Ⅲ)72℃ 8min Ⅳ)4℃ 保存
(3)将PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳进行检测,并拍照记录实验结果。
2.2.3胶回收adk基因片段和连接T载体及大肠杆菌的培养
1)胶回收adk基因片段
按照提供的普通琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒—-离心柱型中所述的方法对已检测
并可使用的adk基因片段进行回收
1.柱平衡步骤:向吸附柱CA2中加入500ul平衡液BL,12000rpm(~13400×g)离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放入收集管中。
2.将单一的目的DNA条带从琼脂糖凝胶中切下放入干净的离心管中,称取重量。 3.向胶块中加入3倍体积溶胶液PN,因为凝胶重为0.1g,其体积可视为100ul,以此类推。50℃水浴放置10分钟,期间不断温和的上下翻转离心管,以确保胶块充分溶解。
4.将上一步所得溶液加入另一个吸附柱CA2中室温放置2分钟,12000rpm(~13400×g)离心30~60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CA2放入收集管中。
5.向吸附柱CA2中加入700ul漂洗液PW,12000rpm(~13400×g)离心30~60秒,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CA2放入收集管中。
6.向吸附柱CA2中加入500ul漂洗液PW,12000rpm(~13400×g)离心30~60秒,倒掉收集管中的废液。
7.将吸附柱CA2放入收集管中,12000rpm(~13400×g)离心2分钟,尽量出去漂洗液。将吸附柱CA2置于室温放置数分钟,彻底晾干。
8.将吸附柱CA2放到一个干净的离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加30ul洗脱缓冲液EB,水浴37℃2分钟。12000rpm(~13400×g)离心2分钟收集DNA溶液。
2) 连接T载体
1.在200ulEP管中加入下列组分: PMD-19TVector 0.5ul Insert DNA 4.5ul Solution Ⅰ 5 ul 2.轻轻混匀,16℃连接30分钟
3)大肠杆菌摇床培养
部分同学在老师指导下已完成
2.2.4 DNA的提取及大肠杆菌感受态细胞的制备
1)DNA的提取
1、向10ml离心管中预先加入4mlCTAB抽提液及相应量的β-巯基乙醇(2%-3%),65℃预热;
2、取适量的植物甘薯嫩叶用液氮充分磨成粉末,转入该10ml离心管中,迅速混匀。
3、于65℃水浴45min,中途间隔(轻柔)颠倒混匀三次或四次; 4、冷至室温后加入等体积(4ml)氯仿,轻柔颠倒混匀使乳化10min; 5、10000转/分离心10min(18-20℃); 6、吸取上清3-4ml于另一干净的10ml离心管中;
7、吸取上清加入与上清液等体积且已于-20℃预冷的异丙醇,颠倒混匀,室温放置15分钟至白色絮状沉淀出现;
8、用玻璃钩子挑出DNA,放入盛有1ml 75%乙醇的1.5ml Eppendorf管中 9、用75%乙醇中漂洗DNA沉淀,用Tip头吸干乙醇; 10、用1ml 75%乙醇再漂洗一次; 11、用无水乙醇再漂洗一次;
12、沉淀于室温或60℃以下的恒温箱中干燥片刻至刚出现半透明; 13、用500μl TE溶解沉淀,可用65℃水浴助溶,得DNA粗提物。 14、取10μl DNA电泳检查DNA的质量; 2)大肠杆菌感受态细胞的制备
1.将1ml过夜培养菌液移入50mlLB培养基中,37℃震荡培养至OD值为0.3-0.6 2.取培养液3 ml转入10ml无菌离心管中,于4℃4000r/min离心10min,去上清
3.沉淀用3ml预冷的0.1MCaCl2悬浮,与冰上放置30分钟; 4. 4℃,4000r/min离心10min,去上清;
