战胜后可以到公司里面与决斗机器决斗,是个赚钱的好DD哦.而且这次可以选择等级.
从依西兹左边的出口到大地图,来到童实野车站,售票员问主角是不是决斗者。之后要求与主角等人进行双人赛，坐个车还要决斗......(无语)不过对手很弱,两三下就可以解决,顺利进入月台，可是暗之猎人也尾随着他们……进入车里后,先与入口的工作人员对话，正当准备与车厢里的工作人员(图1)就会开车.......(再无语)再与他决斗,战胜后他会让路,来到里车厢,会与暗猎人决斗,并且开始时的场地为暗.战前多准备些暗属性的怪物吧.
出来后追踪猎人到一个铁门前的人对话他会让路,下去后一个埃及人把刚刚的猎人打倒,原来他是千年道具的守护者，要求试探主角的实力，通过才能得到千年道具。胜利后得到千年项链，当主角触摸千年项链时看到了3000年前埃及，黑暗大邪神四处破坏，法老王（暗游戏）的影像，游戏说明那是这个躯体里的另一个自己，但现在只剩下他一人了，所以要尽快找到千年积木。出来碰到海马,说主角们只是平凡的决斗者，只有他才有使用神卡的资格，得到决斗王的称号，还有决斗者是孤敖的，不需要同伴，之后又是留下高昂的笑声，一直往左出去. 回到广场找依西兹(最好先回家补充LP&SAVE),可惜只有一个千年道具不能令神卡复活，不过有了千年项链找其他千年道具就方便多了，突然感觉到邪恶的气息，原来是木偶师,他说天马太阳的计划就是令黑暗大邪神复活。与木偶师战斗(一样开始时环境即为暗),战胜后木偶师留下了天马太阳的灵魂卡片，将其还原天马对主角将其两个刺客打败感到意外，并说一定会竭力让黑暗大邪神复活，之后就消失了（明明是瞬间转移……）。事况紧急，一定要在封印被解开前将三张神卡复活。然后利用千年项链之力预测出下一个千年道具在童守码头。出大地图去童守码头,在港口无意听见一对情侣的对话（很搞笑哦）。上船后碰到了一国际影星正向孔雀舞求婚，舞却说如果打倒她就答应，谁知他不自量力地说“OK！”，结果很明显：在舞的快乐三姐妹猛攻下惨败。怎知他还想继续挑战，上前帮孔雀舞打败对方。战胜后舞告诉众人，看到千年道具的守护者在船舱。进入船舱(图
2)，与第二个千年道具守护者决斗。胜利后得到千年钥匙，之后解放了被困在其中的夏迪。原来，这只是藏在千年道具里持有者的记忆，夏迪请求主角为了解救世界的危机而战斗，之后其灵魂就消失了（之前的天马太阳也一样）
回广场找依西兹,利用两个千年道具的力量把石化的奥卡西斯（地狱判官）之天空龙还原，幻神卡会自己选择主人，天空龙则选择了游戏，但游戏觉得现在的自己无法拥有天空龙，直到拿回千年积木与另一个自己重见之时，于是决定把天空龙交给主角，并说这是三人友情的羁绊，获得天空龙。(PS:这一代神卡在战斗里有配音,很正哦)。
之后又预测到下一个千年道具在地下墓地。出大地图去地下墓地,入口处的两位老人不知云云……到下层碰到骨冢，他问众人是否来观光的，城之内觉得这种毛骨悚然的地方鬼才愿意来（这里本来就是鬼住的地方嘛），当说明来意后，骨冢说他知道千年道具守护者的所在地，不过要打败他。胜利后出现以基斯为首的猎卡王一行人,看来他们是冲着神卡来的，待他们离区后骨冢告诉众人千年道具守护者在下一层,到下一层与第三个千年道具守护者决斗，胜利后得到千年环，