diamond 3 教程系列1.01 - 图文(3)

2019-08-17 14:13

图2.12 右键点选下的Lasso Selection操作

图2.13 Lasso Selection操作轨迹图

第三节 View 系列菜单

3.1 View 系列菜单简介

该系列菜单包含了所有“查看”信息,包括操作文档的大纲及缩略图、晶体学参数及列表、原子及键的信息列表(其中还可以进行选择)、粉末图显示、数据/图片切换等功能。

3.1 典型的View 操作界面

3.2 常用选项介绍

3.2.1 Navigation 和Thumbnails

这两项功能分别提供了目录(大纲)和缩略图功能。

图3.2 Navigation效果图

图3.3 Navigation选项

Navigation后在左侧显示出了各个菜单的名称主要包括五项。 ?点击Structure x 可以显示当前操作的结构图:

图3.4点击Structure x效果

?点击Data sheet可以显示该结构的晶体学信息:

图3.5 Data sheet 列表信息

这些信息可以打印或直接拷贝到其它文档处理软件,并直接列表,这些信息可以直接用于文章的发表。比如,选择-复制-拷贝到本教程后的信息如下:

表3-1 Data sheet 列表信息

General

Origin Code

Database dates Common name Systematic name

Structure 1

Structural formula Analytical formula

Bibliographic data

Author(s) Publication title Citation Mineral name

Compound source Structure type Creation method Comments

Phase data

Formula sum Formula weight Crystal system Space-group Cell parameters Cell ratio Cell volume Z

Calc. density Meas. density Melting point RAll RObs

Pearson code Formula type

H40 C64 809.02 g/mol monoclinic P 1 21/a 1 (14)

a=12.3027 ? b=9.9879 ? c=8.2206 ? β=96.40° a/b=1.2318 b/c=1.2150 c/a=0.6682

31003.83 ?

Created with Diamond v2.0

1.33821 g/cm3 mP104 N5O8

Wyckoff sequence e26

Atomic parameters ,Anisotropic displacement parameters, in ?2列表限于篇幅,不再列出。

?点击Distance/angles,则给出一格相当详细的信息表。

表3-2 Distance/angles操作界面说明 Select atom (type)s 可以选择参与列表的原子种类 Unit 表示选择范围的单位,?表示埃,下面依次是皮米和纳米 Dmin Dmax 表示选定的原子该范围球壳范围内的所有原子,默认值是0-2.5?。 angle d 1,2 and 1,3 Count 该选项提供了在设定球壳内与之相关的原子所组成的夹角,具体操作见后面说明。 该选项只能与angle选项共同使用,不能单独选择,列出了在angle选项中构成角度的三个原子间的距离 对选型范围内重复出现的原子累计计数,在选择的半径较小时,一般为1×,如果调大Dmax,有的原子可能在该范围内出现多次,表示为2×,3×等。 列出对称操作 H10 C14 原子坐标 13555011 1.0664 红字部分就是原子代码 Symmetry op. Atom code Coordinate Standard Uncertainties 选择该项会使得2.0295数值显示成2.0295(25) ,25就是s.u.值,(s.u.值) 但前提是胆经数据本身必须提供该值,否则程序不会计算该值。


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