5.沉淀用600μl冰冷的0.1mo1/L CaCl2溶液,小心悬浮细胞 6.分装3管,每管200μl ,冰上放置30分钟
2.2.5连接产物的转化、筛选及PCR检测
1.将10μl DNA的连接物加入一管感受态细胞中,混匀后放置冰上30分种; 2.42℃水浴中热激恰恰90sec,迅速取出立即放于冰上2min,室温下放置3-5min; 3.加入800 ?l 37℃预热的LB液体培养基,混匀后37℃ 180 rpm培养0.5h 4.4000 rpm离心10min,去800 ?l 上清液,将剩余的200 ?l 菌液混匀; 5.用烧烤过的涂布棒将100?l的菌液涂布于加相应抗生素的LB固体培养基涂匀,共2个
6.置于37℃恒温箱中培养
2.2.6 连接产物的筛选及PCR检测
1.选取平板上合适菌落,标记备用(共4个)
2.用10μl移液器枪头对准所选菌落刮取,置于装有1ml溶液的EP管中 3.将EP管进行摇床培养 4,PCR检测
3.实验结果与分析
3.1甘薯RNA的提取及检测+反转录
(初) 图1-1 总RNA的电泳图
图1-2 总RNA的电泳图(末)
结果分析:RNA极易被RNA酶降解,而RNA酶在自然界中广泛而丰富的存在,因此要取得本次实验的成功关键之处在于严格防止RNA酶的污染。此外,为了达到更佳的效果,实验选用的材料是甘薯嫩叶,因为其RNA含量丰富,但实验中能否研磨充分,也会对实验结果造成影响。从RNA电泳的结果来看,我们组在该次实验中较好地做到了这两点,因此获得的条带不仅区分度好,亮度也高。
在实验中共进行了两次紫外检测,首次检测是在预期时间后,但发现RNA条带跑的不是很开(如图1-1),分析原因是配制琼脂糖凝胶时胶浓度比期望浓度大,致使RNA迁移速率减慢,因而电泳时间相对延长。由于在电场中核酸分子的迁移速率取决于分子量大小和空间构型,沉降系数大的RNA跑得慢,故从上到下的条带分别代表28S、18S、5.8S(如图1-2)。从电泳获得的28S和18S两条主带的亮度来看,28S和18S RNA比值约为2:1,符合一般真核细胞RNA比值。
3.2PCR扩增adk基因核心片段
图2 PCR扩增adk基因的电泳图
结果分析:上次实验中,我们对获得的甘薯RNA进行了反转录,获得cDNA。本次实验利用上次实验获得的cDNA进行PCR,所用的10×PCR buffer、taq是北京普博欣公司生产,而引物1、引物2系华大公司生产(1、2组),其他四组用其他公司生产的试剂盒。从扩增结果来看,效果均不错(1-4组扩增的是adk基因,5、6组扩增的是adk核心片段,故结果有所差异)。通过与Marker跑出的条带对比,扩增的目的基因在1000~750 bp之间(Marker各条带从上到下分别表示2000、1000、750、500、250、100,后面3个不太明显)。
本次实验每个组共做了2个50 μL反应体系,但待加完所有试剂后,很多体系的体积明显不同,分析原因可能是在操作过程中使用移液枪出现问题,或是移液枪本身有误差。
3.3目的基因片段的回收、连接
上次实验我们扩增到了甘薯adk目的基因,并进行了电泳,得到了单一目的DNA
条带,本次实验将该目的DNA条带切下,进行胶回收和T载体连接。实验进行顺利。根据时间安排,本次连接过夜,是连接更加完全。
3.4DNA的提取、大肠杆菌感受态细胞的制备、连接产物的转化 3.4.1DNA的提取
图4-1 提取DNA结果图
图4-2 提取DNA的电泳图
结果分析:本次提取DNA使用的材料仍是甘薯,所用植物材料的量和研磨是否充分是影响获得DNA量多少的两个主要方面,与其他组相比,我们组提取的DNA量比较充足(如图4-1所示)。将此DNA沉淀溶解后进行琼脂糖凝胶电泳,得到3条清晰可区分的带,从上向下依次代表蛋白质等大分子杂质、DNA、RNA(如图4-2所示),较其他组而言,我们组DNA条带亮度高,说明提取的DNA量多。RNA分带不明显,说明有部分降解,但未被降解完全。
3.5连接产物的筛选及PCR检测
图5-1 连接转化后的E.Coli平板
图5-2 PCR菌检图