在中国医药分离难
如果改革进行得彻底，在现有的投入水平下，把虚高的药品费用全部挤出来，让利给患者和医务人员，仅仅通过调整结构也能实现改革目标。”
陕西省卫生厅厅长刘少明则担心，由于医改总体框架设计缺乏具体政策支撑，特别是没有明确的财政保障政策，导致医改推进程度和改革力度受制于地方政府主要领导的重视程度，这是当前公立医院改革面临的瓶颈问题。
李玲教授对此开出的“药方”是：分类指导。发达地区，应尽可能投入一步到位。欠发达地区，可以优先调整现有医疗保障资金的结构。如果中央对试点县能够拨一笔资金，则应充分发挥其“花钱买机制”的作用。
盘根错节的机制更待理清
在国务院医改专家咨询委员会委员、北大光华管理学院教授刘国恩看来，资金投入并不是问题的核心，关键在于医疗服务提供系统里边盘根错节的机制没有理清。
刘国恩对记者表示，以药养医只是问题的表现形式，而不是症结，“为什么会出现以药养医？是因为把这几万家公立医院定位为事业单位，事业单位就不允许按照市场游戏规则去采购生产过程中的原料，从而根据市场经济规律合理的加成，在产出服务上来体现。可是中国又进入了市场经济的阶段，购买所有的投入要素都要从市场上获得，除非政府完全免费提供给它。怎么办呢？所以就从药品中留了个口子，来补贴医疗服务补偿不足的那块，原因就在于事业单位的定位，性质没有变。”
在刘国恩看来，应该重新调整公立医院作为现代医疗服务提供机构的定位，而不应过度强调公立医院的“公益性”：“这个提法本身并没有错，但对于解决公立医院存在的问题，推动公立医院改革从过去低效的、有若干体制问题、行政干预太多的问题，到现代医院管理的转型是没有任何帮助的，甚至还有一些阻碍作用，导致很多人在这个概念上产生越来越多的困惑。”