表1的数据,采用芸豆荚IVD统计程序对数据进行以下统计分析。
2、 基础计算
根据文献[1],基础计算结果如下: 表2:检测数据基础统计结果 编号 阳性符合率 阴性符合率 阳性预期值 阴性预期值 总符合率 数值比 180/188 200/205 180/185 200/208 380/393 百分率(95%可信区间) 95.74% (91.79%~98.15%) 97.56% (94.40%~99.20%) 97.30% (93.81%~99.12%) 96.15% (92.56%~98.33%) 96.69% (94.41%~98.23%) 注:结果和MedCalc相同,95%可信限计算方法:二项分布法(推荐)
3、 卡方检验(McNemar检验)
根据文献[1,2]采用配对卡方检验,建立检验假设: H0:两种试剂总体检验符合率相同,H1:两种试剂总体检验符合率不同,α=0.05 计算结果如下: 表3 卡方检验(McNemar检验)统计结果 编号 检验方法 卡方值 概率值P 检验结果 统计值 精确概率法 无 0.5811 P>=0.05,接受H0,两种试剂总体检验符合率相同 注:依据不同的检验方法,结果和SPSS、SAS等相同
4、 Kappa一致性检验
根据文献[1,3],计算Kappa值及标准误;对Kappa建立检验检验假设: H0:K=0,Kappa值来自0的总体,H1:K>0,Kappa值来自非0的总体,α=0.05 计算结果如下: 表4 Kappa一致性检验统计结果 编号 Kappa值 标准误Se(K) 95%可信区间 标准误Se0(K) 检验值Z 统计值 0.9337 , 一致性较好 0.0181 0.8982~0.9691 0.050 Z=18.5115,概率值P=0.0000 检验结果 注:结果和SAS,MedCalc相同 P<0.05,拒绝H0,Kappa值来自非0的总体
附:芸豆荚IVD统计程序统计学方法说明
计算方法均来源于经典的文献或统计学软件,结果和SPSS,SAS、MedCalc等软件相同,主要计算方法如下: a) 基础计算: 按表1的代号:
阳性符合率=A/(A+C)×100% 阴性符合率=D/(A+B) ×100% 阳性预期值=D/(B+D) ×100% 阴性预期值=D/(C+D) ×100%
总符合率=A+D/(A+B+C+D) ×100%
率的95%可信区间采用二项分布法计算(同MedCalc程序),公式如下: , ,式中a为数值比分子,n为数值比分母。 b) 卡方检验
依据参考文献[1,2],精确概率法检验(同SPSS程序)计算方法:X2= ×2,自由度v=1。 ,再根据卡方X2值和卡方分布函数计算出概率值P。
c) Kappa一致性检验(结果同SAS,MedCalc等程序)
依据参考文献3,对于行为i=2,列为j=2排列的数据:计算公式如下: 一致性系数Kappa= 式中 ;
用于估计95%可信限的标准误计算公式如下:Se(k)= ,式中:
Kappa值的95%可信区间=Kappa+/-1.96Se(k)。
Kappa值非0检验,即检验Kappa值是否来自为0的总体,即Kappa值的差异是否由抽样误差造成的,计算公式如下:Z=Kappa/Se0 (k),式中
Se0(k)= ,再根据Z值和标准正态分布函数,计算出概率值P。
参考文献
1、 颜红主编. 医学统计学(第2版),人民卫生出版社. 2010
2、 刘一斑秀,刘钧. 配对四格表资料差别检验的精确概率方法,南京大学学报. 1998, 34(5):627-631
3、 Joseph L. Fleiss. Statistical Methods For Rates And Proportions - 3Ed, 2003,598-607 4、 体外诊断试剂临床研究技术指导原则(国食药监械[2007]240号),国家仪器药品监督管理局发布
5、 人类免疫缺陷病毒检测试剂临床研究注册技术审查指导原则,国家仪器药品监督管理局发布
6、 病原体特异性M型免疫球蛋白定性检测试剂注册技术审查指导原则,国家仪器药品监督管理局发布
7、 流行性感冒病毒检测试剂注册申报资料指导原则,国家仪器药品监督管理局发布
芸豆荚IVD统计程序定量统计方法和结果
(发现图片无法贴上来) 1、检测数据
对照试剂和考核试剂对样本进行配对检测后,将配对检测结果输入附表1,参照体外诊断试剂临床研究技术指导原则(国食药监械[2007]240号),肿瘤标志物类定量检测试剂注册申报资料指导原则,人类免疫缺陷病毒检测试剂临床研究注册技术审查指导原则,病原体特异性M型免疫球蛋白定性检测试剂注册技术审查指导原则等法规性文件,根据附表1的数据,采用芸豆荚IVD统计程序对数据进行以下统计分析。
2、基础计算
计算试剂及差值的均值、标准差、最大值、最小值、偏度和峰度,对样本的基本情况进行分析,依据文献[1],计算结果如下: 表1:基础计算结果 编号 均值 标准差 最大值 最小值 偏度 峰度
