入新的染料。要输入一个新的染料,选择显示栏框(最后一列),这就可以激活输入信息的区域了,参考染料生产厂家的说明来输入合适的校准因子。280nm的校准参数将会自动应用到蛋白浓度计算。当输入好后,这些信息就被保存了。

29


Nanodrop_2000中文操作手册(6).doc 将本文的Word文档下载到电脑 下载失败或者文档不完整,请联系客服人员解决!

下一篇:部编新人教版初中古诗词背诵默写专题训练

相关阅读
本类排行
× 注册会员免费下载(下载后可以自由复制和排版)

马上注册会员

注:下载文档有可能“只有目录或者内容不全”等情况,请下载之前注意辨别,如果您已付费且无法下载或内容有问题,请联系我们协助你处理。
微信: QQ: