多种.植物总DNA提取方法及详细步骤

2018-11-27 16:47

植物总DNA提取

一、常用方法 改良CTAB法(改良自精编分子植物基因工程,王关林,2002

SDS法(植物基因工程,王关林,高盐低pH值法(邹喻萍,植物生物学实验指南,原蓝猪耳实验方案,拟采用)

材料预处理:从野外采集的新鲜叶片若比较衰老,运回后可放在4℃的黑暗中饥饿1~2d,以消耗淀粉和其他多糖。 试剂:

(1) 2-巯基乙醇(2-ME) (2) CTAB抽提液 (3) CTAB/ NaCl溶液

(4) 24:1(V/V)氯仿/异戊醇 (5) CTAB沉淀液 (6) 高盐TE缓冲液 (7) 70%乙醇 (8) TE缓冲液 操作:

(1) 称取样品0.2g,去除表面的

DNA污染,置于研钵中与液氮共研成细粉。

(2) 将冻粉转入2ml离心管中,

立即加入1000μl(980+20)预热至65℃的CTAB抽提

材料预处理:从野外采集的新鲜叶片若比较衰老,运回后可放在4℃的黑暗中饥饿1~2d,以消耗淀粉和其他多糖。 试剂: (1) 2×CTAB提取缓冲液

操作: (1) 2ml离心管中加入1ml提取缓冲液,65℃预热。 (2) 取0.2g新鲜幼嫩叶片,于液氮中迅速研磨成粉。 (3) 将呈干粉状态的研磨物迅速转入提取缓冲液中,尽快混2002) 材料预处理:从野外采集的新鲜叶片若比较衰老,运回后可放在4℃的黑暗中饥饿1~2d,以消耗淀粉和其他多糖。 试剂:

(1) 提取缓冲液:100mmol/L

Tris·Cl(pH8.0)、50mmol/L EDTA(pH8.0)、500 mmol/L NaCl、10 mmol/L 2-巯基乙醇(2-ME) (2) 10% SDS (3) 5mol/L KAC

操作: (1) 称取样品0.4g,去除表面的DNA污染,置于研钵中与液氮共研成细粉。 (2) 将冻粉转入2ml离心管中,加入提取缓冲液900μl(自注:观察此用量合适否),轻学报,1994) 材料预处理:从野外采集的新鲜叶片若比较衰老,运回后可放在4℃的黑暗中饥饿1~2d,以消耗淀粉和其他多糖。 试剂:

(3) 提取缓冲液:100mmol/L

NaAC(pH 4.8)、50 mmol/L EDTA(pH 8.0)、500 mmol/L NaCl、1.4% SDS,此种介质刚好为pH 5.5。

(4) 2.5mol/L KAc(pH 4.8)

操作:

(1) 称取样品0.4g,去除表面的

DNA污染,加入少许PVP40(相对分子质量为40 000)

置于研钵中与液氮共研成细粉。

(2) 迅速加入2ml预热至65℃的

液,于65 ℃温育30min(10~60 min),并经常温和混匀。

(3)

放至室温,加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1)抽提匀浆液,颠倒使充分混合,于4℃,7 500g(对于小样品,在离心机上以10000 r/min)离心5min。

(4)

将上清液转移至新的离心管中,加入1/10体积的65℃的CTAB/NaCl溶液,颠倒充分混匀。

(5)

再次加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1),颠倒使充分混合,于4℃,7 500g(对于小样品,在离心机上以10000 r/min)离心5min,抽提至上清液澄清(界面无白色沉淀)。

(6)

将上清液转移至新的离心管中,加入等体积的CTAB沉淀液,颠倒混匀,室温放置15min后(如果沉淀可见,继续做,否则于65 ℃温育30 min),于4℃,10000 r/min

匀,于65℃保温30min。其

间轻柔混匀2~3次。

(4) 取出离心管,冷至室温,加

入1ml的氯仿/异戊醇,轻缓颠倒混匀,静置10min。 (5) 10 000r/min离心10 min。 (6) 转移上清液于另一离心管

中,加入2/3倍体积的异丙醇,轻缓颠倒混匀,室温放置15min。

(7) 10 000r/min离心10 min,去

上清液。

(8) 用0.2ml 70%乙醇洗涤沉淀

1次,室温下微干,加入70μl 高盐TE缓冲液和1 μl的RNaseA,颠倒混匀,37℃保温0.5h。

(9) 加入2倍体积预冷的无水乙

醇,充分混匀,于4℃, 7 500g(对于小样品,在离心机上以10000 r/min)离心15min。

(10) 将沉淀用70%乙醇清洗两次

后,晾干,加入50μl TE溶解沉淀。 轻搅动,使冻粉充分散开。 提取缓冲液,保温30min,(3) 加入400μl 10%SDS,充分

并经常温和混匀(自注:观混匀,于65℃水浴中保温察时间够否,提取液够否)。 10~15min(间隔晃动2~3(3) 在室温下10 000g离心

次)(自注:若裂解不充分可10min。

延长时间)。

(4) 上清液中加入2/3体积

(4) 加入640μl 5 mol/L KAC,充

2.5mol/L pH4.8的KAc溶分混匀,冰浴中放置30min。 液,0℃放置30min沉淀蛋白(5) 4℃ 12 000rpm离心15min。 质。

(6) 上清液转入新的离心管中,

(5) 10 000g,4℃离心10min。 加入等体积的氯仿/异戊醇,(6) 上清液加入0.6倍体积-20℃

轻轻颠倒离心管数次,放置预冷的异丙醇,温和混匀后5min。

于-20℃放置30min使核酸(7) 于4℃下8 000rpm离心

充分沉淀。

10min。

(7) 10 000g离心10min,去上清,

(8) 上清液转入新的离心管中,

将沉淀溶于500μl SDDW加入2/3体积、-20℃预冷的中。10 000g离心10min,上异丙醇,混匀,放置30min,清液转入新的离心管(去除观察DNA沉淀生成。

