使用方法：在序列提交框中粘贴所需要的氨基酸序列或在“upload a file”中上传本地的序列文件→选择分析工具→点击“submit”
结果分析：
InterProScan的返回结果以
（1）图形的形式显示保守区和结构域
（2）表格的形式 显示保守区和结构域的具体位置以及蛋白家族信息和GO分类号
5、蛋白质三级结构分析
蛋白质三级结构的预测通常根据三种建模方式进行预测
（1）同源建模法分析步骤：
– 多序列比对
? 与已有晶体结构的蛋白质序列比对
– 确定是否有可以使用的模板
? 序列相似度>30%
? 序列相似度<30%，结合功能，蛋白质一级序列、二级结构或结构
域信息
– 构建三维模型
– 三维模型准确性检验
? Whatcheck 程序
? Ramachandran plot计算检验
– 手工调整多序列比对，重新拟合，构建新的模型
使用工具：SWISS-MODEL/SWISS-PdbViewer
分析方法