一切，而注重科学实证的科技界人士却从来没有看到批评者给出任何科学实验根据。这就引起一些科学家的思考：气功外气是否存在？在中华民族几千年的传统中气功为什么能够流传至今？能否用现代科学方法重新认识和诠释气功对人体的意义。因而1998年以中科院理论物理所研究员郭汉英为首的四名中科院的科学家给国务院领导上书，根据“实践是检验真理的唯一标准”这个马克思主义基本观点，建议对‘两个存在’进行实验研究。於是当时的国务院下属人体科学办公室下成立了两个“存在性”检验组，一为：《气功外气存在性检验组》；一为《特异功能存在性检验组》。
1998年秋季在北京西郊宾馆召开了“气功外气存在性检验研讨会”，作者曾荣幸地被邀请报告“气功外气对生物分子构象作用研究”的实验结果，为论证气功外气的存在性提供根据。这个报告后来发表在《人体科学》杂志1998年第8卷第4期上。实验证实气功外气使样品的分子构象发生了某种变化，能否由此结果回答气功外气是否存在的问题呢？2001年作者参加在美国夏威夷召开的东西方关于精神康复的国际交流会，曾在报告中提出：要回答气功外气是否存在，就应该搞清楚“存在性”的定义。作为自然科学家有一个很朴素的逻辑：如果未知事物A能够引起B事物发生改变，而B是公认存在的事物，那么，能说A不存在吗？不存在的东西能引起存在的事物发生改变吗？所以，凡是能引起已经存在的事物发生改变的未知事物也是存在的，人们可以不知道这个事物是什么，但是不能否认它是存在的。按照这个理解，根据实验结果，证明引起生物分子构象改变的气功外气是存
在的。它能改变分子构象是需要能量的，引起变化的方向是和外气发放人的意念有关的，因而可推论：第一，气功外气是一种能量和信息的载体。第二，气功外气是由人体发放出来的，人体没有内气就不会有外气。正如辩证法大师黑格尔指出的“外与内是同一个内容。凡物内面如何，外面的表现也如何。 反之，凡物外面如何，内面也是如何。”【14】（p.289），因而外气的客观性又证明了内气的客观性。人体内之气受人意念调动可以发到体外并作用于其他事物。另外，实验材料是不为人脑意识控制的分子材料, CD谱的改变表明气功师发外气确实对生物分子构象发生了作用, 排除了直接对人体实验时产生自我体验的诱导效应和被试者的心理效应, 从更深层次上确证外气存在的客观性。根据同样的逻辑，气功对蟾蜍心脏搏动影响的实验结果进一步证实气功外气和人体内气的存在性。
2. 气功影响生物大分子构象，是认识所有气功效应的基础。两项研究结果回答了\外气如何与生命机体相作用?\的问题。
我们都知道恩格斯关于生命是蛋白体的存在方式的论述，现代分子生物学研究表明核酸（RNA和DNA）和蛋白质是生命的最基本物质。所有维持生命新陈代谢的有关的生物化学反应是在生物酶的催化作用下进行的。人体内上千种生物酶和对代谢过程起调节作用的激素都是蛋白质（少数RNA具有原始生物酶性质），分别控制体内新陈代谢的各种过程,其中经研究的有350多种。因此可以说蛋白质是一切生命活动调节控制的主要承担者。生命所以娇贵，是因为蛋白质的性质对内外环境十分敏感，温度、压力、体液酸碱度、微量元素、小蛋白分
子、其他生物分子等都在严格的条件下维持动态平衡，任何偏离都会引起蛋白质分子构象的变化。 每种生化过程的启动还和DNA链条上被称为底物的特殊片段有关。只有当生物酶与底物在一定的结合位点正确地结合，该生化反应才能启动、进行。各种生物酶就好像一把把钥匙，而各种对应的DNA片段底物就好像一把把锁。一把钥匙开一把锁，某种生化过程的正常进行需要把钥匙插在锁孔（结合点）里才能启动。如果生物酶或底物分子的结构在某些病因作用下产生构象变化，就失去了正常的功能，也就引起人的健康问题。就像是钥匙变形了或锁坏了都不能打开锁一样。因此分子构象的改变可以衍生、可以变化出无数种功能和性质的改变。最典型的例子是人体内糖代谢的催化酶胰岛素和底物结合时，可能由于一方分子构象的改变而造成糖分解反应不能正常启动，糖在血液内大大超标就是糖尿病。因此我们以蛋白质分子模型作为气功作用的样品，可以反映“气”与生命机体作用的分子机理。
