有源电力滤波器的控制方式按照电流的检测方式有如下三种。
检测负载电流的控制方式并联。其指令电流运算电路的输入信号来自负载电流，这是最基本的一种控制方式。在这种方式中，补偿电流能较好地跟踪指令电流。但是，在主电路电力半导体器件高频通断的过程中，会产生其开关动作频率附近的一些次数很高的谐波。所以需要设置由电感、电阻、电容组成的高通滤波器(HPF)。加入高通滤波器后，较高频率的谐波成分被滤除，但是存在发生谐振的可能，从而使得电源电流的波形发生畸变，这是该控制方式的主要缺点。这种控制方式下的系统是一个开环系统。
检测电源电流的控制方式。有源电力滤波器的作用主要是补偿谐波，最终使电源电流成为正弦波。基于此，可考虑检测电源电流is，而不检测负载电流，用指令电流运算电路求出is中的谐波，反极性后作为指令电流对补偿电流发生器进行控制。这种控制方式构成了闭环控制系统，其补偿结果好于检测负载电流控制方式的结果。
复合控制方式就是把上述两种控制方式结合起来。在这种控制方式中，同时检测负载电流和电源电流。指令电流信号主要来自负载电流，在其作用下，可对负载中的谐波电流进行较好的补偿。而电源电流及校正环节的作用主要是抑制高通滤波器HPF 和电网阻抗之间的谐振。这种控制方式综合了前两种控制方式的优点，是一种较为理想的控制方式。
图4.3综合控制接线图