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第13步：功能仿真。
选择Processing->Simulator Tool，窗口如下图所示。选择仿真模式（Simulator mode）为“Functional”，并选择and2gate.vwf文件作为仿真输入（Simulation input）波形文件。点击Generate Functional Simulation Netlist按钮，生成仿真网表。然后点击Start按钮，开始仿真。在仿真完成后，点击Report按钮即可观看仿真的结果，如下图所示。从波形可以看出，程序的逻辑功能是正确的。
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第14步：时序仿真。
再次选择Processing->Simulator Tool，并将仿真模式设为“Timing”，然后点击Start按钮。最后点击Report按钮查看仿真结果，结果如下图。与功能仿真结果图相比较，可以看出时序仿真的输出带有一定的延迟。
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第15步：引脚分配。 在之前的编译过程中，Quartus软件已经自动为设计分配了引脚。而在DE2平台上，FPGA与外部器件的连接是确定的，其连接关系可参看附录A和B。如果选择SW0和SW1分别代表输入信号a和b、LEDG0代表输出信号y，则通过附录B查表可知它们分别对应FPGA的引脚PIN_N25、PIN_N26和PIN_AE22。
选择Assignments->Pins命令，打开引脚规划器（Pin Planner），如下图所示。接着双击信号a的Location栏，在下拉框中选择PIN_N25，其他信号通过相同的办法进行分配。
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第16步：在仿真正确，并锁定自定引脚后，通过按钮对项目再次编译。
第17步：程序下载（配置FPGA）。
用USB连接线连接DE2的USB Blaster端口和电脑即可进行程序的下载。在DE2平台上，可以对FPGA进行两种模式配置：一种是JTAG模式，通过USB Blaster直接配置FPGA，但掉电后，FPGA中的配置内容会丢失，再次上电需要用电脑重新配置；另一种是在AS模式下，通过USB Blaster对DE2平台上的串行配置器件EPCS16进行编程，平台上电后，EPCS16会自动配置FPGA。通过DE2平台上的SW19选择配置模式，SW19置于RUN位置，即选择JTAG模式配置；置于PROG位置，则选择AS模式对EPCS16进行编程。
第18步：JTAG模式配置。
1)用USB连接线连接DE2和电脑，将SW19置于RUN位置。选择Tools->Programmer命令，打开配置窗口，如下图所示。
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2)图中第一列显示“No Hardware”，说明未指定硬件设备，单击Hardware Setup按钮，打开硬件设置窗口，如下图所示。双击列表框中的USB-Blaster，然后点击Close按钮，完成硬件设置。
3)从下图可以看出，硬件已经设置完成，而且待配置的文件也已经在文件列表中。然后选中Program/Config选项，单击Start按钮，开始编程。编程结束后，即可在DE2上验证，将SW0和SW1置于1的位置，可以看到LEDG0灯亮。