六、大肠杆菌感受态细胞的制备及目的DNA的转化
(一)仪器
1.小型高速离心机 2.恒温摇床 3.恒温培养箱 4.‐20℃冰箱 5.恒温水浴器 6.超净工作台 7.高压灭菌锅 (二)材料 1.氨苄青霉素 2.大肠杆菌DH5a 3.连接产物 4.离心管
5.枪头、微量移液器 6.试管、培养皿、三角瓶 (三)试剂
LB 培养基(根据需要确定配制的量):
10g/L 胰蛋白胨,5g/L酵母提取物,10g/L NaCl,加水至1000ml,高压灭菌,保存在室温。 氨苄青霉素:
用去离子水配成100mg/ml的储存液,过滤除菌,-20℃分装保存。 卡那霉素:
用去离子水配成100mg/ml的储存液,过滤除菌,-20℃分装保存 无抗生素LB琼脂糖平板培养基(根据需要确定配制的量):
10g/l 胰蛋白胨,5g/l酵母提取物,10g/l NaCl,15g/l 琼脂粉,加水至1000ml,高压灭菌;铺平板,冷却后在37℃培养24小时,保存在室温。
含有抗生素LB琼脂糖平板培养基(根据需要确定配制的量):
10g/l 胰蛋白胨,5g/l酵母提取物,10g/l NaCl,15g/l 琼脂粉,加水至1000ml,高压灭菌;当培养基降温至50℃左右,加入终浓度为100μg/ml 的氨苄青霉素或50μg/ml卡那霉素,并铺平板,冷却后在37℃培养24小时,保存在室温。
0.1 M CaCl2(根据需要确定配制的量):
11.099克溶解在1000ml灭菌水中,0.22μm滤器过滤除菌。氯化钙分子量为:110.99。 50%甘油:
50ml甘油加入50ml水,混匀,高压灭菌。 其他:
DH5α大肠杆菌,灭菌玻璃平皿若干,接菌环,加250ml LB液体培养基的1000ml灭菌锥形瓶一个,灭菌50ml和500 mL离心管若干,灭菌刻度吸管若干,冰盒,移液器,灭菌移液器吸头,灭菌Eppendorf管等。 (四)实验步骤
1)以接菌环从-70℃保存的高效转化菌种中蘸取少量菌液划无抗生素平板,培养12小时; 2)挑取单菌落接种于5 mL无抗生素LB培养基中,37℃振荡培养过夜;
3)按照1:100接种菌液至250 mL LB培养基中,37℃剧烈振荡培养1.5-2 小时左右,至OD600达0.4-0.6;
4)将菌液冰浴10 分钟,转移至预冷的500 mL离心管中,4℃,4000 rpm离心10 分钟; 5)弃上清,将细菌沉淀重新悬浮于50 mL预冷的0.1 M CaCl2中,冰浴20 分钟,4℃,4000 rpm离心10 分钟;
6)弃尽上清。以12.5 mL(菌液体积的5%)预冷的0.1 M CaCl2溶液重悬细菌沉淀,同时加入等体积预冷的50%甘油水溶液,混匀后按每支50μL在冰上分装,-80℃保存; 注:以上操作全部在无菌条件下进行。
7)取连接产物2μl(在实际操作中,经常需要取全部连接产物)置于冰上; 8)从-80℃冰箱取3管感受态细菌(每管50μl),在冰上融化;
9)将连接产物加入感受态细菌中,混匀,放置冰上20-30分钟;同时做两个对照管
? 受体菌对照:50μl感受态细胞+2μl无菌水 ? 质粒对照:50μl0.1 M CaCl2溶液+2μl连接产物 10)42℃加热90秒,迅速置于冰上1-2分钟;
11)每管加入400-1000μl的无抗生素液体LB培养基,在37℃摇床缓慢摇荡20-60分钟; 12)用<10000rpm离心10秒,弃去大部分上清,留下约50μl并用移液器吹吸重悬细菌; 13)取适量细菌悬液均匀的涂布在带有相应抗性(根据质粒所携带抗生素抗性基因而定)的LB琼脂糖平板上,倒置于37℃培养箱培养12小时以上,出现菌落。
(五)技术要点