不溶物)。

(9) 于4℃下8 000rpm离心

(8) 加入0.6倍体积的-20℃预冷

10min,去上清液。(自注:的异丙醇,温和混匀后于观察转速合适否)

-20℃放置30min使核酸充(10) 用80%的乙醇洗涤沉淀,晾

分沉淀。10 000g离心10min。 干10~15min。

(9) 所得DNA沉淀用80%乙醇

(11) 加入400μl TE缓冲液充分溶

洗涤后晾干。

解沉淀(若溶解不好,可置(10) 将沉淀溶解于50μl TE中,

离心5min,弃上清。

(7) 将残液尽可能除尽,加入

200μl的高盐TE缓冲液和2μl RNaseA储备液重悬沉37℃水浴中保温,促进溶

解)。

(12) 5 000rpm离心5min,上清液

转入新的离心管(去除不溶2μl RNaseA储备液,于37℃温育30min,去除RNA后可直接或经一次氯仿:异戊醇抽提后用于酶切及PCR扩淀,于37℃温育30min。 (8) 加入2倍体积预冷的无水乙

醇,充分混匀,于4℃, 7 500g(对于小样品,在离心机上以10000 r/min)离心15min。

(9) 将沉淀用70%乙醇清洗两次

后,晾干,加入50μl TE溶解沉淀。

自注:红色为与《精编》相比的 改动部分。

二、试剂配制

溶液名(配方来源) 组分浓度 RNaseA 2 000U/ml

物)。加入10μl RNaseA溶液(1μg/μl),于37℃温育30min。

(13) 加入等体积的氯仿/异戊醇,

混匀,放置5min后10 000rpm离心5min,重复一次。

(14) 转移并量出上清液体积,置

新离心管中,加入1/5体积的3 mol/L NaAC,混匀,加入2.5倍体积的无水乙醇,轻缓混匀,室温放置5min。(15) 10 000rpm离心5~10min,

去上清。用80%乙醇洗涤沉淀2~3次,晾干。加入50μl TE溶解DNA,备用。

自注:根据原书按比例改变样品及试剂量

配法 待补

增。

用0.15mol/L NaCl,0.015 mol/L 1 mol/L Tris·Cl(pH8.0)(宝生物商品目录) 0.5mol/L EDTA(pH8.0)(宝生物商品目录)

TE缓冲液pH8.0 (精编分子生物学实验指南)

高盐TE缓冲液

柠檬酸三钠配成10mg/ml;使用前100℃热处理15min除去残留的DNase活性,DNA沉淀溶解后加入1/100体积RNase贮液。分装后-20℃备用。

1 mol/L Tris·Cl 0.5mol/L EDTA 10 mmol/L Tris·Cl,pH8.0

1 mmol/L EDTA,pH8.0 10 mmol/L Tris·Cl,pH8.0

称取12.11g Tris置于烧杯中, 加入约80ml ddH2O,充分搅拌溶解

加入约4.2ml浓HCl 溶液定容至100ml

高温高压灭菌后,室温保存

(应使溶液冷却至室温后再调定pH值,因为Tris溶液的pH值随温度的变化差异很大,温度每升高1℃,溶液的pH值大约降低0.03个单位)

称取18.61g Na2EDTA·2H2O,置于烧杯中 加入约80ml的ddH2O,充分搅拌溶解 用NaOH调节pH值至8.0(约2gNaOH) (注意:pH值至8.0时,EDTA才能完全溶解)

溶液定容至100ml

高温高压灭菌后,室温保存 1 mol/L Tris·Cl(pH8.0)1ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)0.2ml ddH2O定容至100ml 1 mol/L Tris·Cl(pH8.0)1ml

(精编分子生物学实验指南) CTAB抽提液 (精编分子生物学实验指南) CTAB/ NaCl溶液 (精编分子生物学实验指南)

CTAB沉淀液 (精编分子生物学实验指南) 高盐低pH值法提取缓冲液 2.5mol/L KAC(pH 4.8)

1 mmol/L EDTA,pH8.0 1 mol/L NaCl

于室温保存(可在几年内保持稳定)

2%(W/V)CTAB 100 mmol/L Tris·Cl,pH8.0 20 mmol/L EDTA,pH8.0

1.4 mol/L NaCl

于室温保存(可在几年内保持稳定)

10% CTAB 0.7 mol/L NaCl 1%(W/V)CTAB 50 mmol/L Tris·Cl,pH8.0 10 mmol/L EDTA,pH8.0 于室温保存(可在几年内保持稳定)

100mmol/L NaAC(pH 4.8)、50 mmol/L EDTA(pH 8.0)、500

mmol/L NaCl、1.4% SDS,此种介质刚好为pH 5.5

0.5mol/L EDTA(pH8.0)0.2ml NaCl 5.844g

ddH2O定容至100ml CTAB 2g 1 mol/L Tris·Cl(pH8.0)10ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)4ml NaCl 8.1816g

在40ml H2O中溶解2.05g NaCl,缓慢加入5g CTAB,同时加热并搅拌。如果需要,可加热至65℃溶解。定容终体积至50ml。自注:在烧杯中配制,不定容。

CTAB 1g 1 mol/L Tris·Cl(pH8.0)5ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)2ml

待补 冰乙酸调pH 称取14.7g乙酸钾,溶于60mlddH2O中,

溶解后再加入5.75ml冰乙酸,定容至100ml,所得溶液称为2.5mol/L KAC,溶


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