研究气功外气对生命体的作用首先就应探讨外气对蛋白质分子如何作用。生物分子结构复杂，具有多层次多元的三维立体结构，分子构象是其高级结构， 如果假设气功外气破坏或改组蛋白质分子, 就会涉及分子内旧键断裂, 新键生成。化学键改组往往需要较大能量,而且此过程通常不是简单可逆的, 事实上一般练功人进入气功态和退出气功态的过程极快, 身体没有大的变化, 因此无论从热力学还是从动力学看, \气\使体内蛋白质分子破坏或改组的可能性是不大的. 但是假设在外气作用下蛋白质分子中某些可旋转的化学键和肽面调整方
向, 从而改变分子构象需要的能量就相对较少。就像要拆一座房子破坏其整体结构要费很大功夫，而把门窗打开或关闭就省力多了。从能量匹配性看，气功有可能改变的结构层次就是分子构象。因此, 研究气功外气对蛋白质等生物分子构象的作用是研究气功对人体作用的根本基础。如前所述，气功对心脏搏动的影响也是基于对分子构象的作用。
气功对分子构象或心脏搏动的影响，可引申到医学气功的机理，即人体生物分子在内气锻炼或外气作用下可发生分子构象的变化，从而引起一系列生理或功能反应。 人体经气功锻炼调动内气，只要坚持长期习练气功可矫正体内发生异常的生物分子构象，使不正常结构转变为正常，从而恢复生物功能及活性，达到康复的效果。没有疾病的人通过气功锻炼可以使体内分子更加有序化, 产生负熵, 因而强身健体、延缓衰老甚至长寿。改善和纠正分子构象能够治病，可以健身，这可能是气功医疗的基本根据；使生物分子构象发生改变, 是外气和内气与生命机体作用的根本途径之一。作者于2008年在《气功是老年人养生的好方法》【15】一文中提出了关于气功医疗的科学假设：从分子结构和功能相关联的观点出发，我们假设气功医疗可能是从分子水平进行纠正和调治的方法，因而可以把气功医疗纳入分子医学范畴，作为分子医学的一个分支进行现代科学的研究。作者盼望开展进一步的实验研究对此假设的科学性深入探索。 4. 调动生命之气，意识起主导作用。
我们的实验发现分子构象的双向变化是可以由气功师意念调节的。这
个现象的发现如上述有点儿偶然，后来就有意识的做“意念控制变化方向”的实验。在实验之前要求气功师对分子构象有基本常识，比如用分子模拟的彩色构象图片或分子模型帮助其建立感性和形象认识；在实验中和气功师一起设计发功时的“想法”：如专注和反复想“更加有序---螺旋增加”，或“更加无序---螺旋减少，无规线团增加”等。有人还用了“液体膨胀”（相当于更加无序）、“液体收缩”（相当于更加有序）；或直接想象波谱上的 “峰值增加”、“减少”。 我们以CD谱峰高的改变D[q]观察气功师用不同的想法（意念）发功时的变化。气功师发功时想“样品更加有序”时, D[q]为正号, 想“无序”时, D[q]为负号。 有趣的是对同一样品连续用同样发功方法但想法不同时, D[q]结果得到相反符号,表明外气引起的改变随意念相反可使其变化方向发生逆转。在气功对蛙心的实验中，气功师发功时用“加强或减弱跳动”、“加快或减慢跳动”的意念，同样得到与想法一致的结果。 实验给出的“想法”即意念和实验谱图变化之间正相关的结果，提出了一个严肃的问题：人只要“想”，不需要“行为”直接作用，就能使客体（人或事物）的状态、性质或功能发生改变吗？气功界常说的“意到气到”，意念指挥气作用于客体，引起变化。分子内的原子通过化学键连接，具有一定键能，所以能改变分子构象的外部因子必须具有一定能量；分子构象能双向改变又应该具有信息，因而“气”的性质最起码是具有能量并携带信息的。但是“意念”和“气”是什么关系？意念是传递信息的，它是通过“气”作用于客体，还是自身直接作用于客体的？辩证唯物主义认为物质为第一性，意识是第二性