各卫生院全面实行按劳分配的原则，在保证工作正常运转和合理提留公共积累的前提下，坚持按岗位、按任务、按业绩定酬的原则，分配要向优秀人材、技术含量高的关键岗位倾斜，向工作业绩突出、贡献大的岗位倾斜。
2、公开招聘院长
在全县卫生系统范围内本着公开、平等、竞争、择优的原则，公开选聘了各卫生院院长，选拨出了作风好、懂技术、善管理、50岁以下、医师以上职称的卫生技术人才担任乡镇卫生院院长，使乡镇卫生院院长年轻化、专业化、知识化。及时制定了卫生院院长管理办法，实行院长任期目标责任制。
3、改进卫生院工资分配方式
由于卫生院的人员性质不同，有国家、大集体、公助集体三类人员，上拨款不同，工资分配不合理。经充分调查研究后，卫生院实行了保底工资与效益工资相结合的分配方式，建立工资与学历、职称、病人满意度评价等多项考核评价指标挂钩，向工作业绩突出、肯钻研上进、爱岗敬业者倾斜的分配制度。同时，将占职工总数73%的公助集体人员工资补贴从原来不足60元上调到100元左右。很好地调动了职工的积极性，一定程度地提高了卫生院的服务效能。
4、积极引进项目资金，加强医疗卫生机构硬件建设
根据上级卫生工作会议精神，抓住西部大开发和中央进一步加强农村卫生工作的历史机遇，建立项目目标责任制，主动出击，多方争取项目资金，2003年以来卫生院引进设备及项目资金共计406万元，维修了2100平方米医疗业务用房，配备了10辆小型孕产妇急救转运车、8台心电图机、6台口腔综合治疗台，以项目促进发展。同时，我县对卫生院医疗设备进行了合理调配，使其都得到了充分利用。
5、对卫生院基础设施进行改造
为了全面彻底改变我县卫生院房屋破旧、基本医疗设备短缺的面貌，对提高卫生院应对突发公共卫生事件处理能力，满足农民群众的基本医疗卫生保健需求，三年时间里，我们先后投入了500余万元对卫生院基础设施进行改造，2003年，白灵淖中心卫生院农牧民健康工程投资23.00万元；白灵淖乡中心卫生院和红泥井乡卫生院的产科标准化建设共投资9万元购置救护车两辆。2004年，银号中心卫生院实施农牧民健康工程改造改建工作，总投资23万元；忽鸡沟中心卫生院和下湿壕乡卫生院进行产科标准化建设，共投资9万元购置救护车两辆；2005年，争取西斗铺中心卫生院、忽鸡沟中心卫生院农牧民健康工程建设项目价值各20万元的医疗设备；争取产科标准化建设项目9万元，装备西斗铺中心卫生院、兴顺西卫生院救护车各1辆；争取卫生厅配置新建中心卫生院价值4万元的心电图机一台；争取卫生厅配置九份子卫生院价值4万余元的心电监护仪一台；2006年，为怀朔镇中心卫生院、金山镇中心卫生院争取产科标准化建设项目共计9万元；争取卫生院基础建设项目资金275万元对九所卫生院的房屋进行改造，工程项目资金已落实，准备明年开工建设。
到目前，已经对80%的卫生院进行了改造，我县的农村医疗机构基础设施建设取得明显变化，基础卫生资源得到优化，使农民的基本医疗卫生服务状况得到较大改善，广大农村居民的健康水平有较大提高，从整体上提高农民的健康水平和生活质量。
五、加大投入，加强村级卫生室建设
1、为建设社会主义新农村、加强农村三级网建设、提高村卫生室医务人员的业务水平，我局分别于4月12日和10月11日举行了两次为期4天的村卫生室人员业务培训，全县284名村卫生室人员参加了培训，并筹集资金为其统一定制了2万余元的《急诊急救基本知识培训手册》等专业书籍。
2、通过对村卫生室的监督和检查，现有32%的村卫生室基本达到三室分开的标准，为逐步实现农民小病不出村的目标，近期准备将条件好的要列入新型农村合作医疗定点医疗机构，并承担部分公共卫生职能。
3、我们重点加强对21个新农村建设试点村卫生室的建设。在21个试点村中，有卫生院的和卫生院设点开办村卫生室的村10个，私人开办村卫生室的有6个，其余5个村的卫生室的正在规化建设中。