1.加入的连接产物体积应该小于感受态细胞体积的5%; 2.42℃热激时,必须要保证温度的准确性;
3.涂布LB平板的菌液量应该根据经验确定。如果连接效率很高,而且所用感受态细菌的效率也很高,则吸取较少量的菌液;反之,可以增加,甚至全部菌液涂布平板。判断的标准:在LB平板上生长密度合适的单菌落;
4.涂布平板之后,在37℃培养的时间不超过12-16小时,否则可能产生卫星菌落; 5.防止其它质粒污染; 6.防止其它细菌污染。
七、质粒DNA的提取及重组子的鉴定
(一)仪器 1.恒温培养箱 2.恒温摇床 3.小型高速离心机 4.高压灭菌锅 5.分光光度计 (二)试剂及材料 1.转化重组子
2.缓冲液A:50mM葡萄糖;10mM EDTA;25mM Tris-HCl,pH8.0。 3.碱溶液:0.2M NaOH; 1%SDS, PH12.5。
4.乙酸缓冲液:3M NaAC;2M乙酸,pH4.8(盐酸调pH)。 5.TE缓冲液:10mM Tris-HCl,pH8.0;1mM EDTA.。
6.RNA酶A溶液:10mg/ml RNA酶 A,用TE配制,100°C煮10分钟,灭活DNA酶。缓慢冷却至室温,10000r/min离心5min,上清于-20°C保存。
7.LB培养基: 10g胰蛋白胨,5g酵母粉,5g NaCl加水至1000ml,用1M NaOH调pH至7.5,高压灭菌。
8.氨苄青霉素:用去离子水配成100mg/ml的储存液,过滤除菌,-20℃分装保存。 9.LA培养基: 在LB培养基中加入终浓度100μg/ml的氨苄青霉素。 10.异丙醇
11.酚-氯仿-异戊醇:25:24:1 12.70%乙醇 13.3M NaAc (三)实验步骤
1) 从转化平皿上挑一克隆接种到LA液体培养基中,37℃震荡培养,待细菌浓度增至OD600=1—1.2时,收获细菌。菌液转到1.5mlEppendorf管中,离心8000rpm,2分钟,弃上清。
2)加100μl缓冲液A,充分混悬细菌。
3)加200μl碱溶液,裂解细菌,反复倒转管5次至溶液清亮,开盖后能拉出丝状粘稠液体。 4)加150μl乙酸缓冲液,反复倒转管5次,混匀,冰浴10分钟。
5)离心10000rpm,5分钟,将上清转移至另一Eppendorf管中。
6)加等体积的酚-l氯仿-异戊醇(25:24:1)混匀,离心10000rpm,1分钟。 7)吸上层水相至另一Eppendorf管中,加等体积的氯仿混匀,离心10000rpm,1分钟。 8)吸上层水相至另一Eppendorf管中,加0.6倍体积的异丙醇,混匀,室温或-20°C,10分钟。
9)离心10000rpm,10分钟,弃上清,加入1ml 70%乙醇。勿混匀,离心10000rpm,5分钟,重复加入1ml 70%乙醇一次,弃上清,干燥箱中干燥。
10)干燥后,加入30μl TE(含RNA酶A 10ul,20μg/ml),使质粒溶解,-20°C保存备用。 11) 取一个灭菌的EP管,依次加入下列试剂
10×限制酶缓冲液2.0ul、重组质粒5.0ul、ddH2O 11.0ul、限制性内切酶2.0ul总体积为20.0ul。
12)将上述试剂轻轻混匀,稍加离心,集中溶液,37°C水浴保温3—4小时。酶切结束时,加入0.5mmol/L EDTA(PH8.0)使终浓度达10mmol/L,以终止反应。 13)质粒DNA的琼脂糖凝胶电泳分析详见实验三。 (四)技术要点
1)每一步都要充分混匀,为获得高产量DNA,第一步需使菌体完全重悬。
2)加入碱溶液后,反复混匀使细菌充分裂解,但需要轻柔,一旦裂解(液体变清亮)必须马上加乙酸缓冲液中和。
3)70%乙醇洗涤时,离心后应小心地将上清倒掉,注意这时DNA沉淀较疏松,易从管壁上脱落。