《化学信息学》课程总结
姓名:段小娜 学号:2012210715
《化学信息学》是一门应用信息学的方法解决化学问题的学科,最主要的是就化学问题来获取相关的、高质量的信息。它涵盖不同的领域,就目前而言还没有很深的体会。在学习这门课程之前就已经想到这门课会教授一些关于检索文献的方法,因为文献检索是科研工作者获取信息的重要来源,也是重要的依据,同时文献检索有一定的可学性。因此,可以狭义地认为《化学信息学》是一门“文献学”。
21世纪是信息的时代,就文献而言,每年的文献数量迅猛增加,文献的形式也是伴随着多样化的过程,并且电子文献与网络检索的普及,使得一个科研工作者获取信息的途径越来越多,可选择的信息量也越来越大,但同时也面对着信息的泛滥所引起的一系列的问题。据美国科学基金会统计,一个科学研究人员花费在查找和消化学术资料上的时间需占全部科研时间的51%,计划思考占8%,实验研究占32%,书面总结占9%,可见从事科研工作获取高效的信息并且对信息的消化的重要性。就信息方面的问题,对于一个科研工作者,需要有几方面的能力:1、快速获取相关的高质量信息的能力。2、确定一个好的研究方向的能力。3、及时跟踪特定研究方向的能力。4、管理信息即所检索到的文献的能力。5、整理研究结果,论文写作的能力。6、发表论文,选择合适的期刊。在这门课中对这几方面都有所涉及,其中重点还是对于信息的获取,即文献的检索,同时也一直贯穿着一个科研工作者的工作概况。所以在这门课中,除了获得了一些关于化
学信息学和文献的基础知识外,我主要的收获是如何快速获取相关的信息(文献检索的方法)以及获取信息的常用渠道(常用的期刊、数据库等),同时对一个科研工作者的工作有了更深刻地了解。
《化学信息学》更多的是为科研服务,因此,对于在这门课中学习到的东西,我也将从一个科研工作者应该具备什么样的能力出发来一一阐述并对几种常用的检索工具进行进一步的分析和比较。 一、如何获取相关的高质量的信息
所谓“相关的”,就是与研究的主题相对应的信息或文献。“高质量的”就是具有参考价值的,对研究有指导意义的文献,这其中涉及到文献本身的影响力(可参考文献被引用的情况)、作者的影响力、出版期刊的影响力等。 (一)关于获取信息的渠道。 (1)科技图书
除了翻阅纸质版的书籍,如辞典、手册、工具书及参考书之外,还可以阅览电子版的图书以及在电子图书馆上查阅相关的信息。具体的一些电子图书馆的网址见PPT,如美国国会图书馆http://www.loc.gov 。 (2)期刊
根据内容可以将期刊分为原始性、检索性、评述性、消息性和科普性期刊。在化学化工领域常用的期刊有:1.综述性自然科学期刊,英国Nature,美国Science,美国科学院院刊PNAS,中国科学B (Science in China B),科学通报 (Chinese Science Bulletin)2. 综合性化学期刊,
美国化学会志(Journal of American Chemical society,),(德国)应用化学(Angewande Chemie Internatinal Edition),自然化学(Nature Chemistry),化学科学(Chemical Science),化学通讯(Chemical Communications)3.我国综合性的化学期刊,化学学报 (Acta Chemical Sinica),化学通报 (Chemistry),高等学校化学学报 (Chemical Journal of Chinese University)。
另外还有一些可以利用的全文数据库:美国化学会期刊全文数据库(http://pubs.acs.org/)、英国皇家化学会(RSC)期刊全文数据库(http://www.rsc.org/)、爱思维尔出版社期刊全文数据库 Elsevier ScienceDirect
(
http://www.sciencedirect.com/
、
http://www.elsevier.com/wps/find/journal_browse.cws_home)、Wiley InterScience全文数据库(http://onlinelibrary.wiley.com/)、SpringerLink施普林格全文数据库(http://www.springerlink.com/)、中国期刊全文数据库(http://epub.cnki.net/)。
对于这些信息获取的渠道,因为没有真正的用到过,所以,对于各自的适用领域以及使用的具体细节不是特别清楚,比较熟悉的还是具体讲解过的几种检索工具:Scifinder、Resxys、Web of Science。 (二)检索方法
(1)直接法:就是根据研究的课题通过浏览原始文献的方式直接查询原始文献。
(2)追溯法:依据文献所附的参考文献为线索查找文献的方法。 (3)工具法:利用文摘和索引等检索工具进行检索。
在这门课程中主要是通过具体讲解三种检索工具(Scifinder,Reaxys,Web of Science)的使用,即第三种方法的使用,同时也强调了第二种方法的重要性。
通过追溯法来进行检索,也就是根据一篇文章的参考文献来检索该文献所引用的文献,通过此方式可以了解某个课题或与之相关的理论等的发展历程,也可以检索引用该文章的文献,据此也可以了解该文章的影响力以及该课题发展的现状。在我们所介绍的三中检索工具中,Scifinder和Web of Science都可以检索到一篇文章被引用的情况以及其本身引用的情况。
使用工具检索时,常使用主题、作者、日期名称、结构式等进行检索。使用Scifinder进行检索可以使用主题、作者、单位、物质及结构式等方式,并且兼并二次检索的功能,通过Analyze , Refine, Categorize功能对不同的杂志、文献类型、出版机构、数据库以及不同领域等进行进一步筛选。在Reaxys中主要是使用关键字、结构式或者二者的结合进行检索,并且也具有二次筛选的功能。使用Web of science也可以使用主题、作者、日期等进行检索,也可以根据被引用的情况进行检索,它的另外一个特点是可以使用多个关键词,同时使用排除的方式进行检索,也同时可以使用不同的限定条件如不同的领域进行筛选。
(三)对于信息质量的评估
对于一篇文章的质量除了与是否与所研究的课题相关有关外,还主要与该文章的引用率、书写作者以及论文发表期刊的位置等有
关,为了获得一篇高质量的文章,除了考虑主题外,还可以通过引用率、作者和发表期刊的位置进行检索。所以,对于检索到的文献可以对其质量进行评估,其引用率在Web of science和Reaxys中都可以得到。在某个领域比较权威的科学家以及某期刊对某个领域的偏好都可以通过检索得到。如使用Web of science可以分析在某个领域某个科研工作者或出版物发表和出版论文的情况。 二、确定一个好的研究方向
对于科研工作者来讲,其选题应该符合几项原则:1.要具有创新性和先进性。2.要注意实际性。3.要考虑科学上的可行性。4.要抓住关键性的时机。
在常用的检索工具中,Web of science对于科研工作者的选题以及获得一个良好的idea是非常有价值的。因为它可以使科研工作者对于研究动态以及不同学科间的联系有很好地把握。 三、及时跟踪特定的研究方向
可以通过确定跟踪浏览一些重要期刊来跟踪自己的研究方向,时刻关注研究动态,如:权威性刊物,如J. Am. Chem. Soc.有关专业刊物,如J. Org. Chem.消息性刊物,如C&E News, Science News,科普性刊物,如Scientific American。 四、管理文献的能力
可以有条不紊地管理所检索到的文献有利于之后的查找以及对信息的把握。
五、整理研究结果,论文写作的能力