4、农民群众对调整产业结构的重要性理解不够。由于我县是一个产棉大县，农民的大部分收入来源于棉花，对于发展林果业、畜牧业的积极性不高，特别是对林果业种植抱有抵触情绪，不愿意种植，或者白天种、晚上拨的现象时有发生。
5、乡镇人员普遍缺编，“4211”机制运转比较困难。我县大的乡有60多个编制，但实际人员只有40多个，缺编较大。除却领导干部、驾驶员、财务人员，真正分配到各科室的人员就所剩无几，每天到基层调研、视察、检查的工作组不断，基层每天都处于疲于应付上级单位的检查中，无法轮学、轮休。
6、群众上访现象困扰乡镇。目前，群众上访可以说是经常发生，有理的也上访，无理的也上访。由于大部分上访问题是涉法案件，当地乡镇无力解决，而按照信访案件属地管理的要求，乡镇还要负责将上访人员接回当地，大的乡镇每年的接送费用就达十几万，基层工作十分被动。
7、宗教管理工作依然任重道远。出国朝觐人员一年比一年多，这些人员中有的是经过宗教管理部门依法批准出国朝觐的，而有的是借经商名义通过第三国出国朝觐的。去年我县出国朝觐人员共有150人，没有经过批准的就达99人。这些出国朝觐人员中某些宗教狂热分子回国后，对基层群众的不法宣传与煽动一直没有停止过，妇女的衣饰、打扮、生活方式也在悄悄地发生着变化，非法宗教活动和地下讲经点时有发生。
8、宗教场所管理工作还比较艰巨。目前，我县清真寺建设数量超过村委会办公室和中小学的总和，全县共有清真寺367座，而中小学校为112所，村委会121个。农民群众对改善基层办公条件态度消极，但对修建和装修清真寺的热情却热情高涨，主动捐款，清真寺装修的比村委会办公室漂亮，两者之间反差较大。
9、县直机关派往基层挂职干部作用发挥不明显。现在，挂职干部由于没有带薪下乡，没有和乡镇的干部同考勤，乡镇管理起来难度较大。
10、土地灌溉用水难的问题困扰基层群众，反映强烈。近几年，截止调研时，有些村的棉花地还没有灌上一次水，群众对此意见较大。
11、提高的三老人员养老费尚未及时兑现。2004年和2005年，自治区人民政府公开承诺每年增加1000万元，用于提高农村三老人员养老费，但时至今日，这笔资金还没有到位，仍按我县原有标准发放。
（二）村级政权建设中存在的问题
1、村干部对发展村级经济思路不清，缺乏长远发展规划，缺乏积极性和创造性，平时只是应付上面的工作，没有真正将自己的身心投入到工作中去。例如，没有认识到协助好相关单位修好乡村路面、建好防渗渠就是为群众办实事，总认为是替别人做事，思想认识不到位。对于乡镇拍卖闲置的土地搞小城镇建设有意见，没有用发展的眼光看问题。
2、村上无钱为群众办事，中央财政转移支付分配到村的每年只有3000元左右的钱，这笔费用还不够上级要求订报刊杂志的钱。上级的建设项目要求村配套资金，但税费改革后，村委会根本没有足够的钱来搞配套，为民办实事实在是心有余而力不足。
3、制度不健全，管理跟不上，特别是财务收支两条线制度基本上没有落实，造成乡村财务管理混乱。
4、改善党员结构，补充新鲜血液不够。基层农村党支部没有把有致富能手列入培养对象，把党员培养成有一技之长的致富带头人，而把培养对象放在老实、贫穷的群众身上，有的故意培养自己的亲戚朋友，形成家族势力圈。
5、村级干部待遇低。村党支部书记和村委会主任补贴一年大约在3000—4000元左右，村副职领导补贴在1000—1500元之间，影响了他们的工作积极性。
四、存在问题的主要原因
（一）乡镇工作存在问题的原因
1、乡镇干部思想还不够解放，仍然用计划经济管理手段指导现在市场经济工作，不适应现在新的形势发展要求，也是造成当前干群关系紧张的原因之一。