一、安装cmake编译器 sudo apt-get install cmake
二、cmake 安装CLHEP
1、在主文件夹下创建clhep文件夹 mkdir /home/usename/clhep cd clhep
2、将clhep包解压到clhep文件夹中 tar zxvf /home/usename/下载/clhep.tar.gz
3、在clhep目录下创建clhep-build和clhep-install文件夹 mkdir cllhep-build mkdir clhep-install
4、进入clhep-build文件夹 cd clhep-ibuild
5、接下来就可以进行安装
cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/username/clhep/clhep-install ../2.1.3.1/CLHEP //设置安装路径
make -jN //编译
make install //完成安装，将相关文件复制到安装目录下
6、设置环境变量
Export PATH=$PATH:/home/username/clhep/clhep-install/bin
Export LD_LIBRARY_PATH ${LD_LIBRARY_PATH}:/home/username/clhep/clhep-install/lib
三、cmake 安装geant4.9.6
1、安装编译环境（编译器、必要的库） sudo apt-get install build-essential
2、安装GDML、OPENGL需要的库
sudo apt-get install libgl1-mesa-dev libglu1-mesa-dev libxt-dev libXmu-dev libXi-dev zlib1g-dev libgl2ps-dev libexpat1-dev libxerces-c-dev
注：centOS 里yum install xerces-c-devel expat-devel mesa* freeglut-devel
3、创建geant4相关文件夹
mkdir geant4.9.6 //创建geant4.9.6文件夹 cd geant4.9.6 //进入geant4.9.6根目录 mkdir geant4.9.6-build mkdir geant4.9.6-install
4、将geant4.9.6.p02包解压至geant4.9.6目录下 tar zxvf /home/username/下载/geant4.9.6.p02.tar.gz
5、进入geant4.9.6-build内，然后就可以开始编译并安装geant4程序了。
cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/username/geant4.9.6/geant4.9.6-install（设置安装路径）
-DGEANT4_INSTALL_DATA=ON（下载数据包） -DGEANT4_USE_GDML=ON （开启GDML）-DGEANT4_USE_OPENGL_X11=ON （开启可视化引擎）-DGEANT4_USE_RAYTRACER_X11=ON （可视化径迹）-DGEANT4_USE_SYSTEM_CLHEP=ON （使用用户自己安装clhep库）-DCLHEP_ROOT_DIR=/home/username/clhep/clhep-install （链接
clhep
安装目录）
-DCLHEP_INCLUDE_DIR=/home/username/clhep/clhep-install/include （链接clhep的include目录）-DCLHEP_LIBRARY=/home/username/clhep/clhep-install/lib/libCLHEP.so（链接clhep的lib库） ../geant4.9.6.p02（为cmake指引cmake.list所在目录）
注：括号内文字为响应指令的解释，上述指令编译后，在geant4.9.6-build内会生成一个data文件夹，用于存放数据。用户可以在geant4的官网上下载数据后解压至此文件夹，亦可让terminal自行下载。 对于CLHEP库（红字），用户可以不设置这些指令，geant4.9.5及以后的版本自身带有clhep库。只是如果用户在使用别的软件需要CLHEP库（例如GATE）时，可以另外安装clhep库。在安装geant4时只需这样进行链接即可。
设置完成后，
make -jN //编译geant4，编译文件自动生成在geant4.9.6-build内 make install //完成安装，将相关文件复制到geant4.9.6-install内
6、设置环境变量
source /home/username/geant4.9.6/geant4.9.6-install/share/Geant4-9.6.2/geant4make/geant4make.sh
4、安装root
1、自行下载root包
2、安装编译root必须的库和编译器
sudo apt-get install subversion make g++ gcc binutils libx11-dev libxpm-dev libxft-dev libxext-dev gfortran ncurses-dev libpcre3-dev xlibmesa-glu-dev libglew1.5-dev libftgl-dev libmysqlclient-dev libfftw3-dev cfitsio-dev graphviz-dev libavahi-compat-libdnssd-dev libldap-dev python-dev libxml2-dev libssl-dev libgsl0-dev
3、创建root文件夹
mkdir root cd root
4、解压安装文件纸至root
tar zxvf /home/username/下载/root--.tar.gz
进入解压文件，进行编译和安装 cd root ./comfigure make -j4
6、安装完成后，设置环境变量
source /home/username/root/root/bin/thisroot.sh
5、安装GATE
1、下载gate6.2包
2、创建gate文件夹
mkdir gate6.2 cd gate6.2 mkdir gate6.2-build mkdir gate6.2-install
3、进入gate6.2-build，进行编译和安装cd gate6.2-build
-DGATE_USE_OWN_CLHEP=ON
gate
cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/username/geat6.2/gate6.2-install
-DCLHEP_ROOT_DIR=/home/username/clhep/clhep-install/
-DCLHEP_INCLUDE_DIR=/home/username/clhep/clhep-install/include -DCLHEP_LIBRARY=/home/username/clhep/clhep-install/lib/libCLHEP.so -Geant4_DIR=/home/username/geant4.9.6/geant4.9.6-install/lib/Geant4-9.6.2 -DROOTCINT_EXECUTABLE=/home/username/root/root/bin/rootcint ../gate_v6.2 make -jN
make install
4、设置环境变量
source /home/username/gate6.2/gate6.2-install/bin
注：gate6.2应该与geant4.9.5搭配安装，geant4.9.5应与clhep-2.1.1.0搭配，用户只需将相应的安装包改变即可。clhep2.1.1.0的安装方法与root类似，用户可以自己琢磨如何安装。