湖泊沼泽化演替示意图
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3.4物种锐减
任何一个物种的非正常灭绝都是无可挽回的损失。研究表明，每消灭一种植物，就会有10～30种依附于它的其它植物、昆虫和高等动物随后覆灭。上世纪60年代，太湖有鱼类106种，现存鱼类仅60～70种，洄游性鱼类几乎绝迹；底栖动物中螺、蚌等大型软体动物减少，浮游动物中大型的枝角类、桡足类种群数量减少；太湖水生高等植物分布面积已经减少了126平方千米，分布范围大幅度缩减，群落组成趋于简单，沿湖岸大型挺水植物逐渐消失。
国家重点保护一级野生植物——莼菜
3.5岸线开发隐患
太湖岸线资源开发利用由来已久，自20世纪50～70年代，环太
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湖地区就兴起了大规模的围湖垦殖，太湖共被围垦水面约160平方千米。随着太湖周边城市建设规模扩大、交通设施建设速度加快以及开发旅游等，部分建设项目的类型也由原来的道路、生态整治（湿地、生态防护带）等公益型工程为主，拓展到建跨（穿）湖公路、游艇码头、市政景观和宾馆房产等。
建设项目对太湖水域和岸线的占用，减少了太湖洪水调蓄面积，削弱了太湖防洪安全和水资源有效配置能力；开发利用建设项目与防洪安全、岸堤稳定的矛盾日益突出；围垦养殖、旅游度假等人类活动的增加，产生的废污水的排放，加剧了太湖湖区水质污染和水体富营养化的趋势。城市建设对太湖岸线保护带来的压力日益增加，如何解决开发建设不当和保护不够的问题，需要引起重视。
苏州东山环山公路
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3.6植被破坏
由于历史的原因，多数太湖周围的自然山体受到过开发性建设的影响，山体自然植被遭到严重破坏。一个个开山采石形成的宕口，像一块块伤疤刻在秀丽的山体上，不但自然景观遭到破坏，而且崩塌、滑坡等地质灾害经常发生；部分山体由于开挖时间过长，长时间暴露在外，已引起部分水土流失，风沙泥石流入湖中，直接影响到湖泊寿命的长短。目前这些裸露山体虽然多数已经复垦、复绿，但要完全恢复原生态环境还需要一个长期的过程。
苏州吴中区藏书花岗石料厂矿山地质环境治理项目
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4太湖的保护与修复
4.1积极践行
水是生命之源，生产之要，生态之基，保护太湖就是保护我们赖以生存发展的美好家园。
根据中央机构编制委员会办公室《关于设立江苏省太湖水污染防治办公室的批复》（中央编办复字[2009]65号），设立省太湖水污染防治办公室（简称省太湖办），为省政府派出机构，正厅级建制，经省政府授权，统一履行全省范围内太湖水污染防治工作综合监管职责。苏州市人民政府2010年4月12日设立了苏州市太湖流域水污染防治办公室。“太湖办”成为有效的流域管理机构，增强了跨地区多部门的太湖流域水污染防治工作的组织、协调和监督，有效的解决了市县交界处的水污染防治边缘化问题。
省太湖办的“江苏省太湖水污染防治信息管理平台”
1996年6月14日江苏省第八届人民代表大会常务委员会第二十一次会议通过了《江苏省太湖水污染防治条例》，同年10月1日起
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