配对差值组 -8.650 56.641 79.000 -96.000 0.0342 -1.4534
对照组 489.000 175.150 778.000 149.000 -0.1882 -0.5856
考核组 497.650 184.888 874.000 141.000 0.0320 -0.4512
注:结果和SPSS,MedCalc相同
3、数据分布直方图
将检测数据及差值按十等份划分,作直方图,直观显示样本及差值的分布情况:
图1: 对照试剂值分布直方图 图2: 考核试剂值分布直方图 图3: 检测差值分布直方图
4、正态性检验
依据文献[2,3]采用D(D'Agostino)检验进行正态性检验,以进一步选择合适的统计方法,建立假设: H0:数据总体服从正态分布,H1:数据总体服不从正态分布,α=0.05 计算结果如下: 表2:数据差值正态性检验结果: 编号 偏度G1 峰度G2 差 值 Z=0.0710, P=0.9434 Z=1.4162, P=0.1567 对照试剂 Z=-0.3894, P=0.6970 Z=0.7946, P=0.4268 考核试剂 Z=0.0664, P=0.9471 Z=0.6783, P=0.4976 D'Agostino 检验结果 X^2=2.0106, P=0.3659 X^2=0.7830, P=0.6760 X^2=0.4645, P=0.7927 P>=0.05,接受H0,服P>=0.05,接受H0,服P>=0.05,接受H0,服从正态分布 从正态分布 从正态分布 注:依据不同的方法,结果和SPSS,MedCalc相同
5、配对检验
依据文献[1]采用配对T检验进行检验,建立假设:
H0:两种试剂检验结果相同,H1:两种试剂检验结果不同,α=0.05 计算结果如下:
表3:对照试剂和考核试剂配对检验结果 编号 配对t检验 概率值P 结果
注:依据不同的方法,结果和SPSS,MedCalc相同
6、简单线性回归分析和散点图
依据文献[1],以对照试剂为自变量X,考核试剂为应变量Y,计算简单线性回归方程,并计算回归系数b和截距a的标准误和置信区间,并进行检验,建立假设: a) 回归模型F检验和回归系数b的t检验(检验意义相同):
H0:两种试剂无直线关系,H1:两种试剂直线关系成立,α=0.05 b) 截距a的t检验:
H0:截距与0值无显著性差异,H1:截距与0值有显著性差异,α=0.05 计算结果如下:
表4 数据直线回归分析结果 编号 回归检验 SS回 F值 检验结果 系数b检验 t值(b) 系数b Se 检验结果
统计值
588543.72,v=1 173.8316
编号 回归方程 SS剩 概率P
统计值
统计值
t=0.6830,v=19 0.5029
p>=0.05,接受H0,两种试剂检验结果相同
Y=1.0049X+6.2
60942.83,v=18 0.0000
p<0.05,拒绝H0,两种试剂直线关系成立 b=1.0049 13.1845 0.0762
概率P(b) 系数95%CI
0.0000
0.8447~1.1650
p<0.05,拒绝H0,两种试剂直线关系成立
截距a检验 t值(a) 截距a Se 检验结果
a=6.2775 0.1590 39.4748
P>=0.05,接受H0,截距与0值无显著性差异
概率P(a) 截距95%CI
0.8754
-76.6559~89.2
注:结果和SPSS,MedCalc等相同
以对照试剂为自变量(X),考核试剂为应变量(Y),作散点图如下:
图4 两种试剂配对检测散点图
7、相关分析 依据文献[1],采用简单(Pearson)相关方法进行分析,计算相关系数,标准误并进行t检验,建立假设:
H0:两种试剂无直线相关关系,H1:两种试剂直线相关关系成立,α=0.05(本检验和回归系数b检验等价),计算结果如下: 表4 数据相关分析结果 编号 简单相关值r 95% CI t值,概率P 检验结果
注:结果和SPSS,MedCalc相同
8、Bland-Altam分析
依据文献[4],以对照试剂和考核试剂配对检测均值为横度坐标,检测差值为纵坐标,进行分析和作图,结果如下:
表6 Bland-Altam分析基本数据 编号 差值均值 差值标准差 95%界值 界外点数(比率)
计算值 -8.650 56.641
-119.667~102.367 0 (0.00%)
图 5两种试剂配对检测Bland-Altam图
附:芸豆荚IVD统计程序统计学方法说明
计算方法均来源于经典的文献或统计学软件,结果和SPSS,SAS、MedCalc等软件相同,主要计算方法如下: a)基础计算
统计值
r=0.9519;r^2=0.9062 0.8802~0.9811
t=13.1845,v=18 ,P=0.0000
P<0.05,拒绝H0,两种试剂直线相关关系成立